张婷
- 作品数:10 被引量:37H指数:4
- 供职机构:大连海洋大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金辽宁省教育厅高等学校科学研究项目辽宁省教育厅资助项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生更多>>
- 富含海带岩藻聚糖硫酸酯的调味料制备方法
- 本发明提供一种富含海带岩藻聚糖硫酸酯的调味料制备方法,有如下步骤:a.清洗海带并脱腥;b.将海带破碎成粒径不大于20μm的颗粒,热水浸提2~4小时,过滤取滤液;c.对滤液离心除渣,离心速率为6800~7200转/分;d....
- 汪秋宽何云海陈勇徐玲张婷史永富汪涛
- 文献传递
- 盐藻小G蛋白基因(DsRab)的克隆及在高盐胁迫下的表达分析被引量:5
- 2013年
- 采用RT-PCR和RACE技术扩增了杜氏盐藻小G蛋白基因cDNA全长序列(GenBank Accession No.JN989548),命名为DsRab,对其进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR方法检测盐胁迫下该基因的表达情况。结果表明,DsRab基因的cDNA全长为1 299 bp,开放阅读框(ORF)为612 bp,编码203个氨基酸,5'非编码区78 bp,3'非编码区609 bp;保守性结构域分析可知编码的小G蛋白有4个GTP/GDP保守结构域,1个效应区、1个羧基端的半胱氨酸结构域和5个Rab亚家族共有的结构域;二级结构预测表明该蛋白有32.02%的α-螺旋,23.65%的伸展片段,44.33%的自由卷曲,三维建模成功;比对分析发现DsRab蛋白与多种生物的Ypt/Rab的氨基酸序列具有较高的同源性。荧光定量PCR结果表明,盐藻在高盐(3.0 mol/L)胁迫下,DsRab基因表达量显著上调,1 h后表达量达到最大值,为正常培养下对照组(0 h)的4.9倍,差异极显著(P<0.01)。
- 余祝君柴晓杰张晓琳张婷薛飞
- 关键词:杜氏盐藻RACE技术生物信息学荧光定量PCR
- VEGFR-2与抑制剂Sunitinib的分子对接及分子动力学研究被引量:4
- 2012年
- 用分子对接方法研究了VEGFR-2和抑制剂Sunitinib的相互作用模式,并对其复合物进行了10 ns的分子动力学(Molecular Dynamics,MD)模拟.结果表明,抑制剂Sunitinib能与VEGFR-2中位于活性空腔的Glu885,Ile888,His1026,Asp1028,Asp1046五个氨基酸残基形成疏水作用;另外,VEGFR-2中His1026,Cys1024,Asp1046三个氨基酸残基能与Sunitinib形成三个作用强度不同的氢键.这些基团之间的相互作用是Sunitinib抑制VEGFR-2活性的关键因素.研究结果可为VEGFR-2抑制剂的结构改良、分子设计、合成提供理论参考,并有助于寻找活性更高、效果更好的抗肿瘤药物.
- 安康柴晓杰薛飞王媛张婷
- 关键词:VEGFR-2SUNITINIB分子对接分子动力学
- 盐生杜氏藻MAPK基因的克隆及表达分析被引量:5
- 2013年
- 克隆盐藻MAPK基因(命名为DsMAPK),为研究盐藻耐盐分子机制奠定基础。采用RT-PCR和RACE技术克隆DsMAPKcDNA全长,对其进行生物信息学分析,并通过QRT-PCR方法检测盐胁迫下该基因的表达情况。DsMAPK的cDNA全长序列为1861bp(GenBank AccessionJQ782412),包含一个开放阅读框,长度为1407bp,编码468个氨基酸;DsMAPK蛋白为亲水性蛋白,α-螺旋和自由卷曲是其蛋白质二级结构的主要结构元件,伸展链散布其中。据氨基酸序列同源性分析表明,DsMAPK和衣藻、团藻的MAPK蛋白具有较近的亲缘关系。盐藻在高盐胁迫下,DsMAPK基因表达显著上调,1h后达到最大值,为正常对照组的5倍,差异极显著(P<0.01)。DsMAPK基因可能在盐藻对盐胁迫的反应中起重要作用,是一种参与盐藻耐盐反应的早期快速反应基因。
- 张婷柴晓杰王媛姜玉声丛玉婷
- 关键词:盐生杜氏藻CDNA生物信息学荧光定量PCR
- 胰蛋白酶抑制剂KSTI3基因新型真核表达载体的构建及其在盐藻中的表达被引量:2
- 2011年
- 应用PCR技术扩增Nos基因、CaMV35S启动子片段和氯霉素抗性基因Cat,并与胰蛋白酶抑制剂KSTI3基因连接,构建真核表达载体pMDCKN-Cat。DNA序列分析结果表明:表达载体中的胰蛋白酶抑制剂KSTI3基因、启动子CaMV35S、终止子Nos和氯霉素抗性基因Cat与已知序列完全一致。采用LiAc/PEG介导法将质粒pMDCKN-Cat转化至盐藻细胞中,通过氯霉素抗性基因筛选和PCR鉴定获得转基因盐藻细胞。经Western blotting检测,在硝酸纤维素膜上出现清晰的条带,分子量为20.1kDa,证明胰蛋白酶抑制剂KSTI3基因在盐藻中得到成功表达。
