李德涛 作品数:11 被引量:24 H指数:3 供职机构: 重庆医科大学附属第一医院 更多>> 发文基金: 重庆市自然科学基金 国家临床重点专科建设项目 重庆市卫生局医学科研项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
基于生物信息学识别早期肺腺癌生物标志物 2023年 目的通过生物信息学分析,探索用于肺腺癌早期诊断的潜在生物标志物。方法采用生物信息学方法,选择早期肺腺癌的基因表达数据库(GEO)数据集GSE27262、GSE63459、GSE116959、GSE118370,筛选肺腺癌与正常样本之间的差异表达基因,选择DAVID在线分析工具进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,使用STRING和Cytoscape绘制蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,使用cytoHubba确认PPI网络的中枢基因,并通过GEPIA2数据库验证中枢基因的表达和总生存率。结果共获得154个差异表达基因,主要集中于血管新生、细胞膜筏、转化生长因子-β(TGF-β)结合功能和肿瘤组织中的蛋白聚糖;创建了一个由154个节点和195条边组成的PPI网络;采用最大集团中心度(MCC)算法筛选出10个中枢基因:PECAM1、ENG、VWF、TEK、TIMP1、CAV1、ANGPT1、ACVRL1、BMPR2和SMAD6。除TIMP1外,这些中枢基因在肺腺癌组织中的表达均下调。生存分析结果显示,PECAM1和ENG的低水平表达与肺腺癌患者的不良总生存率有关。结论PECAM1和ENG与肺腺癌患者的血管生成有关,可作为肺腺癌的早期生物标志物。 苗桂华 袁金珊 李德涛 侯玉磊 陈辉关键词:肺腺癌 生物信息学 生物标志物 ENG 肺癌患者血清肿瘤坏死因子-α的检测和意义 被引量:4 2022年 目的探讨肺癌患者血清肿瘤坏死因子-α(TNF-α)检测的临床意义。方法选择2017年3月—2018年12月重庆医科大学附属第一医院收治的60例肺癌患者作为肺癌组,13例肺部良性疾病患者作为肺病组,另外选择同期39名健康体检者作为对照组。使用化学发光分析仪检测所有受检者血清TNF-α,使用全自动电化学发光分析仪检测常见肺癌肿瘤标志物〔包括癌胚抗原(CEA)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)、细胞角质蛋白19片段(CYFRA21-1)〕。比较各组血清TNF-α水平,分析TNF-α在不同临床病理特征肺癌患者中的差异。绘制受试者工作特征曲线(ROC曲线)并计算ROC曲线下面积(AUC),分析上述肿瘤标志物对肺癌的诊断效能。结果肺癌组血清TNF-α水平明显高于肺病组和对照组(ng/L:14.10±9.71比7.87±2.85、6.35±1.80,均P<0.05)。肿瘤直径>3 cm肺癌患者的血清TNF-α水平明显高于直径≤3 cm的肺癌患者(ng/L:15.05±10.53比8.87±2.03,P<0.05);发生淋巴结转移肺癌患者的血清TNF-α水平明显高于未发生淋巴结转移的肺癌患者(ng/L:15.53±10.56比9.59±3.57,P<0.05);肺癌患者血清TNF-α水平与肺部肿瘤的组织病理学类型、病理分期以及患者的性别、年龄、是否吸烟等均无显著相关性。ROC曲线显示,当取截断值为8.665 ng/L时,血清TNF-α对肺癌诊断的AUC为0.872,95%可信区间(95%CI)为0.792~0.953,敏感度为75.0%,特异度为94.1%,血清TNF-α与CEA、NSE、CYFRA21-1联合检测的AUC为0.976(95%CI为0.943~0.999),敏感度为92.5%,特异性度为97.1%。结论血清TNF-α与肺癌肿瘤大小、淋巴结转移状态高度相关,值得进一步扩大样本量进行研究。 