陈冬妹 作品数:6 被引量:29 H指数:3 供职机构: 西南大学生物技术学院蚕学与系统生物学研究所 更多>> 发文基金: 国家重点基础研究发展计划 国家高技术研究发展计划 重庆市自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
一种简便分离高质量家蚕基因组DNA的方法 被引量:11 2007年 本研究对传统的家蚕基因组提取方法进行了改进。改进方法无需研钵和液氮,将RNase与蛋白酶K同时加入剪碎的家蚕样品中消化处理,并利用旋转振荡培养箱旋转混匀和培育每步的样品。该方法减少了基因组DNA的损失,提高了工作效率,节约了成本。利用改进后的方法对不同家蚕品种的基因组DNA进行了提取和PCR扩增验证,结果表明提取的基因组DNA的质量、获得率、重复性都更好,能够满足家蚕分子生物学研究的需要。 陈冬妹 林英 王艳霞 杨瑜 代方银 夏庆友关键词:家蚕 基因组DNA TILLING技术应用于家蚕化学诱导突变检测的体系优化 被引量:2 2009年 TILLING(Targeting Induced Local Lesions In Genomes)即定向诱导基因组局部突变技术,是近年发展起来的一种高通量检测点突变的反向遗传学方法。本研究从PCR模板量及酶切体系中CELI的酶量两个方面对家蚕TILLING技术的检测体系进行了优化。结果表明:本实验在应用TILLING技术筛选家蚕突变体过程中,用于PCR扩增的家蚕基因组DNA模板最佳用量为20ng;CELI酶切的20μL反应体系中,加入的最适酶量为0.5μL(本实验室从芹菜中自提的CELI酶10倍稀释液)。本研究初步对TILLING技术应用于家蚕化学诱导突变检测体系进行了优化,为TILLING技术在家蚕功能基因组研究中的应用奠定了基础。 林英 陈冬妹 杨瑜 王艳霞 杨从文 夏庆友关键词:家蚕 TILLING 功能基因组 家蚕TILLING技术的优化及其在丝素基因突变体筛选中的初步应用 随着基因组测序工作的不断推进,人类已经进入了以功能基因组研究为主题的后基因组时代,其中一个显著的特点就是,发现新基因和认识基因的生物学功能成为最为紧迫的任务。突变体是功能基因组学研究的重要材料,受到人们越来越广泛的重视。... 陈冬妹关键词:家蚕 基因组测序 基因突变 文献传递 家蚕化学诱变剂及诱导突变体的筛选 被引量:8 2007年 在家蚕Bombyx mori基因组计划完成之后,其功能基因组研究成为该领域的最重要课题。突变体是功能基因组学研究的重要材料,因此,通过人为诱导获取大量的突变系统是及其重要的手段。本研究用化学诱变剂ENU、MNU、DES、5-BU、EMS诱导处理家蚕标准品种C108,筛选获得了非滞育红卵,长圆筒茧、小茧、丝胶茧及绵茧突变体,致死突变体及无鳞毛蛾翅突变体。结果还表明:MNU、DES诱变家蚕的突变效率高,注射翅原基比腹部更方便且效果好,化学诱导雄体比雌体的效果好;在时期上,注射蛹和蛾都有诱导效果。上述突变体大多为致死性突变,推测其可能与致死性基因突变有关。同时,本研究为应用TILLING技术鉴定家蚕更多目的基因突变体提供了有效的材料。 林英 陈冬妹 代方银 杨瑜 向仲怀 夏庆友关键词:家蚕 化学诱变剂 突变体 TILLING技术 利用Ecotilling技术筛选家蚕E群突变体的突变基因(英文) 2011年 对突变体的发现与鉴定是揭示基因功能的一种有效手段。为了研究家蚕E群突变体的基因多样性,利用Ecotilling技术平台,对家蚕18个E群突变体中的14个Hox基因片段(总长408 kb)进行突变筛选,获得了48个错义突变和213个沉默突变,其中60%是转换型突变,即嘌呤突变为嘌呤,嘧啶突变为嘧啶。研究结果表明,11个Hox基因片段在不同E群突变体中发生了突变,其中在E群突变体06-250中的Bmshx7基因有不同的错义突变位点,特别在homeobox结构域也有突变发生,这些突变可能会影响到Bmshx7基因的功能,即影响对目标基因的转录调控,最终产生突变体06-250相应的突变表型。研究获得的Hox基因的其它突变信息目前与E群突变体的表型尚无直接关联,但其研究结果可为继续筛选鉴定E群突变基因以及探讨基因的功能提供有价值的信息。 林英 陈冬妹 杨瑜 王艳霞 杨从文 夏庆友关键词:家蚕 基因多样性 HOX基因