张天
- 作品数：6 被引量：13H指数：2
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- 发文基金：国家自然科学基金河南省高等学校青年骨干教师资助计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 支持向量机预测食管鳞癌患者术后生存期被引量：1
- 2015年
- 目的应用支持向量机(support vector machine,SVM)建立食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)术后生存期预测模型并评估该模型判断ESCC生存期的效能。方法随访168例接受根治性手术治疗的ESCC患者,分析ESCC临床病理特征和14-3-3σ、热休克蛋白gp96、巨噬细胞移动抑制因子(migration inhibitory factor,MIF)等3个蛋白的表达规律与ESCC生存期的相关性;应用Matlab软件进行SVM运算,对训练组128例ESCC患者建立最优预后分类模型ESCC-SVM,并用测试组40例患者验证分类效率,ROC曲线分析ESCC-SVM及其他预后相关因子对高低死亡风险ESCC的识别能力。结果 ESCC-SVM由性别、T分期、组织学分级、淋巴结转移、TNM分期、14-3-3σ和gp96等7个最优属性组成,该模型区分训练组和测试组ESCC五年整体生存率的最大AUC分别为0.96、0.86、准确率分别为97.7%、90.0%,明显优于目前临床应用的TNM分期(准确率分别为62.5%、67.5%)及其他各临床病理属性。Cox多因素比例风险回归模型分析发现年龄、T分期、gp96和ESCC-SVM是影响ESCC术后生存期的独立因素。ESCC-SVM与性别、T分期、组织学分级、淋巴结转移、TNM分期和14-3-3σ均显著相关。结论本研究建立的ESCC-SVM为预后评估、临床治疗方案选择及个体化治疗提供了理论依据。
- 张天晁玮霞赵云岗王明王广超贺红梅刘瑞敏魏书堂韩大正朱晗马瑾谷娟马远方齐义军
- 关键词：食管鳞状细胞癌支持向量机热休克蛋白GP96巨噬细胞移动抑制因子
- SELDI-TOF/MS分析原发性肝癌TACE治疗前后血清蛋白质差异表达谱被引量：3
- 2014年
- 目的分析原发性肝癌患者经导管肝动脉化疗栓塞（TACE）治疗后血清蛋白质4a．es~图谱的变化。方法应用SELDI—TOF／MS技术和IMAC30蛋白质芯片采集50例肝癌患者TACE治疗前后肝癌患者的血清蛋白质质谱，Biomarkerwizard软件分析差异表达蛋白质峰，应用支持向量机（supportvectormachine，SVM）建立TACE治疗前后分类模型，KOC评价各差异蛋白质峰和SVM分类模型的分类效率。结果在0～20000m／z质荷比范围内，共采集到199个蛋白质峰，BiomarkerWizard软件鉴定出13个差异表达蛋白质峰（P〈0．05），包括TACE治疗24h后7个高表达蛋白质峰和6个低表达蛋白质峰。2883、11535和11687等3个蛋白质峰区分TACE治疗前后HCC的敏感性和特异性分别为80％、76％、62％和80％、60％、62％，AUC为0．8；SVM分类模型区分TACE治疗前后HCC的敏感性和特异性均为100％。结论应用SELDI—TOF／MS技术可分析TACE治疗后血清差异表达蛋白质谱，SVM分类模型能有效区分TACE治疗前后HCC。
- 齐义军马瑾张天王明晁玮霞朱晗刘瑞敏马远方Philip Johnson
- 关键词：原发性肝癌SELDI-TOF蛋白质芯片经导管肝动脉化疗栓塞
- 肝细胞癌中差异表达N-连接糖蛋白的分析鉴定被引量：3
- 2014年
- 目的分析鉴定与肝细胞癌(HCC)发生发展相关的差异表达的N-连接糖蛋白。方法应用刀豆蛋白凝集素(ConA)、晶状体凝集素(LCH)和雪花凝集素(GNA)组成的亲合层析柱富集10对HCC和癌旁非癌组织中N-连接糖蛋白、二维电泳(2DE)比较分析差异表达的蛋白质点、串联质谱鉴定差异表达蛋白,Western blotting验证人羧酸酯酶1(hCE1)、触珠蛋白(HP)及组织蛋白酶D(CD)的差异表达;体外侵袭实验检测CD表达沉默后对HCC的侵袭力影响。结果质谱、生物信息学等技术鉴定了28个与HCC相关的差异表达蛋白(HCC中高表达和低表达的蛋白均为14个),Western blotting验证hCE1、HP在HCC中明显低表达,组织蛋白酶D前体(pCD)在HCC中高表达;而ConA亲和层析柱富集的ConA-CD在HCC中显著高表达。CD-siRNA介导的CD表达沉默能够显著降低肝癌细胞系SNU449、SNU473的体外侵袭能力。结论 HP、hCE1蛋白表达变化和CD N-糖链变异可能参与了HCC发生发展过程。
- 马瑾齐义军刘瑞敏王明张天朱晗马远方
