陈亮宇
- 作品数：10 被引量：22H指数：3
- 供职机构：大连理工大学更多>>
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- 相关领域：生物学轻工技术与工程更多>>
- 基因组挖掘技术在海洋放线菌天然产物研究开发中的应用及展望被引量：7
- 2013年
- 利用微生物的基因组信息预测其合成特定天然产物的潜能,进而进行新化合物分离纯化和结构鉴定的基因组挖掘技术,已经成为国内外研究的热点,并在多种细菌和真菌的天然产物发现中得到成功应用。本文综述了基因组挖掘技术的最新进展,包括生物信息分析和结构预测、基因组指导的天然产物的发现、沉默基因的激活和异源表达技术等,以及我国学者开发的转录组挖掘技术,并重点综述了影像质谱技术在基因组挖掘中的应用。目前对海洋放线菌进行基因组挖掘的研究还比较少,而基因组挖掘技术的发展,将极大地促进对海洋放线菌天然产物的发现和鉴定。未来除了充分挖掘可培养微生物的基因组,对未培养微生物宏基因组的挖掘将进一步深入。此外,除了开发利用基因组中合成天然产物的结构基因和调节基因,还应该充分开发利用其他不同的遗传元件,包括不同转录活性和响应不同环境条件和信号的启动子,以及具有调节作用的RNA等。
- 陈亮宇王玉梅赵心清
- 关键词：海洋放线菌基因簇
- 一株烷源戈登氏菌株及其降解油类的应用
- 一株烷源戈登氏菌株及其降解油类的应用，属于生物技术领域。该菌株S104分离自大连海泥样品中,2010年10月12日保藏于中国普通微生物菌种保藏中心，保藏号为4224。该菌株S104为革兰氏阳性菌，菌体为棒状，经16S r...
- 赵心清王玉梅陈亮宇陈德玲方文晶
- 文献传递
- 天然抗补体活性物质研究进展被引量：10
- 2015年
- 补体系统的非正常激活可引起人体的多种疾病,包括类风湿性关节炎和老年性痴呆等,但目前还没有较好的抗补体制剂。化学合成的抗补体制剂成本高、选择性差、并能产生多种副作用,天然产物来源的抗补体活性成分引起了国内外学者的普遍关注。迄今为止,已经从动植物及微生物中分离出多种具有抗补体活性的物质,包括多糖、黄酮、甾体、皂苷、萜类、生物碱等。本文对近年来天然产物中具有抗补体活性的成分进行了综述,由于微生物易于培养及基因工程改良,而且产品质量容易控制,来自微生物的抗补体活性物质值得关注。
- 徐小娜陈亮宇赵心清
- 关键词：抗补体活性补体抑制剂皂苷萜类
- 光对海洋放线菌代谢物合成的影响及关键菌株基因组挖掘
- 由于海洋环境的特殊性，海洋放线菌可能具有独特的代谢特征，其合成的次生代谢物是多种新天然产物和活性物质的重要来源，因此，利用海洋放线菌生产次生代谢物得到了国内外研究者的广泛关注。已知多种环境条件可影响放线菌合成次生代谢物，...
- 陈亮宇
- 关键词：海洋放线菌次生代谢物菌株筛选
- 文献传递
- 一种海洋链霉菌卤化酶基因及其产物,以及其修饰产物的生物合成基因簇
- 本发明涉及基因工程领域。本发明公开一种海洋链霉菌卤化酶基因核苷酸序列，其特征为（a）含有SEQ ID NO.1所示核苷酸序列的核酸和SEQ ID NO.2所示氨基酸序列；和（b）与（a）所述核酸具有至少75％序列相同性、...
- 赵心清杨天虹王玉梅陈亮宇
- 文献传递
- 利用基因组挖掘技术研究星海链霉菌的生物合成潜能
- 本实验室在前期研究中分离鉴定了一株新的海洋放线菌，命名为星海链霉菌并进行了全基因组测序。通过比对分析，预测了4个NRPS合成基因簇以及4个PKS类化合物生物合成基因簇。其中，通过一个相似度达到86％的卤化酶sinH,确定...