李德涛 张玉婷 侯玉磊关键词:肿瘤坏死因子-Α 肺癌 肿瘤大小 淋巴结转移 TGF-β1经DNMT1调控肺癌A549细胞对顺铂的敏感性 被引量:1 2014年 转化生长因子-β1(transforming growth factor-beta 1,TGF-β1)与肿瘤的发生、发展以及凋亡关系密切,DNA甲基化关键酶DNMTs(DNA methyltransferases)在肿瘤发生及耐药中发挥重要作用,SPARC(secreted protein acidic and rich in cysteine)常因异常甲基化而表达下调。为探究肺癌对顺铂耐受的分子机制,该研究以肺腺癌A549细胞为研究对象,通过外源TGF-β1作用A549细胞,利用RT-PCR检测TGF-β1作用后DNMTs和SPARC m RNA水平的变化以及A549细胞增殖能力和对顺铂敏感性的影响。结果显示:5 ng/m L、10 ng/m L TGF-β1作用24 h后,A549细胞DNMT1 m RNA表达均显著下调(P<0.01、P<0.001),SPARC m RNA表达均显著上调(P<0.001、P<0.001);5 ng/m L、10 ng/m L TGF-β1作用后的A549细胞对顺铂的IC50均显著低于对照组[(12.34±0.36)μmol/L、(10.93±0.69)μmol/L,对照组为(21.54±1.21)μmol/L;P<0.01、P<0.01];5 ng/m L、10 ng/m L TGF-β1作用后的A549细胞在顺铂环境中,其克隆数显著低于空白对照;15μmol/L顺铂作用24 h时,5 ng/m L、10 ng/m L TGF-β1组细胞凋亡分数均显著高于空白对照(P<0.05、P<0.01)。结果提示:TGF-β1可下调A549细胞DNMT1的表达,进而上调抑癌基因SPARC并增加其对顺铂的敏感性,成功逆转肺腺癌A549细胞的恶性表型。该研究为进一步阐明肺癌对顺铂的耐受机制提供了新的思路。 李德涛 吴艳凤 薛成军 侯玉磊 陈辉关键词:TGF-Β1 DNMT1 A549细胞 顺铂 三种血清标志物联合检测在早期肝细胞肝癌中的诊断价值 被引量:7 2017年 目的探讨血清高尔基体蛋白73(GP73)、α-L岩藻糖苷酶(AFU)和甲胎蛋白(AFP)联合检测对早期肝细胞癌(HCC)的诊断价值。方法收集2016年3月至2017年3月该院肝病患者222例,根据疾病类型分为早期HCC组(74例)、晚期HCC组(27例)、肝硬化组(74例)、慢性乙型肝炎组(47例),另选取同期体检健康者49例作为健康对照组。分别测定各组血清AFP、AFU和GP73水平,绘制受试者工作特征(ROC)曲线,评价3项指标单独和联合检测对早期HCC的诊断价值。结果早期HCC组GP73、AFU和AFP水平均明显高于肝硬化组、慢性乙型肝炎组和健康对照组(P<0.05)。在肝癌筛查时,AFP单独诊断的ROC曲线下面积(AUC)为0.910(95%CI:0.864~0.936),两项指标联合时GP73和AFP联合诊断的AUC最大[0.925(95%CI:0.889~0.950)],灵敏度最高(95.0%)。在鉴别诊断早期HCC与肝硬化时,单独诊断以GP73的AUC最大[0.842(95%CI:0.746~0.879)],特异度最高(86.5%);两项指标联合时GP73和AFU联合诊断的AUC最大[0.901(95%CI:0.788~0.907)]。结论 GP73与AFP联合检测可以提高HCC筛查的诊断效能,GP73和AFU联合诊断能够提高早期HCC诊断效能,对于早期HCC和肝硬化的鉴别诊断具有重要意义。 陈特 毕小云 徐华建 谌海兰 侯玉磊 李德涛 张莉萍 吴燕关键词:肝细胞 高尔基体蛋白73 Α-L岩藻糖苷酶 甲胎蛋白 FSTL1在急性冠脉综合征患者血清中的表达水平及临床意义 被引量:2 2018年 目的观察卵泡抑素样蛋白-1(FSTL1)在不同类型的急性冠状动脉综合征(ACS)患者血清中的水平变化及其临床诊断价值。方法收集临床确诊的ACS患者(ACS组)98例,分为ST段抬高型心肌梗死组(STEMI组)34例、非ST段抬高型心肌梗死组(NSTEMI组)28例、不稳定心绞痛组(UA组)36例,同时选取冠状动脉造影结果阴性的患者20例作为对照组。