张闻博
- 作品数：15 被引量：128H指数：8
- 供职机构：东北农业大学农学院更多>>
- 发文基金：引进国际先进农业科技计划国家高技术研究发展计划黑龙江省博士后科研启动基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 大豆导入系群体芽期耐低温位点的基因型分析及QTL定位被引量：24
- 2009年
- 利用美国大豆品种Clark(供体亲本)与主栽品种红丰11(轮回亲本)所构建的回交导入系,经过严格的芽期耐低温筛选鉴定,得到46个在芽期耐低温性状上明显超过轮回亲本的导入系个体。利用这套选择群体结合随机对照群体和基因型分析,通过基于遗传搭车原理的卡方分析和单向方差分析方法,检测到分布于大豆8个连锁群的12个与大豆芽期耐低温相关的QTL。其中卡方分析检测到9个供体片段的超导入位点,对芽期耐低温性状表现为正效应。方差分析检测到5个位点,也表现为正效应,且其中Satt237和SOYPRP1两个位点是两种方法共同检测到的,应视为与耐低温直接相关的QTL。本研究旨在创建大豆芽期耐低温分子育种的检测方法平台,为大豆芽期耐低温研究提供有用的分子标记。
- 蒋洪蔚李灿东刘春燕张闻博邱鹏程李文福高运来胡国华陈庆山
- 关键词：大豆导入系芽期耐低温QTL定位
- 利用选择导入系分析大豆芽期和苗期耐旱性的遗传重叠被引量：13
- 2011年
- 以黑龙江主栽品种红丰11为母本,与美国品种Clark杂交,再以红丰11为轮回亲本,对回交后代的芽期和苗期的耐旱性进行筛选。结果获得芽期耐旱导入系44个,采用单项方差分析检测到10个控制芽期耐旱性的QTL;获得苗期耐旱导入系46个,检测到影响苗期叶片相对含水量、叶片持水能力、胁迫期间株高变化量的21个QTL。大多数位点的遗传是相互独立的,只有分布于A1、K、I和H连锁群上的Satt449、Satt499、Satt440和Sat_180位点是在芽期、苗期干旱条件下共同检测到的,表明芽期和苗期的耐旱性存在部分的遗传重叠。以上结果为深入研究大豆耐旱性以及进行分子设计育种以累加芽期苗期重要耐旱QTL奠定了基础。
- 邱鹏程张闻博李灿东蒋洪蔚刘春燕范冬梅曾庆力胡国华陈庆山
- 关键词：大豆导入系耐旱性
- 黑龙江省主栽大豆品种遗传多样性的SSR分析被引量：24
- 2009年
- 使用合丰25等来自13个育种单位的13份大豆(Glycine max)品种对大豆20个连锁群上的100对SSR标记进行筛选,最终保留了扩增稳定且多态性较高的43对SSR标记,分析了黑龙江省83个主栽大豆品种的遗传多样性。结果表明,在所有供试材料中共鉴定出等位变异157个,每个位点2-7个,平均为3.65个。品种间遗传相似系数为0.216-0.937,平均为0.6384,表明黑龙江省大豆品种的遗传相似性较大,故拓宽黑龙江省大豆品种的遗传基础具有重要意义。
- 高运来姚丙晨刘春燕李文福蒋洪蔚李灿东张闻博胡国华陈庆山
- 关键词：大豆SSR标记
- 作物QTL定位常用作图群体被引量：20
- 2008年
- 作物大多重要农艺性状是数量性状,受多基因控制,基因之间及基因与环境之间都会发生互作,这为研究带来了很大的不便。因此,好的QTL作图群体,是研究QTL间的互作、QTL与环境的互作、QTL定位以及基因克隆的最根本保障。随着分子标记技术的发展,QTL定位的作图群体也在不断的发展并逐渐满足研究者对于QTL的精细定位及基因克隆等研究的进一步要求。文章主要综述了作物QTL定位常用作图群体的构建及优缺点。
- 蒋洪蔚刘春燕高运来李灿东张闻博胡国华陈庆山
- 关键词：作物QTL定位
- 染色体片段导入系在作物遗传育种中的应用被引量：2
- 2008年
- 准确而有效的定位农作物数量性状基因座(Quantitative Trait Loci,QTLs)是植物分子育种的核心,传统的QTL定位群体遗传背景复杂,受群体大小和统计方法等多方面的限制,难以达到QTL精细定位。随着分子标记技术、计算机统计软件及分子辅助选择的飞速发展,一种新的QTL定位群体脱颖而出,这就是染色体片段导入系(Chromosome Segment Introgression Lines,CSILs)。它不但能有效消除"遗传背景噪音"对QTL定位的干扰,还能够在群体中挖掘出大量的有利隐蔽基因,对农作物遗传育种的进一步发展有巨大贡献。对染色体片段导入系的优越性,应用范围以及应用前景作以综述。
- 李灿东刘春燕蒋洪蔚张闻博陈庆山胡国华
- 关键词：基因挖掘分子设计育种
- 大豆定向选择群体耐旱性位点基因型分析及QTL定位被引量：11
- 2009年