- 关键词：糖蛋白组织蛋白酶D触珠蛋白二维电泳质谱
- 二维电泳和质谱技术鉴定肝细胞癌相关N-连接糖蛋白被引量：2
- 2015年
- 目的鉴定与肝细胞癌(HCC)发生发展相关的差异表达N-连接糖蛋白。方法采用刀豆凝集素A(Con A)、晶状体凝集素(LCH)、雪花凝集素(GNA)等3种植物凝集素组成的亲和层析柱,分别从肝永生化细胞系L02和HCC细胞系Huh7、PLC5、SNU449中纯化N-连接糖蛋白、二维电泳分析差异表达的蛋白质斑点,质谱、生物信息学等技术鉴定差异表达蛋白,Western blotting验证了转录调控肿瘤蛋白(TCTP)、上皮细胞黏附分子(Ep CAM)和膜联蛋白A2(annexin A2)在肝永生化及HCC细胞和HCC及癌旁组织中的表达规律,体外侵袭实验检测TCTP沉默后对SNU449的侵袭力影响。结果质谱、生物信息学等技术共鉴定出42个差异表达的蛋白质分子/异质体(HCC细胞中高、低表达的蛋白/异质体分别为14个、28个),代表32个蛋白质分子,其中的22个蛋白含有至少1个N糖基化位点(Net NGlyc 1.0预测)。这些差异表达的蛋白主要参与氧化还原内稳态维系、碳水化合物/能量代谢、糖酵解、抗凋亡等生物学过程。Western blotting检测表明,TCTP、Ep CAM和annexin A2在6个肝癌细胞系PLC5、Hep G2、SNU449、Huh7、HCC7721和SNU473及肝癌组织中表达显著升高,siRNA介导的TCTP沉默明显抑制了HCC细胞系SNU449的体外侵袭能力。结论 TCTP、Ep CAM和annexin可能参与了HCC发生发展过程,TCTP可能成为HCC靶向治疗的分子靶点之一。
- 王明丽韩大正晁玮霞刘瑞敏赵云岗张天齐义军
- 关键词：肝细胞癌植物凝集素质谱二维电泳
- iTRAQ联用串联质谱鉴定食管鳞状细胞癌差异表达蛋白质及蛋白质相互作用网络被引量：2
- 2016年
- 基于质谱的蛋白质组学结果不仅具有重复性差和覆盖率低等缺陷,并且针对数十至百个差异表达蛋白质分子的分析非常具有挑战性,而蛋白质与蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction network,PPIN)分析能够在一定程度上弥补上述不足,使各种组学研究结果具有一致性和可比性。本研究应用同位素标记相对和绝对定量(i TRAQ)联用串联质谱技术鉴定了与食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)相关的差异表达蛋白质244个(ESCC中,升高和降低的蛋白质分别为119个和125个),基因本体论(gene ontology,GO)富集与肿瘤十大特征相关的17个GO条目;以该17个条目包含的117个蛋白质为种子蛋白搜索STRING(http://www.string-db.org)数据库,构建包含96个存在相互作用的PPIN和21个离散蛋白质。用Cyto Hubba算法确定34个中心节点蛋白质和36个瓶颈蛋白质,非重复49个中心节点和/或瓶颈蛋白质中含7个目前已报道的癌基因表达蛋白(PPP2R1A、CTNNB1、ENO1、EZR、TPM4、COL1A1、TPM3),确定与该7个癌蛋白直接相互作用的4个蛋白质(FN1、ITGB1、TAGLN和YWHAZ)可能为参与食管癌变的关键蛋白质,并应用Western印迹实验验证了FN1、ITGB1、TAGLN和YWHAZ等4个关键蛋白质在ESCC中具有显著的表达差异,表明PPIN分析是确定具有重要生物学意义分子的有效途经之一。
- 赵云岗张天谷娟王广超向慧妮刘瑞敏晁玮霞贾彩云韩大正杨文义马远方齐义军
- 关键词：食管鳞状细胞癌
- 食管鳞癌中14-3-3σ表达的临床意义及与预后的相关性被引量：2
- 2014年
- 目的 确定14-3-3σ与食管鳞状细胞癌（ESCC）临床病理特征及与预后的相关性.方法-86℃冻存的TNMⅠ～Ⅳ期ESCC 80例,ESCC组织芯片含ESCC 86例;分别应用Western blot、免疫组织化学检测80例冻存、组织芯片中86例ESCC中14-3-3σ的表达;Kaplan-Meier分析14-3-3σ、临床病理资料与ESCC术后整体生存期相关性.结果 14-3-3σ蛋白主要表达于胞质及胞膜,其阳性表达与淋巴结转移、TNM分期呈负相关,与分化程度正相关（P＜0.05）;14-3-3σ高表达及低表达ESCC患者术后平均生存时间分别为39.82和28.45个月,5年整体生存率分别为43.31％和24.8％（log-rank test,P＜0.01）,TNM分期和14-3-3σ是影响ESCC预后的独立因素.结论 14-3-3σ低/失表达可能是ESCC预后不良的分子标志物之一.
- 魏华王明刘瑞敏张天马瑾马远方齐义军
- 关键词：食管鳞状细胞癌生物标志物预后