用酶联免疫吸附试验(ELISA)方法测定4组血清中FSTL1的水平,分析FSTL1与其他指标的相关性及诊断价值。结果 ACS各组血清FSTL1水平明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。ACS组血清FSTL1水平与心肌肌钙蛋白(cTNT)、Gensini评分和超敏C反应蛋白(hs-CRP)水平成正相关,相关系数(r)分别为0.210、0.236、0.219。FSTL1诊断ACS的ROC曲线下面积(AUC)可达0.910(95%CI:0.832~0.988),但次于cTNT。FSTL1最佳界值为5.65μg/L,特异度84.2%,灵敏度77.5%。FSTL1联合cTNT和HDL对诊断ACS的效能最高,AUC=0.945(95%CI:0.909~0.981)。结论 ACS患者血清的FSTL1水平与炎性反应及冠状动脉狭窄程度存在一定的相关性,对于判断患者冠状动脉狭窄的严重程度及预后具有一定的临床价值。 陈特 毕小云 徐华建 侯玉磊 谌海兰 李德涛 张莉萍 吴燕关键词:急性冠脉综合征 冠脉狭窄 体外诊断 DNMT3a基因shRNA质粒表达载体的构建及其沉默作用 2015年 目的以DNMT3a mRNA保守序列为靶基因设计针对DNMT3a mRNA的siRNA序列和无效干扰对照序列(HK),并利用基因重组技术将其克隆到真核表达载体p Gensil-1中,构建p Genesil-1-DNMT3a-shRNA、p Genesil-1-HK-shRNA重组质粒。方法应用转化技术将重组质粒转化到大肠杆菌DH5a中,通过卡那霉素抗性筛选出阳性菌落后提取质粒进行酶切和测序鉴定,应用质粒转染技术转染耐顺铂肺腺癌A549细胞(A549-DDP),利用RT-PCR技术检测转染重组质粒24、48、72 h后DNMT3a的沉默效率。结果测序结果与合成序列一致,重组质粒不能够被PstⅠ切开,转染p Genesil-1-DNMT3a-shRNA能够明显抑制DNMT3a的表达,抑制率分别达到25.5%,56.2%,63.4%,且呈明显时间依赖性,而p Genesil-1-HKshRNA无明显抑制作用。结论成功构建了DNMT3a基因shRNA及HK质粒真核表达载体,为进一步实验研究奠定了基础。 吴艳凤 李德涛 郑倩 李雪 薛成军 陈辉关键词:RNA干扰 重组质粒 胸腔积液和腹水清蛋白检测假性增高1例 2020年 胸腔积液和腹水总蛋白测定是鉴别渗出液和漏出液的重要指标之一[1],一般认为胸腔积液和腹水总蛋白高于25 g/L为渗出液,低于25 g/L则为漏出液[2]。清蛋白在胸腔积液和腹水中的检测主要用于提示血清-清蛋白梯度,能够比较真实地反映门静脉压力,有利于提高胸腔积液和腹水性质鉴别的准确性[3-4]。基于溴甲酚绿的比色法检测清蛋白水平操作简单,特异性强,目前在国内常用于清蛋白的水平检测。本院检验科发现基于溴甲酚绿比色法检测胸腔积液和腹水清蛋白假性增高1例,现报道如下。 李德涛 周密 侯玉磊关键词:清蛋白 溴甲酚绿 重庆地区健康成人血清铁蛋白参考区间的建立 被引量:1 2022年 目的建立重庆地区健康成人血清铁蛋白参考区间。方法选取重庆地区1996例健康成人检测血清铁蛋白,比较男女性的血清铁蛋白浓度,使用非参数排序法计算P_(2.5)~P_(97.5)区间,建立重庆地区健康成人血清铁蛋白参考区间,并进行验证。结果健康成年男性和健康成年女性血清铁蛋白测定结果均为偏态分布,应当采用百分位数法进行进一步分析。经秩和检验分析,健康成年男性血清铁蛋白浓度明显高于健康成年女性,差异具有统计学意义[334.50(225.40,488.70)ng/ml VS 79.17(39.88,133.10)ng/ml,P<0.01]。将同性别血清铁蛋白浓度按年龄分段并同上一年龄段进行比较,≥61岁健康成年男性的血清铁蛋白浓度低于51~60岁男性,差异具有统计学意义(P<0.01)。51~60岁健康成年女性的血清铁蛋白浓度高于41~50岁女性,差异具有统计学意义(P<0.01)。女性各年龄段的血清铁蛋白浓度均明显低于男性,差异具有统计学意义(P<0.01)。