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钟莉: 作品数：11 被引量：11H指数：1; 供职机构：中国科学院上海生命科学研究院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程国家高技术研究发展计划更多>>; 相关领域：生物学医药卫生更多>>

合作作者

1.粘细菌遗传因子、复制和遗传操作系统;2.中草药植物内生放线菌、抑菌活性和内源质粒: 本研究分为两个部分。第一部分研究了粘细菌遗传因子，包括天然质粒、噬菌体和染色体复制区OriC。粘细菌不仅具有多细胞行为还能产生很多新颖结构的次生代谢产物。然而，几十年来由于缺乏能够在粘细菌中进行自主复制的质粒...; 钟莉; 关键词：遗传操作系统药用植物放线菌抑菌; 文献传递

小葱植物内生链霉菌线型质粒pYY8L的端粒与复制区的克隆和鉴定: 2010年; 从小葱植物中分离到一株编号为36R-2-1B的链霉菌菌株,该菌株含有一个约为280kb的线型质粒pYY8L。【目的】克隆、测序和分析pYY8L新的端粒和复制区。【方法】采用改良的"在凝胶中进行DNA碱处理与酶切"的方法来克隆大的线型质粒pYY8L的端粒,通过构建基因组柯斯文库和次级克隆的方法来缩小和鉴定pYY8L的复制区。【结果】在小葱植物内生链霉菌36R-2-1B中检测到约为280kb的线型质粒pYY8L,克隆了pYY8L的端粒。其末端的152bp包含6个小的回文序列,可以形成复杂的二级结构。利用柯斯文库构建、次级克隆和测序获得了4891bp的pYY8L的复制区。该复制区含有6个基因,其中2个与天蓝色链霉菌线型质粒SCP1的复制基因非常相似,但是邻近的重复序列不同。【结论】采用新的改良的方法克隆和鉴定了pYY8L新的端粒和复制区。本文首次报道了植物内生链霉菌线型质粒的端粒和复制基因。; 杨勇钟莉田新莉成秋香陈振华覃重军; 关键词：链霉菌线型质粒端粒

通过构建“大小染色体”高效敲除大肠杆菌基因组的方法: 本发明公开了一种通过构建“大小染色体”高效敲除大肠杆菌基因组的方法。此外，利用本发明，在回补了已知生存必需基因而不能敲除基因组中对应的区域时，通过进一步的将该区域细分，可以定位出可能存在的新的生存必需基因或调控元件。; 覃重军薛小莉姜鹏王韬邵洋洋周敏钟莉沈美娟; 文献传递

青蒿植物内生链霉菌中的质粒pCQ4与噬菌体ΦCQ4被引量：1: 2012年; 【目的】在青蒿植物的内生链霉菌W75中检测到一个大的环型质粒pCQ4。克隆、测序、分析和功能研究pCQ4。【方法】Southern杂交确定质粒的酶切图谱,利用接合转移和同源重组方法将质粒克隆到了大肠杆菌BAC衍生的载体上,并进行鸟枪测序和分析。【结果】获得了全长为84833 bp的pCQ4序列,预测编码129个基因,其中成簇的40个基因与其它噬菌体的基因同源。实验证明含有质粒pCQ4的菌株能够低频率释放噬菌体ФCQ4,并可以侵染消除了pCQ4的W75X孢子和形成噬菌斑。在透射电镜下观察到噬菌体颗粒,脉冲场凝胶电泳显示ФCQ4为线型DNA。pCQ4与已发表的链霉菌质粒-噬菌体pZL12比对,编码噬菌体的主要结构蛋白的基因是相似的。【结论】链霉菌大的质粒pCQ4也可以转化为噬菌体ФCQ4,其噬菌体相关的基因簇可能是可转移的单元。; 成秋香钟莉覃重军; 关键词：链霉菌质粒噬菌体

