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张磊: 作品数：15 被引量：102H指数：7; 供职机构：华中农业大学园艺林学学院更多>>; 发文基金：国家烟草专卖局基金国家高技术研究发展计划作物遗传与种质创新国家重点实验室开放课题更多>>; 相关领域：农业科学轻工技术与工程生物学更多>>

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用离子色谱法同时测定茶叶中的F^-、Cl^-、SO4^2-、NO3^-被引量：14: 2008年; 利用美国戴安公司免试剂离子色谱系统(ICS-2000系统),采用KOH梯度离子色谱法和抑制电导检测器,建立了同时测定茶叶中F-、Cl-、SO42-、NO3等四种重要的阴离子的分析方法。研究了茶叶中F-、Cl-、SO42-、NO3四种阴离子的色谱分析条件,建立了8-44-52-8mmol/L的KOH梯度淋洗程序,流速为1.0ml/min。结果表明:该方法回归方程的线性相关系数达到0.9999以上,各组分的检出限在0.01～0.05mg/L之间,回收率在88.6%～107.5%之间。用本方法用于实际茶叶样品中F-、Cl-、SO42-、NO3等无机酸阴离子的分析,简便、实用,并且快速、准确,所得结果令人满意。; 石元值杨亦扬阮建云马立峰张磊韩文炎王方; 关键词：离子色谱法梯度淋洗

基于基因组的绒毛状烟草和林烟草microRNA及其靶基因分析被引量：1: 2014年; 【目的】填补绒毛状烟草(Nicotiana tomentosiformis)和林烟草(Nicotiana sylvestris)在miRNA相关领域的研究空白,揭示普通烟草(Nicotiana tabacum)的生长发育调控机理。【方法】在绒毛状烟草和林烟草全基因组中预测并分析miRNA及其靶基因,通过同源比对及miRNA前体二级结构特征进行预测:参考序列在绒毛状烟草和林烟草基因组的比对中,允许最多1—2个错配;miRNA二级结构为经典茎环结构,其中MEF最大值为-25,MEFI最小值为0.85,预测的miRNA与已知的同一家族的miRNA位于发夹结构的同一条臂上;去除E值小于等于1e-6的编码蛋白的序列。【结果】在绒毛状烟草中得到39个家族的162条miRNA,包括14对正/反义miRNA和5个基因簇。在林烟草中得到40个家族的169条miRNA,包括13对正/反义miRNA和3个基因簇。2个野生烟草在保守度高的miRNA家族中,其成员分布相似,且成员数相近。在保守度相对较低的家族中,2个野生烟草其成员分布差异较为明显,其中,miR5021、miR5203等9个家族仅在绒毛状烟草中有成员,miR1446、miR1509等10个家族仅在林烟草中有成员。2种野生烟草的正义miRNA与反义miRNA都有着1—4个碱基差异,这些差异位点在不同的家族中呈现出偏好性,而且在2种野生烟草中偏好性相似:miR164家族的9、12、13个碱基处,miR172家族的1、21个碱基处,miR396家族的2、17个碱基处,miR399家族的15、20个碱基处。2种野生烟草的基因簇主要是由miR156、miR169家族组成,其前体的间距小于350 nt,同时在绒毛状烟草中首次发现miR6019/miR6020基因簇。以普通烟草的unigene数据库作为靶基因集进行预测与分析,在绒毛状烟草122条miRNA中得到749个靶基因,去掉重复基因得到非冗余靶基因206条,其中89条(43%)得到GO功能注释;在林烟草中117条miRNA得到650个靶基因,去掉重复基因得到非冗余靶基因169条,其中78条(46%)得到GO功能注释。在分子功能方面,大多数靶�; 李凌张磊晁江涛龚达平李凤霞王倩丁安明陈雅琼孙亭亭孙玉合; 关键词：MIRNA 生物信息学基因组

