蓝静
- 作品数：16 被引量：38H指数：3
- 供职机构：重庆市畜牧科学院更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 猪microRNA-378种子序列的多态性及应用
- 本发明涉及一种猪microRNA-378的种子序列，本发明鉴定出了猪microRNA-378种子序列中第五位A-G的突变。本发明还通过关联分析明确了microRNA-378种子序列A-G突变对猪背膘厚度产生影响的遗传效应...
- 陈磊蓝静赵久刚张亮潘红梅王可甜王金勇
- 文献传递
- 猪EIF2S3基因克隆测序及其组织表达谱分析被引量：1
- 2018年
- 【目的】克隆猪EIF2S3基因mRNA全长,并进行生物信息学分析及检测其在猪各组织中的表达特征,为研究真核翻译起始因子2(eIF2)蛋白γ亚基的生物学功能打下基础。【方法】以荣昌猪胸腺mRNA为模板,采用RCAE-PCR克隆EIF2S3基因的m RNA全长序列,在线完成各种生物信息学分析后,利用实时荧光定量PCR分析猪EIF2S3基因的组织表达特征。【结果】猪EIF2S3基因mRNA全长1813 bp,其中蛋白质编码区(CDS)长1419 bp,5'UTR区、3'UTR区分别长14和380 bp,编码472个氨基酸。EIF2S3蛋白分子量51.1 kD,理论等电点(pI)8.62,包含58个带正电的氨基酸和52个带负电的氨基酸,其前体蛋白靠近N端区域有一个强疏水区;EIF2S3蛋白的空间结构由α-螺旋、β-折叠、延伸及无规则卷曲构成。EIF2S3蛋白氨基酸序列与狗和大白鼠的相似性最高(99.6%),其次是马、猫、牛、羊和人类(99.4%),与斑马鱼的相似性最低(96.6%)。EIF2S3基因在猪的心脏、胸腺和淋巴组织中表达量较高,在脾脏和肌肉中呈中度表达,在肾脏中的表达量较低,而在肝脏中基本不表达。【结论】猪EIF2S3基因全长1813 bp,在核酸和氨基酸水平上与其他物种的EIF2S3基因高度同源,尤其与狗和大白鼠的遗传距离最近;其在猪心脏、胸腺和淋巴组织中的表达量较高,在肝脏中基本不表达,据此推测EIF2S3参与合成的蛋白更多地参与心脏泵血和免疫相关功能,基本不发挥能量代谢功能。
- 龙熙张廷焕赵久刚蓝静柴捷郭宗义王金勇张亮
- 关键词：克隆组织表达谱
- 5K防御素阳离子小肽的电泳方法初探
- ＜正＞引言防御素是一种富含半胱氨酸的阳离子抗菌肽,它在机体抵御病原入侵中起着广泛的作用。防御素分子在机体中的免疫作用体现在其直接作用并杀死细菌、真菌和病毒等病原微生物。在防御素的研究过程中,采用
- 赵久刚蓝静王金勇
- 关键词：防御素电泳方法
- 文献传递
- miR-15b靶基因预测、信号通路分析及靶基因鉴定
- 2017年
- 【目的】对miR-15b靶基因进行预测、信号通路分析及鉴定,以期为miR-15b的功能研究奠定基础.【方法】利用Target Scan Release 7.0,PicTar和PITA数据库对miR-15b靶基因进行预测,再用DAVID数据库对预测出的靶基因集进行功能富集分析(gene ontology-analysis)及信号转导通路富集分析(KEGG pathway analysis).随后利用双荧光素酶报告试验对预测出miR-15b的靶基因丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)和CD28进行验证.【结果】3个软件共同预测出miR-15b的靶基因有305个,其靶基因集合功能富集于蛋白激酶活性、GTP结合蛋白调控等分子功能,蛋白氨基酸磷酸化、细胞周期调控等生物学过程及微管相关复合体、转录因子复合体等细胞组分上.信号转导通路则显著富集于癌症相关信号通路.双荧光素酶报告实验结果显示CD28为miR-15b的靶基因,而PDK4不是miR-15b的靶基因.【结论】miR-15b在细胞增殖、凋亡和细胞周期调控等过程中发挥重要调控作用,且miR-15b通过调控CD28的表达对T细胞的受体激活发挥调控作用.