链霉菌小质粒pDYM4.3k的复制与接合转移被引量：1: 2012年; 【目的】链霉菌(Streptomyces)X335是从西藏高原活拉山口分离到的,其中含有一个大小为4.3 kb的环型质粒pDYM4.3k。克隆、测序和分析pDYM4.3k,以及鉴定复制和接合转移的基因。【方法】通过克隆和引物延伸获得pDYM4.3k的全序列,利用比对分析推测基因的功能,通过Southern杂交检测复制中间体,利用平板杂交实验证明接合转移功能。【结果】克隆和测序获得了全长为4346 bp的pDYM4.3k序列,预测仅有3个基因,其中1个基因与链霉菌主要接合转移基因同源,另外2个为功能未知。鉴定新的基因orf1及其上游的约300 bp构成了质粒的基本复制区域。检测到质粒存在单链的复制中间体,表明它以滚环方式进行复制。实验证明pDYM4.3k在变铅青链霉菌(Streptomyces lividans)中具有接合转移功能。【结论】质粒pDYM4.3k可以滚环方式进行复制和在链霉菌之间进行接合转移。这是目前报道的最小的、具有游离复制和接合转移功能的链霉菌质粒。; 周敏代玉梅钟莉覃重军; 关键词：链霉菌质粒

通过构建“大小染色体”高效敲除大肠杆菌基因组的方法: 本发明公开了一种通过构建“大小染色体”高效敲除大肠杆菌基因组的方法。此外，利用本发明，在回补了已知生存必需基因而不能敲除基因组中对应的区域时，通过进一步的将该区域细分，可以定位出可能存在的新的生存必需基因或调控元件。; 覃重军薛小莉姜鹏王韬邵洋洋周敏钟莉沈美娟; 文献传递

拟诺卡氏菌线型质粒pNPL1的测序和分析被引量：1: 2014年; 【目的】检测和分析稀有放线菌中新的线型质粒。【方法】从植物内生菌中分离链霉菌之外的放线菌菌株,检测、测序和分析线型质粒。【结果】从中草药植物紫花前胡的叶片中分离到一株内生放线菌25L-1-1c,经过16S rRNA基因序列比对属于拟诺卡氏菌。从该菌株中检测到一个约25 kb的线型质粒pNPL1。克隆和测序了pNPL1新的端粒,含有多个小的回文序列。测序获得全长为24 621 bp的线型质粒pNPL1,预测编码22个基因,其中2个基因与链霉菌质粒的端粒复制基因同源,1个基因与链霉菌质粒主要的接合转移基因相似,其余19个基因为未知功能。携带pNPL1端粒复制基因的质粒不能转化变铅青链霉菌,暗示需要发展拟诺卡氏菌的遗传操作系统。【结论】这是首次在拟诺卡氏菌中发现和描述线型质粒。; 田新莉钟莉覃重军; 关键词：线型质粒测序

西藏土壤中分离的链霉菌含有丰富的线型和环型质粒: 2012年; 【目的】研究极端自然环境对链霉菌线型和环型质粒分布的影响。【方法】从西藏高原采集了20份土壤样品,分离和初步鉴定链霉菌,提取和检测质粒DNA。【结果】从中分离到46株链霉菌,其中有23株菌含有1 4个线型质粒,大小在19 650 kb之间,8个菌株含有1 4个环型质粒,大小在4 80 kb之间。【结论】西藏土壤来源的链霉菌含有大量的、多样的线型质粒和环型质粒,暗示极端环境中诸如强紫外辐射等可能会引发DNA损伤和修复,进而造成质粒的多样性。; 代玉梅杨勇范云周敏沈美娟钟莉蔡晓布覃重军; 关键词：链霉菌线型质粒

内生放线菌和寄主植物的抑菌活性及其关系被引量：1: 2008年; 从68种中草药植物中分离了560株内生放线菌菌株,其中84株(约占15%)对金葡菌有抑菌活性,36株(约6%)对白念珠菌有抑菌活性,提示中草药植物的内生放线菌可能是抗菌新药的一个来源。检测了9种中草药植物的水或乙醇抽提液对金葡菌的抑菌活性,发现内生放线菌菌株的抑菌活性与其寄主植物没有明显的对应关系。; 钟莉田新莉周敏王韬成秋香陈振华范云覃重军; 关键词：内生放线菌抑菌活性