赵立平
- 作品数：193 被引量：1,642H指数：26
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学环境科学与工程更多>>
- 多重RT-PCR检测猪传染性胃肠炎病毒和猪流行性腹泻病毒被引量：18
- 2005年
- 为了检测、区分猪传染性胃肠炎 (TGE)和猪流行性腹泻 (PED) ,建立了同时检测这 2种疾病病原体的多重 PCR方法。参考 Gen Bank登录的 TGEV和 PEDV纤突蛋白 S基因序列 ,经 DNAsis 2 .0比较分析 ,分别筛选出 TGEV、PEDV S基因相对保守区。以 TGEV TH- 98株 (Gen Bank登陆号为 AF4 94 337)和 PEDV CV777株 (Gen Bank登陆号为 NC0 0 3436 )为参考模板 ,利用软件 Primer 3设计合成了 2对寡核苷酸引物 ,以 ST细胞培养的 TGEV和 PEDV毒株核酸为模板 ,利用所设计的 2对引物进行多重 RT- PCR扩增 ,结果同时得到与试验设计相符的 4 99bp(TGEV)和199bp(PEDV)的扩增条带 ,而对其他 3种猪病原的扩增结果均为阴性。敏感性试验结果表明 ,建立的多重 RT- PCR方法可检测出 10 pg TGEV RNA和 10 0 pg PEDV RNA。
- 陈芳刘惠莉孙红立曹祥荣李震赵立平
- 关键词：TGEV猪流行性腹泻病毒猪传染性胃肠炎病毒RT-PCR检测纤突蛋白
- 肠道菌群与代谢病-从相关到因果,从基础到临床
- 近年来，积极推动系统生物学理念在微生物生态学领域特别是人体肠道菌群研究中的应用，注重发展用代谢组学和元基因组学相结合的方法研究肠道菌群在肥胖、糖尿病等复杂疾病中的作用，并积极探讨用肠道菌群的整体结构变化来监测人体健康变化...
- 赵立平
- 可用于微生物群落分子生态学研究的活性污泥总DNA提取方法研究被引量：113
- 2002年
- 活性污泥样品经液氮速冻、沸水浴融化、溶菌酶处理和 SDS裂解后 ,99%以上细胞裂解。所提取的 DNA经琼脂糖凝胶电泳检测和荧光法浓度测定 ,其片断大小在 2 0 kb左右 ,产量可达 1 .75 6± 0 .1 mg/g MLSS。样品 ABS2 6 0 nm/ABS2 80 nm的比值为 1 .96± 0 .2。以提取的总 DNA为模板 ,进行细菌核糖体小亚基 1 6Sr DNA基因 V3区和多组分苯酚羟化酶大亚基基因 (Lm PHs)的 PCR扩增 ,均获得成功 ,为活性污泥中微生物群落的分子生态学研究提供了一种简便、可靠的 DNA提取方法。
- 高平平赵立平
- 关键词：微生物群落分子生态学研究环境微生物
- 黑小麦麦麸戊聚糖的提取、纯化与组成分析被引量：10
- 2010年
- 对黑小麦麦麸戊聚糖进行提取、纯化及组成分析。分别以H2O、Ba（OH）2和Na（OH）2为提取介质，提取水溶性和水不溶性戊聚糖；采用（NH4）2SO4分级沉淀、乙醇分级沉淀、凝胶过滤柱层析等方法纯化戊聚糖粗提物，分析其得率和组成。结果表明：水提组分（WEP）主要由葡萄糖（Glc）、阿拉伯糖（Ara）和木糖（Xyl）组成，是β-葡聚糖（79％）和戊聚糖（21％）的混合物。NaOH碱提组分（AEP—Na）中Ara和Xyl含量相对较高，以戊聚糖为主要组成（71％），还含有29％的β-葡聚糖。Ba（OH）：碱提组分（AEP—Ba）主要由阿拉伯糖（Ara）和木糖（Xyl）组成，舍有较纯的戊聚糖（96％）。WEP经35％饱和（NH4）2S04溶液沉淀后，戊聚糖含量由纯化前的21％提高到35％。AEP—Na经DEAE—Sepharose CL-6B柱层析．分级组分AEP—Nal的单糖组成的物质的量比，即n（Ara）：n（Xyl）：n（Glc）=0．7：1：1．2，其中戊聚糖的n（Ara）／n（Xyl）=0．7。AEP—Ba经不同浓度乙醇沉淀分级组分的戊聚糖主要由Ara和Xyl组成。其n（Ara）／n（Xyl）在0.38～1．02之间，且Ara的取代度随着乙醇浓度的增加而增大。
- 孙元琳李文多张生万刘惠芳赵立平
- 关键词：黑小麦戊聚糖Β-葡聚糖纯化
- 分析比较微生物群落结构的监测方法
- 一种微生物生态学领域的监测方法，具体是一种分析比较微生物群落结构的监测方法。具体如下：选定一对LP－RAPD引物，长度15－24bp，(G+C)含量50％；环境样品中混合微生物总基因组DNA的提取；LP－PCR循环反应，...