- 陈亮宇徐小娜王玉梅赵心清
- 关键词：生物合成基因组
- 文献传递
- 基因组信息指导的星海链霉菌中2-甲硫基-N^6-(4-羟基异戊烯基)-腺苷的分离鉴定
- 2016年
- 【目的】研究海洋链霉菌新种星海链霉菌Streptomyces xinghaiensis NRRL B24674~T次级代谢物中是否存在2-甲硫基-N^6-异戊烯基修饰的腺苷。【方法】通过生物信息学分析星海链霉菌S.xinghaiensis NRRL B24674~T基因组序列,寻找这类化合物的生物合成相关基因;采用正相硅胶柱色谱、反相硅胶柱色谱、凝胶柱色谱和高效液相色谱等分离技术对该菌株的发酵粗提物进行分离纯化;利用质谱与核磁共振等波谱技术鉴定化合物的结构。【结果】在星海链霉菌基因组中找到含有2-甲硫基-N^6-异戊烯基修饰的化合物生物合成途径中的2个同源蛋白;从该菌的发酵液中分离鉴定了2-甲硫基-N^6-(4-羟基异戊烯基)-腺苷(ms2io6A)。【结论】星海链霉菌S.xinghaiensis NRRL B24674~T存在此类腺苷修饰反应,并且是首次在链霉菌中发现此类腺苷修饰。生物信息学分析预示着链霉菌中可能普遍存在此类核酸或者核苷修饰。
- 王晓庆王晓政陈亮宇赵心清黄婷婷林双君
- 具有抗补体活性海洋放线菌的筛选及其活性物质的分离被引量：2
- 2018年
- 抗补体活性物质研究对开发相关药物、治疗多种补体过度或非正常激活引起的疾病具有重要意义,然而目前微生物来源的抗补体活性物质研究还非常有限.利用溶血法对从大连星海湾海泥样品中分离出来的42株海洋放线菌进行抗补体活性测试,并利用C18柱色谱层析及Sephadex LH-20凝胶柱层析,对具有较好抗补体活性的菌株DUT11的次生代谢产物进行分离纯化和结构鉴定.结果显示:菌株S187、M5、S088、M8、S063、DUT11和MD16在TSB培养基中发酵后发酵液提取物和菌丝体提取物均具有较好的抗补体活性,其中菌株DUT11的抗补体活性为最强. DUT11在M33培养基中发酵后所产生的次生代谢产物的抗补体活性最强,其发酵液和菌丝体提取物的活性分别为56.5%和60.8%.进一步分离得到3个具有微弱抗补体活性的小分子化合物,分别鉴定为3-吲哚甲酸(1)、对羟基苯甲酸(2)和2-吡咯甲酸(3).本研究表明在大连星海湾海泥样品中存在多种可产生抗补体活性物质的海洋链霉菌,产生的抗补体活性化合物活性较强,结果可为进一步开发利用海洋放线菌提供新的思路,为研究新型抗补体活性化合物奠定基础.
- 徐小娜崔浩天陈亮宇苏春白凤武赵心清
- 关键词：海洋放线菌抗补体活性次生代谢产物分离纯化
- 一株烷源戈登氏菌株及其降解油类的应用
- 一株烷源戈登氏菌株及其降解油类的应用，属于生物技术领域。该菌株S104分离自大连海泥样品中，2010年10月12日保藏于中国普通微生物菌种保藏中心，保藏号为4224。该菌株S104为革兰氏阳性菌，菌体为棒状，经16SrD...
- 赵心清王玉梅陈亮宇陈德玲方文晶
- 星海链霉菌抑菌活性物质的分离纯化被引量：5
- 2011年
- 星海链霉菌(Streptomyces xinghaiensis)是从大连星海湾海泥样品中分离的海洋链霉菌新种,其发酵液具有广谱抗菌活性。研究该菌株的发酵液对临床分离的耐药菌的抑制活性,发现星海链霉菌发酵液对鲍曼不动杆菌和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌菌株具有抑制活性。采用SPE、大孔吸附树脂HP-20、葡聚糖凝胶Sephadex LH-20、HPLC、TLC等对抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的物质进行了活性追踪,发现活性物质为弱碱性水溶性成分,无特征紫外吸收,可被茚三酮显色,推断活性物质可能为氨基糖苷类化合物。对星海链霉菌基因组序列进行初步分析,发现一个与核糖霉素生物合成基因簇相似性较高的基因簇,但TLC分析结果表明,活性化合物与核糖霉素不同。
- 张姗姗赵心清陈亮宇杨天虹张凤华
- 关键词：分离纯化氨基糖苷类抗生素