- 利用Clark导入到红丰11为背景的回交导入系进行萌芽期和苗期的连续性耐旱鉴定,经萌芽期鉴定,获得36个耐旱定向选择导入系。对耐旱选择导入系进行全基因组SSR标记扫描,并以随机群体作为对照,计算供体基因型的导入频率,利用卡方测验检测显著偏分离的SSR标记位点,并结合GGT图示基因型软件对各染色体连锁群进行分析。其中在L连锁群的Satt398和Satt156两个位点有显著的供体片段"超导入"现象,供体基因型导入频率为0.916 7和0.958 3,卡方值高达182和201.5。另外,在F连锁群的Satt423,K连锁群的Satt167以及N连锁群的Sat_084等位点也出现供体导入片段的偏分离现象。同时,对萌芽期耐旱鉴定中相对发芽率表现超亲的35个株系采用性状-标记间的单向方差分析(P<0.01)和QTL定位,共检测到14个控制相对发芽率的QTL,分布在4个连锁群上,其中与卡方测验检测的结果相比较,在Satt156,Satt423,Sattt167等位点具有一致性,说明这些位点是与大豆耐旱性紧密相关的QTL位点。以上结果为进一步开展大豆耐旱性有利基因的精细定位、克隆和分子设计育种奠定了基础。
- 李灿东蒋洪蔚刘春燕邱鹏程张闻博李文福高运来陈庆山胡国华
- 关键词：大豆导入系耐旱性基因型分析QTL定位
- 大豆天冬氨酸途径关键酶基因GmASADH的克隆与分析被引量：5
- 2011年
- 本研究基于电子克隆获得的大豆GmASADH基因cDNA序列,根据其编码区设计特异引物,以大豆品种小鹦哥豆总RNA为模板,通过RT-PCR获得了约1 130bp的cDNA片段,T/A克隆后进行序列测定。测序结果显示,GmASADH基因家族有两个成员,命名为GmASADH1(FJ581425)和GmASADH2(HM015631)。GmASADH1编码区长度为1 134bp,编码378个氨基酸,由7个外显子和6个内含子构成,定位于Gm08染色体。GmASADH2编码区长度为1 131bp,编码377个氨基酸,由7个外显子和6个内含子构成,定位于Gm05染色体。两个基因在氨基酸水平上的相似性达到了96.02%,在二级及三级结构上均有不同程度的差异。ASADH蛋白含有NADB_Rossmann super-family和Semialdhyde_dhC superfamily结构域。
- 姜威朱宝华高静瑶于妍张闻博邱鹏程刘春燕陈庆山胡国华
- 关键词：大豆
- 大豆昆虫抗性相关QTLs的元分析被引量：4
- 2009年
- 大豆虫害严重危害大豆生产。虽然大豆抗虫相关QTLs研究增多,但由于作图群体不同、同种昆虫抗性QTL的调查性状不同以及数据分析方法存在差异等原因,使QTL精确性和有效性被降低。因此,获得相对真实且有效的QTLs位点对于促进分子标记辅助选择有重要意义。文章通过搜集已报道的81个与大豆昆虫抗性相关的QTL,提取相对有效且可靠的QTLs标记信息,利用元分析软件BioMercator2.1将这些QTLs映射到大豆公共遗传连锁图谱Soymap2上,通过单独与联合的两种元分析途径,利用QTLs的95%的置信区间来推断"真实QTLs"的位置。文章不仅构建了一张大豆昆虫抗性一致性图谱,而且通过两种元分析途径分别得到12个和14个QTLs位点,且其中有6个位点QTL的位置一致。它们被定位在9个连锁群上,主要成簇分布在E、F、H、M等4个连锁群上,图距由原来平均15cM缩减到平均3.67cM。除了一个与大豆食心虫抗性相关的位点外,其余QTLs都与多种昆虫抗性相关。研究结果明显缩短了原来已报道的QTL置信区间,为大豆抗虫相关QTL的精细定位以及抗虫相关基因挖掘提供了依据。
- 王晶宋万坤张闻博刘春燕胡国华陈庆山
- 关键词：大豆抗虫QTL
- microRNA的实验和生物信息学开发方法
- 2008年
- mircroRNA是一类约22nt的内源小分子RNA,普遍存在于真核生物体内,它通过与靶基因互补结合来调控基因表达,从而对生物体的生长、发育等起到重要的调节作用。随着生物学技术的不断发展,mircroRNA研究的越发深入,越来越多的mircroRNA被开发出来。本文结合了mircroRNA的生理特点,从RNA、DNA和生物信息学预测这3个方面归纳总结有关开发microRNA的方法,以及由此衍生出来的相关的研究方法。通过对这些研究方法的分类总结,不但为mircroRNA以后的研究工作奠定良好的基础,而且有利于新技术的研发。
- 王晶朱荣胜宋万坤张闻博刘春燕胡国华陈庆山
- 关键词：MICRORNA同源性
- 大豆回交群体耐旱耐盐的选择牵连效应及响应分析被引量：5
- 2011年
- 利用回交群体和多位点扫描分析方法研究了逆境胁迫下的选择牵连效应,找到相应的基因组区段,并分析了这些区段对不同选择条件的响应。结果如下:随机群体标记偏分离率为34.38%(P<0.000 1),经耐旱、耐盐选择后标记偏分离率分别扩大到51.56%和55.88%。说明经过耐旱、耐盐选择后回交导入系群体等位基因偏分离更为严重,群体基因型结构发生变化,表明选择牵连效应的存在。基于牵连效应的选择响应,根据供体等位基因导入频率在耐旱、耐盐选择群体与随机群体中的表现,经卡方分析在0.000 1水平下检测到3个耐旱相关位点(Satt338、Satt640和Sat_108),5个耐盐相关位点(Sat_271、Satt726、Satt640、Satt513和Sat_108)。
- 邱鹏程张闻博刘春燕蒋洪蔚李灿东范冬梅曾庆力蒋黎茜胡国华陈庆山
- 关键词：大豆回交群体
