黄蛟龙
- 作品数：2 被引量：8H指数：1
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- 用一个相对简单的方法来探测核苷酸替代模型的异质性(英文)
- 2005年
- 对于可观察到的分子序列进化模型的不同,提出一个相对简单的方法——卡方检测,来检测在DNA序列间替代过程的同质性。这个卡方检测方法不管在座位间下列3个条件是否满足皆是成立的:(1)替代率的异质性;(2)进化率/模型的相关性;(3)替代模型的变异。计算机模拟也显示出卡方检测在各种生物学条件下的序列进化模型是非常有效的。在真实数据中,11种节肢动物线粒体DNA的比较中发现,水蚤或卤虫与其他9种节肢动物以高百分比违背了同质性进化模型假设,显然是由于AT含量高而引起的,且在两种蚊子的线粒体DNA比较中发现,其满足同质性假设仅有7.69%。还比较了卡方检测与KumarandGadagkar的ID检测之间的效能差异:在较为复杂的模型下,卡方检测效率在许多情况下较ID检测方法略高;并且在犯I-型错误以及卡方测验的效率曲线中清楚地表明我们的方法是保守的,而Kumar等的方法是不保守的。
- 黄蛟龙曹致琦张泽朱大海
- 关键词：同质性
- 极大似然法探测主基因的效能被引量：8
- 2003年
- 采用 Monte Carlo模拟数据和极大似然法探测 F2 群体主基因 (MG)。研究了遗传力、显性比和样本容量三因素对探测 F2 群体 MG的影响。结果表明 :1)在主基因的被发现率上 ,三因素的影响力为 :遗传力 >样本容量 >显性比。当遗传力较小时 ,如 0 .3,即使样本容量高达 10 0 0 ,其发现能力也仅有 5 1.6 3% ;当遗传力大于 0 .5时 ,样本容量大于 30 0 ,MG的被发现率在 80 %以上。 2 )一般来说 ,一旦 MG被探测到 ,参数 d和 h估计的准确度均较高。并且 ,随着遗传力 h2b 和样本容量 c的增大 ,参数 d和 h估计的精度也随之提高。
- 黄蛟龙曹致琦马海燕张泽
- 关键词：遗传力MONTECARLO模拟
