霍蕊
- 作品数：11 被引量：35H指数：5
- 供职机构：海南大学海洋学院热带生物资源教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：“十一五”国家科技支撑计划国家自然科学基金海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 基于Cyt b基因序列研究6种裸胸鳝属鱼类的进化关系被引量：9
- 2009年
- 为探讨中国南海裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼类系统发育关系,采用PCR扩增产物克隆到T载体后进行序列测定,获得黄边裸胸鳝(Gymnothorax flavimarginatus)、斑点裸胸鳝(G.meleagris)、波纹裸胸鳝(G.undulatus)、云纹裸胸鳝(G.chilospilus)、匀斑裸胸鳝(G.reevesi)5种裸胸鳝的线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cyt b)基因全序列1140bp。结合GenBank中的蠕纹裸胸鳝(G.kidako)Cyt b同源序列进行比较分析,结果表明:(1)1140个位点中共有367个核苷酸位点存在变异(32.2%);(2)序列变异的转换/颠换比值平均为3.223;云纹裸胸鳝和斑点裸胸鳝遗传距离差异最大,为0.226;(3)以花鳗鲡(Anguilla marmorata)为外群,采用NJ法和MP法构建系统发育树,在所分析的6种裸胸鳝属鱼类中,斑点裸胸鳝和波纹裸胸鳝聚为一支,位于系统树的基部位置,其余4种聚为另外一支。蠕纹裸胸鳝样本来源于日本海,其余5种裸胸鳝来源于中国南海,从系统树上来看,它们之间并没有明显的地域差异。
- 杜民齐兴柱尹绍武霍蕊张本陈国华
- 关键词：细胞色素B基因
- 波纹唇鱼的核型和线粒体全基因组结构分析
- 波纹唇鱼(Cheilinus undulates)隶属鲈形目(Percifomaes)、隆头鱼科(Labridae)、唇鱼属(Cheilinus)，自1996年至2005年间曾四度被世界自然保护联盟(IUCN)、世界自然...
- 霍蕊
- 关键词：波纹唇鱼核型线粒体基因组种质资源
- 文献传递
- 一种改进的线粒体基因组全序列测定方法
- 本发明公开了一种在常规PCR技术基础上改进了的线粒体基因组全序列测定方法，目的是提供一种成本低，实验技术简单而且快速的线粒体基因组全序列测定新方法。本发明的特征在于模板的筛选和PCR引物的设计，确定了能作为模板的近缘物种...
- 尹绍武齐兴柱陈国华张本骆剑霍蕊
- 文献传递
- 中国南海海鳝科部分鱼类的分子系统学研究
- 齐兴柱尹绍武陈国华王永强胡文婷霍蕊
- 该项目收集了16种海鳝科鱼类，利用三种分子标记基因序列(COII、16SrDNA和Cytb)开展了分类及系统进化研究，在Genbank上注册40多个相关序列，将海南周围海域的海鳝科裸胸鳝属鱼类大致分为3个大的类群，并支持...
- 关键词：
- 关键词：基因序列
- 波纹唇鱼染色体核型分析被引量：12
- 2009年
- 为了解波纹唇鱼(Cheilinus undulates)的细胞生物学特征,采用植物血凝集素PHA、秋水仙素腹腔注射和空气干燥制片法以头肾组织为材料,对波纹唇鱼的染色体核型进行了研究。结果表明,波纹唇鱼具有染色体48条,核型公式为2n=48=6m+42t,NF=54,未发现随体、次溢痕及性染色体,其核型符合典型的高位类群鱼类核型特征。
- 霍蕊张本陈国华尹绍武王世锋齐兴柱
- 关键词：染色体核型
- 基于线粒体细胞色素b基因序列的中国南海裸胸鳝的分子系统进化关系研究
- 海鳝科裸胸鳝属鱼类（Gymnothorax）广泛分布于全世界的热带和亚热带海域。通常以体表颜色、斑点、花纹以及齿型等主要形态特征对裸胸鳝属鱼类进行形态学分类鉴定。本文通过测定线粒体细胞色素b基因的全长序列（1140bp）...