- 孙文阳蓝静陈磊闫尊强王金勇滚双宝
- 关键词：生物信息学
- 重庆地区某规模化猪场猪圆环病毒2型的PCR检测被引量：4
- 2013年
- 为了研究重庆地区某规模化猪场猪圆环病毒2型(PCV-2)的感染现状和不同猪种、不同生长阶段猪群的感染情况,试验采用PCR技术对来自重庆地区某规模化猪场的430份猪血清进行检测。结果表明:PCV-2总阳性率为4.65%(20/430);长白猪PCV-2的感染率为12.50%(4/32),明显高于总阳性率(4.65%);初生猪PCV-2的感染率为0(0/67),明显低于总阳性率。说明此规模化猪场存在PCV-2的感染且在不同猪种和不同阶段猪群有较大差异。
- 田家伟吴霞张亮赵久刚赵久刚潘红梅谌秀潘红梅郭宗义张凤鸣蒋曹德
- 关键词：猪圆环病毒2型PCR检测规模化猪场
- 荣昌猪胸腺素β15A(TMSB15A)cDNA全长克隆、序列信息及组织表达分析被引量：2
- 2017年
- 旨在克隆荣昌猪TMSB15A基因全长,检测该基因在荣昌猪各组织中的表达特征,并对其基因的结构与功能进行分析。本研究利用RCAE(Rapid-amplification of cDNA ends)-PCR以及RT-PCR(Real-time quantitative PCR)技术克隆荣昌猪TMSB15A基因mRNA全长序列以及检测该基因在荣昌猪各组织中的表达特征。结果表明,荣昌猪TMSB15A基因全长654bp,其中CDS区长138bp,编码45个氨基酸,5′UTR和3′UTR分别长86和430bp。生物信息学分析表明,TMSB15A蛋白的理论分子量为5.2ku,有10个带负电的氨基酸,9个带正电的氨基酸,蛋白理论等电点为5.3;预测TMSB15A蛋白无疏水区、信号肽结构、跨膜结构域,其主要在细胞质中发挥生理功能;TMSB15A蛋白的三级结构由α-螺旋和无规则卷曲构成。TMSB15A基因编码的氨基酸序列与人、长臂猿以及黑猩猩的同源性最高,为97.8%,其次是骆驼和兔,为93.3%,与马的同源性最低,为11.1%。TMSB15A在荣昌猪免疫相关组织脾和胸腺中表达量最高(P<0.01),在淋巴结和肺中呈中等丰度表达,在心、肝、肾和肌肉中表达量较低。本试验为研究TMSB15A基因的功能奠定了基础,也为荣昌猪抗病育种研究提供了理论支撑。
- 龙熙蓝静蓝静王金勇郭宗义
- 关键词：RACE基因克隆
- 不同双糖组合对猪精子冷冻保存效果的影响被引量：14
- 2015年
- 为了评价不同的双糖(乳糖、蔗糖和海藻糖)添加于卵黄基础稀释液中对猪精子的冷冻保护作用,实验采用了7个冷冻保护液配方,其中第一个配方为前期实验筛选得到的乳糖卵黄稀释液(LEY),将蔗糖和海藻糖以不同的比例完全或部分替代第一个配方中的乳糖成分而获得另6个配方。精子冻后质量评价活力、顶体完整率、低渗肿胀率及畸形率等指标。结果表明,当稀释液中只添加乳糖时(LEY液,A组),猪精子的冻后活力最低;当用蔗糖或海藻糖部分替代或完全替代乳糖时,猪精子冻后各项指标都有所改善。当33.3%的乳糖和66.7%的蔗糖进行组合(F组)时,猪精子冻后活力达37.0%±2.6%,显著优于其他各组(P<0.05),其他各项指标也显著高于单一的乳糖组(A组)。研究结果表明,将不同双糖以不同比例组合添加于猪精液冷冻保护液后,以33.3%的乳糖和66.7%的蔗糖的组合(F组)对猪精液冷冻保护的效果最好。
- 潘红梅张亮蓝静张利娟涂志王娟郭宗义
- 关键词：猪精子冷冻保存乳糖蔗糖海藻糖
- 哺乳母猪舍饲散养的研究进展与问题
- 2017年
- 动物福利越来越成为现代养猪业关注的话题,如何选择合适的饲养模式,在提高动物福利的同时能保证从业者的经济效益是养猪业长期以来不断探索的问题之一。文章介绍欧美国家近20年来哺乳母猪舍饲散养的研究进展与存在的问题,供国内养猪同行参考。
- 潘红梅蓝静陈东
- 关键词：哺乳母猪动物福利
- 用于快速鉴定猪的红黑毛色基因的核酸、试剂盒及方法
- 本发明提供了一种用于快速鉴定猪的红黑毛色基因的核酸、试剂盒及方法，其核酸包括红毛特异性引物、黑毛特异性引物和下游通用引物，其中，所述红毛特异性引物的序列如SEQ ID No.1所示，所述黑毛特异性引物的序列如SEQ ID...
- 蓝静赵久刚陈磊陈四清张廷焕王可甜郭宗义谢佳嫦曾莉
- 5个重庆地方猪种遗传多样性的微卫星分析被引量：13
- 2010年
- 为了分析5个重庆地方猪种的遗传多样性和系统发生关系,采用FAO-ISAG联合推荐的27个微卫星标记,以有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量等遗传参数为指标,评估了品种内遗传变异。计算了F统计量、Nei氏遗传距离(DA)和Nei氏标准遗传距离(DS)并进行UPGMA和NJ聚类分析及主成分分析,进而探讨了品种间的遗传分化和亲缘关系。结果,27个微卫星座位共检测到542个等位基因,其中43个等位基因为单一品种所特有。5个猪种的遗传多样性丰富:有效等位基因数(Ne)在9.4933～11.0280之间,期望杂合度(He)在0.8897～0.9091之间,多态信息含量(PIC)在0.8689～0.8926之间。F统计量分析表明,重庆地方猪种遗传分化明显(P<0.001),各群体内存在一定程度的近交。2种聚类方法以NJ法更为可靠。5个猪种聚为两类,荣昌猪、渠溪猪和合川猪为一类,罗盘山猪和盆周山地猪为一类。相关性分析表明,遗传距离与地理距离间无显著的相关(P>0.05)。该研究结果为重庆地方猪种的保护和利用提供了重要的理论依据。
- 白小青范首君王金勇刘文郭宗义何道领陈四清王可甜付文贵陈磊赵久刚蓝静张亮
- 关键词：地方猪种微卫星标记聚类分析
