徐鹏
- 作品数：4 被引量：142H指数：4
- 供职机构：中国科学院海洋研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学天文地球更多>>
- 用PCR法快速筛选中国对虾含微卫星的重组阳性克隆被引量：24
- 2001年
- 运用PCR法在中国对虾的小片段基因组文库中快速筛选含有微卫星序列的重组阳性克隆。PCR中使用的引物为载体pGEM - 3zf(+)上多克隆位点两侧的T7/Sp6启动子引物和根据微卫星核心重复序列设计的STR引物 :STR1:5’ -ATATATATATATAT - 3’ ;STR2 :5’ -TCTCTCTCTCTCTC - 3’。直接使用含有重组克隆的菌液 ,在PCR反应前增加一段裂解细菌的高温。筛选出来的含有微卫星序列的重组阳性克隆经DNA测序验证。结果证明 ,采用PCR方法用菌液快速筛选含有微卫星序列的重组阳性克隆完全可行 ,而且具有简便、快速、高效。
- 徐鹏周岭华相建海
- 关键词：中国对虾微卫星聚合酶链式反应重组阳性克隆PCR
- 中国对虾微卫星DNA的筛选被引量：78
- 2001年
- 于 2 0 0 0年 2月以中国科学院海洋研究所水族楼暂养的中国对虾为材料 ,采用常规方法从尾部肌肉中提取DNA ,构建小片段部分基因组文库。采用人工设计合成的 (CT) 7、(AT) 7重复片段作引物 ,利用PCR法对中国对虾小片段部分基因组文库进行筛选。本实验首次在中国对虾中获得 31个微卫星序列 ,分别分布于 1 8个阳性重组克隆中 ,其中perfect共2 3个 ,占 74% ,imperfect2个 ,占 7% ,compoundperfect 1个 ,占 3% ,compoundimperfect 5个 ,占 1 6%。结果还表明 ,在中国对虾基因组DNA中 ,(CT) n、(AT) n 形式的微卫星序列的含量非常丰富。
- 徐鹏周岭华相建海
- 关键词：中国对虾微卫星DNA基因阳性克隆
- 中国对虾微卫星标记的筛选
- 该文运用PCR法在中国明对虾（Fenneropenaeus chinensis）的小片段基因组文库中快速筛选含有微卫星序列的重组阳性克隆.利用生物信息学的方法,使用Repeatmasker软件对中国对虾ESTs数据库中1...
- 徐鹏
- 关键词：对虾微卫星微卫星标记
- 文献传递
- 从中国对虾ESTs中筛选微卫星标记的研究被引量：64
- 2003年
- 利用生物信息学方法在含有10446个中国对虾ESTs的数据库中进行微卫星序列的筛选,共发现微卫星序列229个,占整个ESTs数据库的2.19%,其中含双碱基重复序列146个和3碱基重复序列58个,分别占在ESTs数据库中发现微卫星序列总数的63.76%和25.33%,大部分发现的微卫星序列均为Perfect形式的重复序列。根据筛选得到的微卫星序列设计并合成引物19对进行多态性检测,在有扩增产物的16对引物中,首次筛选得到8个中国对虾微卫星标记,并对这些微卫星标记进行了等位基因频率、观测杂合度、期望杂合度、PIC值等统计学指标的评价。结果表明,在8个微卫星位点上,等位基因的数目从5到15不等,等位基因长度从165～305bp,期望杂合度和多态性信息含量分别为0.59到0.89和0.56到0.88,表明这8个中国对虾微卫星标记完全适合于遗传分析。
- 徐鹏周令华田丽萍相建海
- 关键词：中国对虾ESTS微卫星标记生物信息学微卫星序列等位基因频率
