文静然
- 作品数：3 被引量：4H指数：2
- 供职机构：同济大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划上海市卫生局科研基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 基于基因表达谱与系统发育树的肿瘤细胞多药耐药性表型预测
- 2010年
- 应用基因芯片技术预测抗肿瘤药物多药耐药性(multiple drug resistance,MDR)表型时,探针表达值归一化策略和特征基因集的选取往往是导致实验间结果不一致性的重要原因.从基因芯片数据出发,如何建立一个统计学上稳定的预测模型,已成为MDR表型预测建模研究中迫切需要解决的问题.本研究以多药耐药肿瘤细胞系的基因表达数据为研究对象,将探针表达定性为有无表达(1/0)两种状态,再将其归类到由蛋白质结构域组序(protein domainor ganization,PDO)定义的基因集中.在此基础上,通过引入系统发育学中的基因含量方法(gene content),在PDO基因集水平上建立了系统发育学模型(细胞树),并用于MDR表型的预测.结果显示,肿瘤细胞系的分类主要受细胞病理分型和MDR表型(紫杉醇和长春碱)的影响.系统发育学模型在预测样本的MDR表型方面优于特征基因模型.尽管本文方法的应用受到样本混杂度的限制,但其对于血液系统肿瘤或纯度较高的细胞系仍具有潜在的应用价值.
- 刘鑫奕李作峰文静然蔡青青徐烨张晓艳
- 关键词：基因芯片系统发育树肿瘤多药耐药性
- 电子数据获取系统在临床试验中的应用及展望被引量：2
- 2010年
- 临床试验是由人参加或者由人的群体参加的、与健康相关的试验，其目的在于对上市、未上市药物、装置和设备、外科干预及咨询等进行比较测试。临床试验是一个组织错综复杂的系统工程，需要参与试验的各个方面协同合作。在临床试验实施过程中，数据采集和管理是重要环节之一。
- 文静然张晓艳
- 结直肠癌伴同时性肝转移的特征性术前临床指标及预测模型被引量：2
- 2013年
- 目的:探讨结直肠癌伴同时性肝转移的特征性临床术前指标,并期基于此些指标建立预测模型。方法:1052例结直肠癌患者中以伴或不伴同时性肝转移为分组,使用信息熵增益方法筛选出特征性术前临床指标,并且使用Logistic回归方法建立预测模型;在150例患者(独立样本)中进行模型测试。结果:筛选出CEA,CA50,CA199,肿瘤部位(结肠/直肠),原发肿瘤最大径为特征性术前临床指标。以术前血清CEA及CA50值建立模型,敏感性0.82,特异性0.7342,准确率0.7423,ROC曲线下面积AUC为0.838;模型测试表现:ROC曲线下面积AUC为0.9046。结论:CEA,CA50,CA199,肿瘤部位(直肠/结肠),原发肿瘤肿瘤最大径等术前临床指标与结直肠癌伴同时性肝转移有关,以术前血清CEA及CA50值建立Logistic回归模型对其诊断有一定的帮助。
- 刘方奇文静然张晓艳徐烨
- 关键词：CEACA50