可知,重庆地区健康成年不同性别的血清铁蛋白浓度有差异,相同性别不同年龄段的血清铁蛋白浓度也有差异,所以重庆地区健康成年参考区间应针对不同性别和年龄段来进行设置。将无统计学意义的年龄段进行合并,得出血清铁蛋白不同性别及年龄段参考区间:男性:18~60岁为88.93~1139.35 ng/ml,≥61岁为34.10~854.42 ng/ml;女性:18~50岁为6.17~260.73 ng/ml,≥51岁为30.59~500.45 ng/ml。统计文献可知,血清铁蛋白在不同地区,不论检测方法是否相同,其参考区间并不一致。选取2018年1月~2019年3月在健康体检中心体检的体检人员进行参考区间验证,按照CLSIC28-A3文件剔除离群值,经验证,本次血清铁蛋白参考区间通过验证。结论重庆地区健康成人男、女血清铁蛋白参考区间与文献报道存在差异,重庆地区应建立适合本地区人群的血清铁蛋白参考区间。 李德涛 侯玉磊关键词:血清铁蛋白 健康成人 电化学发光 6种化学发光系统检测肿瘤标志物的应用评估分析 被引量:5 2020年 目的探讨6种化学发光系统检测甲胎蛋白(AFP)、癌胚抗原(CEA)、总前列腺特异抗原(tPSA)、游离前列腺特异性抗原(fPSA)、糖类抗原CA199(CA199)、糖类抗原CA153(CA153)和糖类抗原CA125(CA125)仪器参数、西格玛值(σ)、可比性及临床可接受程度。方法收集6种系统的检测速度,试剂仓位,开展项目数等硬件参数,使用单位半年质控数据,计算各系统检测项目的精密度及σ值。以Roche E602电化学发光系统为参考系统,根据EP9-A2文件的要求,对检测结果进行方法比对和偏倚评估。结果 (1)比较6种检测系统的检测速度,试剂仓位,软件功能等参数,6种检测系统基本满足临床需求。(2) Roche E602与A厂家比较,多数检测项目σ值多数高于6σ水平;B,D和E三家厂家检测项目σ值基本处于优秀水平(5~6);C厂家多个项目小于4σ水平,存在较大差距。(3)除B厂家外,其它厂家与Roche E602多数项目偏移超过1/2 TEa,临床不可接受。结论实验室同时存在多种不同品牌化学发光检测系统检测同一检验项目时,应进行方法比对和偏倚评估,判断其临床可接受性能,以保证检验结果的可比性。 张磊 李德涛 朱艳 甄乾娜关键词:肿瘤标志物 化学发光法 肺癌患者血清肿瘤标志物与EGFR突变相关性研究 被引量:2 2018年 目的探究肺癌患者血清细胞角蛋白19片段(CYFRA21-1)、神经元特异烯醇化酶(NSE)、鳞状上皮细胞抗原(SCC)浓度与EGFR(表皮生长因子受体)基因突变的关系,为EGFR基因突变提供可靠的预测指标。方法收集174例肺癌患者术前血清及术后肺癌组织;电化学发光法检测血清肿瘤标志物浓度,利用突变扩增阻滞系统(ARMS)检测肺癌组织EGFR基因突变;分析EGFR突变与肺癌患者临床病理特征的关系;分析血清肿瘤标志物与肺癌患者EGFR突变的关系。结果 174例肺癌患者中,78例发生突变,其中以19号外显子缺失(19-del)和21号外显子L858R突变为主;女性肺癌患者EGFR突变率显著高于男性患者(χ2=34.027,P=0.000),腺癌患者EGFR突变率显著高于鳞癌患者(χ2=34.027,P=0.002),非吸烟患者EGFR突变率显著高于吸烟患者(χ2=40.397,P=0.000);EGFR野生型肺癌患者血清CYFR21-1、NSE、SCC浓度显著高于EGFR突变者[4.80(2.50,8.30)ng/mL vs.2.50(1.90,4.60)ng/mL,P=0.000;13.05(10.63,18.35)U/L vs.11.00(9.20,13.10)U/L,P=0.010;1.00(0.70,1.58)ng/mL vs.0.70(0.55,1.00)ng/mL,P=0.000]。结论EGFR突变多发生在非吸烟女性腺癌患者,血清肿瘤标志物作为EGFR基因突变的预测指标具有一定的临床应用价值,值得扩大样本量进一步研究。 侯玉磊 李德涛 陈特 毕小云关键词:肺癌 肿瘤标志物 EGFR基因突变