- 徐文琦柴晓杰张婷代靖宇张晓琳
- 关键词:基因盐藻真核表达载体
- 轮状病毒VP7基因的克隆与表达
- 2011年
- 应用聚合酶链式反应技术(PCR)扩增轮状病毒VP7基因,并将其克隆到pMD18-T simple载体上,对重组子进行PCR检测和限制性内切酶分析,并测定DNA全序列。结果显示,克隆片段全长为981 bp。将轮状病毒VP7基因定向的克隆到原核表达载体pET-32a启动子下游,构建原核表达载体pET-32aVP7。将质粒pET-32aVP7转化Transetta表达菌株进行诱导表达,裂解菌体细胞抽提蛋白质进行SDS-PAGE。结果表明,轮状病毒壳蛋白VP7基因在Transetta表达菌株内得到成功表达。
- 柴晓杰王晓庆张婷代靖宇
- 关键词:轮状病毒PCR克隆
- 盐藻促有丝分裂活化蛋白激酶基因DsMAPK的克隆与表达
- 盐藻(Dunaliella salina)是研究植物耐盐机制的重要模式生物,而MAPK基因在植物耐盐分子途径中起重要作用。本文通过RT-PCR和RACE技术克隆了盐藻MAPK基因,将其命名为DsMAPK,利用荧光定量PC...
- 张婷
- 关键词:盐藻有丝分裂活化蛋白激酶盐胁迫应答
- 文献传递
- 盐藻CDPK基因的克隆与生物信息学分析被引量:16
- 2013年
- 为了研究CDPK基因的结构和功能,应用RT-PCR和RACE方法从盐藻Dunaliella salina中克隆得到CDPK基因(GenBank登录号为JQ964113),并对其进行生物信息学分析。结果表明:盐藻CDPK基因的cDNA全长3 052bp。5'-UTR长70bp;开放阅读框长1650bp,编码549个氨基酸;3'-UTR长1332bp。蛋白表现为弱酸性,且稳定、亲水,二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构同源建模成功。亚细胞定位于叶绿体和细胞核中,无跨膜结构域,无信号肽。蛋白序列中存在4个丝氨酸磷酸化位点、4个苏氨酸磷酸化位点和3个酪氨酸磷酸化位点,蛋白激酶结构域在53~331位氨基酸处,蛋白激酶ATP结合域在59~82位氨基酸处,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性域在173~185位氨基酸处,4个EF-hand钙结合域分别在357~385、393~421、429~457、465~493位氨基酸处。进化分析结果表明,克隆的CDPK基因与团藻、衣藻、盐藻Dunaliella tertiolecta的CDPK亲缘关系最近。为进一步研究CDPK基因的功能及探究盐藻耐盐机制的信号转导途径奠定了分子基础。
- 张晓琳柴晓杰张婷余祝君薛飞
- 关键词:盐藻CDNA全长生物信息学分析
- 大豆胰蛋白酶抑制剂基因KSTI3在盐藻中的稳定表达
- 应用PCR技术扩增Nos基因、CaMV35S启动子片段和氯霉素抗性基因Cat,并与胰蛋白酶抑制剂基因KSTI3连接,构建真核表达载体pMDCKN-Cat。DNA序列分析结果表明:表达载体中的胰蛋白酶抑制剂KSTI3基因、...
- 柴晓杰徐文琦张婷薛飞陈慧黠
- 关键词:盐藻真核表达载体
- 文献传递
- 盐藻新基因DsSTPK的克隆及生物信息学分析被引量:13
- 2012年
- 采用RT-PCR和RACE技术克隆了杜氏盐藻DsSTPK的1种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶基因(GenBank accession No.JN625213),命名为DsSTPK,并对其进行了生物信息学分析.结果表明,盐藻DsSTPK基因的cDNA全长为3 129 bp,可阅读框为2 184 bp,编码727个氨基酸.该蛋白为亲水性蛋白,无信号肽,无跨膜区域,为非跨膜蛋白,且定位于细胞质基质,二级结构的主要元件为无规卷曲和α螺旋,三维建模成功,在167~190位有1个蛋白激酶的ATP结合区、293~305位1个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性区,存在多个潜在的磷酸化位点.进一步的进化分析表明,其与衣藻、团藻亲缘关系最近.这些研究结果为进一步阐明DsSTPK的功能及作用机制奠定了基础.
- 薛飞柴晓杰余祝君张晓琳张婷
- 关键词:杜氏盐藻全长CDNA生物信息学分析