烟属物种基因组研究进展被引量：7: 2015年; 烟属是茄科植物的第五大家族,其中普通烟草和黄花烟草作为重要经济作物对农业经济产生重大价值,同时,烟草野生种资源的基因组中也包含有特有的抗病虫基因,常被用于基础生化代谢、基因组进化、转基因等领域研究,且普通烟草已作为植物研究的模式生物,成为植物分子研究领域常用工具之一。本文介绍了烟属物种近年来在基因组研究中的一些主要进展及数据资源,包括国际各项烟草基因组计划中完成的野生种烟草(林烟草,绒毛状烟草,耳状烟草和本氏烟草)和栽培种烟草(TN90,K326和BX)的全基因组重测序及其它基因组方面的研究,以期为未来的烟属物种的生物学研究提供借鉴。; 余世洲张磊张洁赵杰宏; 关键词：基因组进化测序烟草

乌拉尔图小麦(Triticum urartu)多药抗性基因TuPDR7的生物信息学分析: 2018年; 多药抗性基因(pleiotropic drug resistance,PDR)是ATP-bindingCassette(ABC)转运蛋白基因三大亚家族中的一个,具有对生物和非生物胁迫的广谱抗性。本研究以乌拉尔图小麦为材料,以小麦TaPDR7基因序列为探针,在乌拉尔图小麦的DNA、CDS和氨基酸序列数据库中搜索到同源序列,命名为TuPDR7,并对其进行生物信息学分析。结果表明,TuPDR7长4140bp,编码1379个氨基酸,预测其蛋白分子量为155.5kD,等电点为6.1,是一个膜蛋白。同源序列比对和三级结构预测显示TuPDR7具有PDR基因典型的结构域。启动子预测表明TuPDR7含有对禾谷镰刀菌等真菌、脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)、生物激素、盐胁迫、冷胁迫、干旱胁迫等的响应元件,说明其可能是一个广谱抗性基因,对于乌拉尔图小麦的抗性研究具有重要意义。; 侯文倩杜旭烨张磊郭娟谢玫瑰李小梅蒋克云; 关键词：生物信息学分析

茶树氟吸收动力学参数测定方法的研究被引量：6: 2008年; 采用常规耗竭法和改进耗竭法研究了茶树氟的吸收动力学参数,对测定和数据处理方法进行了探讨。在常规耗竭法中,茶苗在0.1、0.2mg/L和0.6mg/L的起始氟浓度条件下生长,吸收84h,每隔12h取一次营养液,通过氟的浓度差来计算吸收量;在改进耗竭法中设置氟浓度梯度0.1、0.2、0.4、0.6、0.8、1mg/L和2mg/L,茶苗吸收24h后,取营养液,通过氟的浓度差来计算吸收速率。结果表明,常规耗竭法和改进耗竭法、不同的数据处理方法所得的茶树氟吸收动力学参数值有较大差异。常规耗竭法中起始浓度对动力学参数产生了影响,因此其结果有不确定性;改良耗竭法是比较好的方法,用作图法和SigmaPlot分析的数据准确性较高,参数值较为合理。Vmax值分别为2.605(μg/g·hDW)、3.419(μg/g·hDW),Km分别为0.385mg/L和0.541mg/L。; 张磊阮建云; 关键词：茶树氟吸收动力学

普通烟草钙依赖蛋白激酶NtCDPK15的基因克隆及表达分析被引量：8: 2013年; 钙依赖蛋白激酶(CDPK)对Ca2+信号转导通路下游元件的调控具有重要作用。本实验采用同源克隆技术从普通烟草中分离得到1个CDPK基因,命名为NtCDPK15(GenBank登录号为JN662020),cDNA全长为1963 bp,ORF大小为1569 bp,编码522个氨基酸。多序列比对结果表明,NtCDPK15的编码产物具有典型的CDPK保守序列,C末端调控区有4个EF手性结构。系统进化树分析显示,NtCDPK15可能来源于绒毛状烟草,预测NtCDPK15与NtCDPK1这对旁系同源基因在功能上可能非常保守。实时荧光定量PCR分析结果表明,NtCDPK15在根和叶中的表达量显著高于茎中的表达量,但经盐胁迫诱导后NtCDPK15在茎中的表达量显著增加,同时,盐胁迫还使基因在叶中的表达量显著上调,ABA胁迫可诱导基因在根中的表达,而干旱胁迫可使基因在根和叶中的表达量下调,这些结果说明NtCDPK15在普通烟草中的表达受盐胁迫及ABA胁迫诱导,但受干旱胁迫抑制。; 康乐张丽张磊吴清章丁安明宗鹏刘贯山; 关键词：普通烟草 CDPK RACE 非生物胁迫