- 赵立平魏桂芳
- 文献传递
- 大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)肠道菌群结构分子生态学研究
- 大熊猫是中国本土的国家一级保护动物,现今世界上总共存活的数量不到1,500只。大熊猫主要以竹子为食,然而其肠道结构却与食肉类动物的结构类似,简单的胃、盲肠已经退化,结肠短而简单。那么,大熊猫是如何以食肉类动物的简单的胃肠...
- 魏桂芳鲁海峰林志新赵立平
- 关键词：大熊猫肠道微生物菌群结构OTU
- 文献传递
- 一种人肠道菌群的发酵方法和应用
- 本发明提供了一种人肠道菌群的发酵方法和应用，所述方法包括如下步骤：a.筛选供体：12‑14岁男孩，身体健康，无重大疾病史，无明显胃肠道症状，至少6个月内未服用过任何抗生素，生活规律；b.样本采集和处理：采集供体的新鲜粪便...
- 庞小燕赵立平付鑫超
- 文献传递
- 肠道硫酸盐还原菌DGGE分析技术的建立被引量：2
- 2013年
- 目的建立分析肠道内硫酸盐还原菌(Sulfate-reducing bacteria,SRB)组成的变性梯度凝胶电泳(Denaturing gra-dient gel electrophoresis,DGGE)技术,并用于分析10例健康人粪便样品中的SRB组成。方法从GenBank中下载13株脱硫弧菌科细菌的腺苷酰硫酸还原酶α亚基基因(aprA)的序列,利用Clustal X、Simulated PCR(SPCR)软件比较、评估了2对针对aprA基因的引物(AprA-3-FW/APS-RV和AprA-1-FW/AprA-5-RV)用于扩增粪便样品中的SRB的特异性。确定PCR引物和条件,进一步摸索并建立DGGE分析体系。结果 Clustal X和SPCR软件分析的结果均表明引物AprA-3-FW/APS-RV优于AprA-1-FW/AprA-5-RV。实际PCR的结果也显示AprA-1-FW/AprA-5-RV扩增效率低并有非特异扩增。建立DGGE体系,对10例健康人肠道中SRB的分析显示,每个个体肠道中SRB的种类有1到5种不等。结论基于aprA序列的DGGE技术是分析肠道SRB组成的有效方法。
- 刘辰雷殷晓晨龙文敏费娜赵立平庞小燕
- 关键词：硫酸盐还原菌DGGE肠道菌群
- 中药复方葛根芩连汤治疗2型糖尿病过程中的肠道菌群结构变化被引量：12
- 2015年
- 2014年10月国际微生物生态学会会刊ISMEJ（影响因子9．267）在线发表了中国中医科学院广安门医院仝小林教授课题组与上海交通大学生命科学技术学院赵立平教授课题组合作完成的研究——“中药复方葛根芩连汤（GQD）治疗2型糖尿病（T2DM）过程中的肠道菌群结构变化”。这是一项随机、双盲、安慰剂对照的临床研究，首次在人群试验中观察了GQD在治疗T2DM过程中患者肠道菌群的变化及其与糖尿病改善的关系。
- 赵立平徐佳
- 关键词：2型糖尿病肠道菌群中药生命科学技术
- 大港孔店油田水驱油藏微生物群落的分子分析被引量：42
- 2005年
- 通过多聚酶链式反应 温度梯度凝胶电泳(PCR TGGE)和构建16SrRNA基因克隆文库两种方法对比研究了大港油田孔二北断块注水井和采油井的微生物群落结构。16SrDNAV3区PCR扩增产物的TGGE图谱分析表明,这两个油井的微生物群落结构差异很大。注水井样品的TGGE图谱中有6条主要条带,而采油井样品中只有一个条带占绝对优势。同时,建立了两个样品的16SrRNA基因克隆文库,从中分别挑选了10 8和5 0个克隆进行限制性酶切片段长度多样性分析(ARDRA)。注水井样品有33个操作分类单元(OTU) ,其中6个OTU是优势类型;而采油井样品只有8个OTU ,有1个OTU在文库中占绝对优势。克隆文库和TGGE的研究结果一致,均表明注水井样品的微生物多样性比采油井丰富很多。每个OTU的代表克隆序列分析结果表明,注水井样品中的细菌主要属于α、β、γ变形菌纲和放线菌纲,尤其是红细菌亚纲( 4 7% )。采油井样品的细菌主要属于α、β、γ变形菌纲,尤其是假单胞菌属( 6 2 % )。
- 佘跃惠张学礼张凡王凌华赵立平
- 关键词：油藏RRNA基因TGGE克隆文库微生物群落
