张棋麟
- 作品数：8 被引量：78H指数：4
- 供职机构：南京大学生命科学学院演化发育生物学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生矿业工程更多>>
- 基于新一代测序技术的昆虫转录组学研究进展被引量：42
- 2013年
- 新一代测序技术具有快速、高通量和低成本的特点,为"组学"研究带来了新方法、新方案,正在深刻地改变着当前生物学的研究模式。近年来,新一代测序技术极大促进了昆虫特别是无参考基因组信息昆虫的转录组学研究。自2008年至今,采用新一代测序技术已对7个目的 68种昆虫进行了转录组测序,其中由我国学者完成了6个目的 22种昆虫的转录组测序。目前,昆虫转录组学研究主要集中在基因挖掘、分子标记开发、基因表达分析等方面,为全面揭示昆虫生命活动中相关基因功能、系统发生与进化以及昆虫与其他生物相互作用等奠定了基础。本文总结了当前昆虫转录组学研究的已有成果,分析了其今后的发展趋势,讨论了采用新一代测序技术开展昆虫转录组学研究中存在的诸如研究对象相对局限、测序准确性不够高等不足,并指出开展昆虫转录组学研究时需充分思考所要回答的科学问题,选择合适的研究策略,评估性价比,以及开发转录组信息高效利用的方法等。作者建议未来的研究方向侧重于:(1)大规模开展基于新一代测序技术的昆虫转录组学研究,特别是对其他目以及独特生态环境中的代表性昆虫应予以重点关注;(2)开发昆虫转录组数据存储及分析的软硬件;(3)合理利用新一代测序技术研究昆虫转录组并充分挖掘已测昆虫转录组中的遗传信息。
- 张棋麟袁明龙
- 关键词：昆虫转录组高通量测序基因发掘
- 青海草原毛虫全线粒体基因组序列测定与分析
- 草原毛虫是我国青藏高原的特有昆虫,也是严重为害高寒草地的重大害虫.在本研究中,我们测定并分析了青海草原毛虫(Gynaephora qinghaiensis)的全线粒体基因组.青海草原毛虫样本采集于青海省玉树县巴塘乡(北纬...
- 张棋麟袁明龙
- 关键词：线粒体基因组夜蛾总科毒蛾科分子进化
- 草原毛虫研究现状与展望被引量：27
- 2013年
- 草原毛虫属鳞翅目(Lepidoptera)毒蛾科(Lymantriidae)草原毛虫属(Gynaephora),是我国青藏高原高寒草地的主要害虫之一。该虫不仅取食优良牧草,造成家畜食物短缺,改变草地植物群落结构,加剧草地退化和草地生态环境恶化,而且还会导致家畜中毒,严重阻碍青藏高原畜牧业的健康发展。此外,草原毛虫主要分布于高山或北极地区,为研究生物对严寒、缺氧等极端生态环境的适应性进化机制,提供了一个良好的模式系统。本研究综述了草原毛虫的分类、生物学、生态学及防治等方面的研究现状,并对今后研究重点进行了展望,以期推动我国草原毛虫的基础及应用研究,为该虫的可持续控制提供参考。
- 张棋麟袁明龙
- 关键词：生物学生态学
- 印度谷螟实时荧光定量PCR内参基因的选择被引量：6
- 2016年
- 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)是研究基因表达的重要手段之一,而选择合适的内参基因是获得可靠研究结果的基础.本研究以世界性分布的重要仓储害虫印度谷螟(Plodia interpunctella)为研究对象,旨在筛选出该虫不同发育阶段及不同品系qRT-PCR的最适内参基因,并利用两个独立软件(ge Norm和Norm Finder)对8个备选内参基因的表达稳定性进行了评价.结果表明,不同发育阶段最稳定表达的内参基因为Ef1a,而不同品系最稳定的是b-Actin和Ef1a.利用筛选到的Ef1a,b-Actin及两者组合对目标基因(过氧化物酶POD)进行标准化,印度谷螟不同品系间的POD基因表达量存在显著差异,而以稳定性最差的SD作为内参时,不同品系间POD的相对表达量并无显著差异.这表明,在开展qRT-PCR研究时评价内参基因的稳定性非常必要,且基于筛选到的最佳基因作为内参时,才能准确获得目标基因的相对表达水平.这些结果将有助于更好地研究印度谷螟发育及品系特异相关基因的功能,并为筛选印度谷螟在其他条件下的最适内参基因提供参考.
- 唐培安张棋麟薛昊袁明龙
- 关键词：印度谷螟仓储害虫实时定量PCR基因表达内参基因
- 曲麻莱草原毛虫全线粒体基因组序列测定与分析
- 草原毛虫是我国青藏高原的特有昆虫,也是严重危害高寒草地的重大害虫.在本研究中,我们测定并分析了曲麻莱草原毛虫(Gynaephoraqumalaiensis)的全线粒体基因组.曲麻莱草原毛虫样本采集于青海省玉树州曲麻莱县约...
- 张棋麟袁明龙
- 关键词：线粒体基因组昆虫毒蛾科草原毛虫进化
- 不同海拔环境对草原毛虫线粒体基因表达的影响
- 草原毛虫是我国青藏高原的特有昆虫,也是严重危害高寒草地的重大害虫。由于线粒体是细胞氧利用和能量代谢的中心,因此线粒体基因的结构变异及表达量变化,与其对生态环境的适应性进化密切相关。为此,我们在前期获得黄斑草原毛虫和门源草...
- 蒲毅张棋麟郭仲龙袁明龙
- 关键词：线粒体草原毛虫基因表达青藏高原适应性进化
- 青海草原毛虫全线粒体基因组序列测定与分析
- 草原毛虫是我国青藏高原的特有昆虫,也是严重为害高寒草地的重大害虫。在本研究中,我们测定并分析了青海草原毛虫（Gynaephora qinghaiensis）的全线粒体基因组。青海草原毛虫样本采集于青海省玉树县巴塘乡（北纬...
- 张棋麟袁明龙
- 关键词：线粒体基因组夜蛾总科毒蛾科分子进化
- 两种草原毛虫的比较线粒体基因组学研究
- 草原毛虫别名红头黑毛虫、草原毒蛾,属昆虫纲（Insecta）、鳞翅目（Lepidoptera）、毒蛾科（Lymantriidae）、草原毛虫属（Gynaephora）。全世界文献记载的草原毛虫属昆虫共15种,其中分布于我...
- 张棋麟
- 关键词：鳞翅目毒蛾科草原毛虫过冷却点线粒体基因组
- 文献传递