茄子microRNAs与其靶基因的生物信息学预测被引量：6: 2011年; microRNAs(miRNAs)是一类在真核生物中发现的长度为21 nt左右、非编码、内源性的单链小分子RNA,通过与靶基因的互补发挥转录后水平的负调控作用。目前,已在许多物种中报道了miRNAs的存在,然而还未见关于茄子miRNAs的报道。根据miRNAs在植物中的高度保守性及其前体的二级结构特征,文章通过同源预测的方法,将已知植物的miRNAs与茄子EST数据库比对,经过一系列的筛选,最终预测到12个家族的16条茄子miRNAs,其中包括3个miRNA家族的正义/反义miRNAs,而miR390和miR399家族的正义/反义miRNAs属于第一次发现。文章还通过在线软件psRNATarget预测到15条茄子miRNAs的71个靶基因,这些靶基因主要编码与茄子生长发育、新陈代谢以及胁迫响应等过程相关的蛋白。; 张磊晁江涛崔萌萌陈雅琼宗鹏孙玉合; 关键词：茄子靶基因生物信息学 EST

烟草SSR荧光标记与毛细管电泳检测技术研究被引量：23: 2011年; 将毛细管电泳荧光检测技术应用于烟草SSR标记分析,以期借助自动化、智能化的仪器设备加速对烟草遗传分析的研究进程。采用毛细管电泳荧光检测技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对9份烟草材料进行SSR位点分析,用相同的材料和引物,对这两种方法的检测结果进行比较,建立并优化了毛细管电泳荧光检测法应用于烟草SSR标记分析的技术体系。结果表明,荧光检测法克服了银染法的不足,具有简便、可靠及高通量的优点。同时对微卫星荧光标记技术中低成本、高通量多重PCR体系建立的一些技术问题进行了探讨。; 陈雅琼李凤霞李锡坤徐军张磊王绍美孙玉合; 关键词：烟草微卫星 SSR 毛细管电泳

基于SSR荧光标记分析我国主要审(认)定烤烟及白肋烟品种遗传多样性被引量：5: 2013年; 将毛细管电泳荧光检测技术应用于烟草SSR标记研究，分析我国审（认）定通过的63份烤烟与8份白肋烟种质的遗传多样性。选取36对SSR引物，共扩增产生多态性带205条。运用NTSYS-pc2．10e软件计算Dice遗传相似系数，结果显示71份烟草种质的遗传相似系数介于0．223-0．924之间，平均为0．658。表明我国审（认）定通过的烟草栽培种间的遗传基础狭窄、遗传多样性不丰富。; 陈雅琼王卫峰丁安明宗鹏李凤霞张磊孙玉合; 关键词：烟草 SSR荧光标记

普通烟草ARF基因家族序列的鉴定与表达分析被引量：12: 2016年; ARF(AUXIN RESPONSE FACTOR)基因含有一个B3功能域和具有转录激活或抑制活性的中心功能域,在植物发育过程中起到非常重要的作用。本研究采用生物信息学方法,根据拟南芥ARF基因序列鉴定了普通烟草基因组中的ARF基因,并对家族成员进行了序列特征、系统发生、亚细胞定位和表达模式分析。目前在普通烟草基因组中共得到50个ARF基因成员,其基因结构相对复杂,一般含有10个外显子。亚细胞定位结果表明,少数ARF蛋白定位到线粒体或叶绿体,大多数未检测到定位信号。转录组数据分析表明,ARF基因具有不同的组织表达模式,部分基因表现出组织特异性。这些研究结果为普通烟草ARF基因家族功能的深入研究奠定了基础。; 孙亭亭张磊陈乐龚达平王大伟陈雅琼陈蕾孙玉合; 关键词：普通烟草系统进化基因表达

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