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张保红
作品数:
6
被引量:15
H指数:3
供职机构:
中国科学院上海生命科学研究院生物化学研究所
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
丁达夫
中国科学院上海生命科学研究院生...
汤海旭
中国科学院上海生命科学研究院生...
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机构
4篇
中国科学院上...
1篇
中国科学院
作者
4篇
张保红
3篇
汤海旭
3篇
丁达夫
传媒
3篇
生物物理学报
1篇
科学
年份
3篇
1995
1篇
1993
共
6
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一种快速和优质的蛋白质结构刚体叠加方法
被引量:1
1995年
统计了110族同源蛋白质的多重结构联配结果,得到了局部环境依赖的氨基酸相似分数表。按此表可实施快速和优质的蛋白质结构刚性叠加,用于蛋白质工程。跟目前最好的遗传算法比较,此法可达到相同的品质(尽可能多的拓扑等价残基对和尽可能小的均方根距离),但CPU时间降了1个到2个数量级,对大蛋白更为明显。
张保红
丁达夫
汤海旭
关键词:
蛋白
蛋白质折叠的物理基础:热力学的还是动力学的
1995年
生物组织具有数千种蛋白。它们负责催化和调节生化反应,输运分子,加工视觉信息,利用光合作用的光能,充当激素的受体和免疫系统的抗体;它们又是皮肤、头发和腱的结构基础。蛋白质仅有20种 L 型的氨基酸组成,怎么会具有如此繁多的功能呢?现在知道,这是由它们的多肽链折叠成特定三维结构来实现的。
丁达夫
汤海旭
张保红
关键词:
蛋白质折叠
分子伴侣
热力学
动力学
基于结构比较的蛋白质模建系统及其评估
被引量:6
1995年
对蛋白质三维结构的同源模建的所有关键模块作了详细研究后,现已整合成蛋白质结构模建的软件系统PMODELLING。它分主链模建和侧链安装两部分,共七个模块组成。经11族同源蛋白的模建实验的回顾性检表明,与目前流行的商品软件相比,具有操作自动化,模建精度高和运行时间少的优点。文中还对蝮蛇蛇毒磷酯酶,细胞因子受体CD40的配体gp39,小鼠巨细胞蛋白酶和人白介素13等至今未知结构的蛋白作了预测性模建。
丁达夫
汤海旭
张保红
关键词:
蛋白
蛋白质结构成对比较的新方法
被引量:5
1993年
介绍一种蛋白质三维结构的快速比较方法.此方法毋需初始联配,而能自动寻找和智能迭代.利用本程序对珠蛋白、丝氨酸蛋白酶、天冬氨酸蛋白酶、钙结合蛋白和溶菌酶作了系统的结构比较,取得了满意的结果.本文也讨论了衡量联配结果好坏的要素问题.
张保红
丁达夫
关键词:
拓扑等价
蛋白
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