李晓筠
- 作品数：5 被引量：8H指数：1
- 供职机构：华南农业大学动物科学学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 电子克隆结合RACE获取一个猪肉质新基因
- 溶酶体组织蛋白酶Dcathepsin-D(CTSD),是一个重要的溶酶体天冬氨酸蛋白酶,在溶酶体介导的细胞蛋白质降解过程中具有重要作用.本研究采用生物信息学、RT-PCR及RACE方法,分离测定了猪溶酶体组织蛋白酶CTS...
- 梅盈洁李加琪陈瑶生王翀罗永发李晓筠朱良瑞
- 关键词：电子克隆RACE
- 文献传递
- 猪CTSD全长cDNA的克隆和表达分析被引量：8
- 2007年
- 以人CTSD mRNA全长序列为基序,在db EST库中搜索同源性大于80%、重叠大于40个碱基的猪EST下载经Seqman软件装配后,利用RT-PCR扩增到猪CTSD基因部分cDNA序列,进一步通过RACE技术获得cDNA全长（GenBank登录号为DQ018727）,猪CTSD基因cDNA全长2032 bp包括93 bp 5′UTR区、706 bp 3′UTR区和1 233bp ORF,编码410个氨基酸残基。其编码区与人、鼠、牛、羊CTSD编码区同源性分别为87.9%、78.2%、86.6%和85.0%,其氨基酸序列与人、鼠、牛、羊氨基酸序列同源性分别为86.6%、80.1%、86.0%和84.7%。疏水性分析和信号肽预测发现猪CTSD氨基酸序列存在至少7个疏水性区域,信号肽位点为第1-20个氨基酸残基。在NCBI进行Blast P搜索结果显示猪CTSD氨基酸结构中含有Asn（Asparagine,天门冬酰胺）结构域,与天冬氨酸蛋白酶3D结构同源性高达99.7%,具有真核生物天冬氨酸蛋白酶的典型结构。以猪多组织RNA池为模板,以1026 bp部分cDNA序列作为杂交探针进行Northern杂交,得到一条2000 bp左右特异条带,从而验证了RACE产物为全长cDNA并揭示该基因只有一个转录本。为了研究猪CTSD基因在体内不同组织内表达的特点,采用半定量RT-PCR对CTSD基因在猪10个组织中的表达进行研究,结果表明在10个组织中均有表达,且表达量与-βactin内参接近。
- 梅盈洁李加琪陈瑶生李晓筠朱良瑞凌飞王翀张豪
- 关键词：电子克隆快速扩增CDNA末端全长CDNA
- 仙湖鸭配套系肌肉组织mRNA差异表达分析
- 鸭是我国第二大养殖禽类，在畜牧业生产与社会经济发展中占有重要地位。随着畜牧业生产发展，鸭在禽类市场的占有率不断提高。为了进一步提高肉鸭生产性能，增加肉鸭业生产效益，推动肉鸭业继续发展，深化肉鸭技术研究显得十分必要。近些年...
- 李晓筠
- 关键词：生物信息学分析遗传育种
- 文献传递
- 猪CTSD基因内含子5的克隆及序列分析
- 组织蛋白酶D(CathepsinD)是一种内源性水解酶,参与多种生化代谢途径.因与屠后猪肉的熟化关系密切,而可能影响猪肉的嫩度.研究CTSD基因的结构有助于深入了解CTSD基因的功能.根据人的同源序列设计引物,用PCR扩...
- 李晓筠李加琪
- 关键词：组织蛋白酶D克隆
- 文献传递
- 一条猪肌肉EST的RH定位及RACE研究
- 本研究对来自肌肉组织登录号为BM445308、编号为E47的EST用cDNA直接测序的方法进行SNP筛查,找到了一个SNP,并在参考家系中进行基因分型及性状的关联分析.对EST进行RH定位,定位在15q23-26处,它所...
- 黄志宏王翀李晓筠方伟巩振华陈瑶生
- 关键词：ESTRACE肌肉组织
- 文献传递