- 尹绍武齐兴柱杜民霍蕊陈国华张本
- 关键词：线粒体DNA细胞色素B系统进化关系
- 文献传递
- 基于mtDNA-COⅡ基因序列对中国南海裸胸鳝属鱼类分子系统进化关系的研究被引量：8
- 2010年
- 采用聚合酶链式反应直接测序法,获得细斑裸胸鳝、黄纹裸胸鳝、云纹裸胸鳝、黑点裸胸鳝、褐裸胸膳5种裸胸鳝属鱼类的细胞色素氧化酶Ⅱ（cytochrome oxidaseⅡ,COⅡ）基因序列（691 bp）。结合GenBank上蠕纹裸胸鳝COⅡ同源序列,采用多个生物软件对6种裸胸鳝属鱼类序列变异和碱基组成进行分析,共发现196个核苷酸位点存在变异（28.36%）;计算了它们的相对遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,6种裸胸鳝属鱼类的序列差异为0.012~0.199,其中云纹裸胸鳝与褐裸胸鳝的序列差异最大,为0.199,细斑裸胸鳝与黄纹裸胸鳝序列的差异最小,为0.012;总体来说,序列中的转换明显多于颠换,转换和颠换的比值（Ts/Tv）为2.7;以长鳝为外群构建NJ、ME、MP系统树,长鳝分为独立的一支,6种裸胸鳝为另外一支,分为3个平行进化的分支。
- 齐兴柱尹绍武张本霍蕊杜民
- 关键词：系统进化
- 4种裸胸鳝的分子遗传多样性和亲缘关系的RAPD分析被引量：7
- 2013年
- 采用29个随机引物,对海南近海及西沙的野生群体黄边裸胸鳝(Gymnothorax flavimarginatus)、云纹裸胸鳝(Gym-nothorax chilospilus)、波纹裸胸鳝(Gymnothorax undulatus)及细斑裸胸鳝(Gymnothorax fimbriatus)的基因组DNA进行了RAPD分析,并用UPGMA法对这4种裸胸鳝进行聚类分析。研究结果表明:(1)黄边裸胸鳝、云纹裸胸鳝、波纹裸胸鳝及细斑裸胸鳝4种裸胸鳝群体内遗传多样性都较高,其多态位点比率分别为68.65%、57.00%、50.80%、67.42%,平均杂合度分别为0.222 1%、0.207 4%、0.166 6%、0.221 2%,表明南海野生裸胸鳝遗传变异水平较高,种质资源状况良好;(2)4种裸胸鳝种间遗传距离及聚类分析表明,黄边裸胸鳝与细斑裸胸鳝遗传距离最近(0.340 6);黄边裸胸鳝与云纹裸胸鳝的次之(0.386 8);云纹裸胸鳝与波纹裸胸鳝的最远(0.531 2)。(3)在7个引物中,有区分云纹裸胸鳝、波纹裸胸鳝及细斑裸胸鳝的特异性片段,可用于这些裸胸鳝的鉴定。
- 杜民尹绍武刘艳红牛宝珍齐兴柱张本廖经球霍蕊
- 关键词：分子遗传多样性亲缘关系RAPD分析
- DNA分子标记在我国海水养殖动物遗传育种中的应用被引量：2
- 2008年
- DNA分子标记是以脱氧核糖核酸多态性为基础的遗传标记。本文综述了DNA分子标记技术在环节动物、软体动物、甲壳动物、鱼类等我国海水养殖动物中遗传多样性和遗传结构分析、亲缘关系鉴定、品系家系鉴别、构建遗传连锁图谱、数量性状定位等方面的应用。指出了目前DNA分子标记在海水养殖动物遗传改良和辅助育种等研究领域存在的问题,最后对该领域的研究提出展望,以期为海水养殖动物遗传育种研究提供参考。
- 霍蕊尹绍武齐兴柱
- 关键词：DNA分子标记海水养殖动物遗传育种
- 中国裸胸鳝属10种鱼类分子系统发育关系的16S rDNA分析被引量：5
- 2013年
- 为了阐明南中国海裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼类系统进化情况,利用聚合酶链式反应扩增目的产物,将其连接到T载体后,并对其序列进行测定,共得到9种裸胸鳝属鱼类线粒体16S ribosomalDNA(16S rDNA)基因的部分序列,采用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算了Kimura2-parameter遗传距离,转换/颠换比等遗传信息指数,下载基因库中16S rDNA基因的同源序列,以鳗鲡属(Anguilla)的花鳗鲡(Anguilla marmorata)为外群构建NJ(Neighbore-Joining)、MP(MaximumParsimony)和ME(Minimum Evolution)系统进化树。根据所得分子数据并结合形态学特征推论如下:(1)在所研究的10种裸胸鳝鱼中共有516个位点、其中143个核苷酸位点存在变异(27.7%);(2)序列变异的转换/颠换比值的平均值为3.441;相对遗传距离数据表明斑颈裸胸鳝(G.margaritophorus)和网纹裸胸鳝(G.reticularis)差异最大(0.177),褐祼胸鳝(G.hepaticus)与布雷顿氏裸胸鳝(G.breedeni)差异最小(0.022);(3)NJ树、ME树表明裸胸鳝属内部存在3个平行进化的姐妹分支,分支内部的种类组成与地理分布无关。
- 杜民尹绍武刘艳红牛宝珍齐兴柱张本廖经球霍蕊
- 关键词：RDNA基因
