古文鹏
- 作品数:40 被引量:169H指数:8
- 供职机构:云南省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项国家公益性行业科研专项中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- 昆明2014-2015年腹泻儿童杯状病毒分子流行病学研究被引量:6
- 2015年
- 目的 了解杯状病毒在昆明的分子流行病学特征,为预防和控制腹泻提供科学的参考依据.方法 收集云南省第一人民医院和昆明市儿童医院2014年7月至2015年6月5岁以下腹泻患儿的粪便标本321份,采用RT-PCR的方法检测杯状病毒,并选取部分阳性扩增产物经序列测定分析其基因型.结果 321份粪便标本中HuCV的阳性率为10.59%(34/321),感染无明显的季节性,检出率在患者性别和年龄组间的差异均无统计学意义;34份HuCV阳性标本中以NoV为主,占94.12% (32/34),其中绝大多数为GⅡ型(31/32,96.88%),仅1株为GⅠ型;SaY共2株,占5.88%(2/34),分别为GⅠ型和GⅡ型.结论 HuCV是昆明地区5岁以下腹泻患儿的重要病原体之一,GⅡ.4/Sydney2012株是流行优势株.
- 李颖颖古文鹏张顺先向以斌杨景晖周晓芳伏晓庆李利徐闻
- 关键词:杯状病毒腹泻分子流行病学
- 昆明地区2018-2020年腹泻患者中艰难梭菌感染特征分析
- 2023年
- 目的对2018-2020年昆明地区腹泻患者中艰难梭菌感染特征进行分析,为后续监测和防治提供数据支持。方法收集2018-2020年云南省4家哨点医院腹泻患者粪便标本共388份,使用实时荧光定量PCR方法进行艰难梭菌粪便毒素基因检测,对结果阳性的粪便标本进行菌株的分离,用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱鉴定菌株。提取分离菌株的基因组DNA进行多位点序列分型(MLST)。分析毒素阳性和菌株分离阳性与患者的临床特征以及艰难梭菌阳性与其他病原共感染的情况。结果388份粪便标本中,艰难梭菌内参tpi基因阳性标本47份,总阳性率为12.11%。其中,非产毒艰难梭菌4份(8.51%),产毒艰难梭菌43份(91.49%)。47份阳性标本分离得到18株艰难梭菌,阳性标本的分离率为38.30%。其中tcdA、tcdB、tcdC、tcdR和tcdE基因均为阳性的菌株14株。18株艰难梭菌的二元毒素均为阴性。所有分离菌株的MLST结果共形成10种序列型(ST),其中ST37型5株(27.78%);ST129、ST3、ST54和ST2型各2株;ST35、ST532、ST48、ST27和ST39型各1株。粪便毒素基因阳性(tcdB+)结果与患者年龄、就诊前发热差异有统计学意义;菌株分离阳性仅与患者年龄差异有统计学意义。同时,部分腹泻患者存在艰难梭菌与其他腹泻病毒共感染的情况。结论昆明地区腹泻患者中艰难梭菌的感染多为产毒株,MLST结果具有高度的离散特征,应加强开展艰难梭菌的监测和预防。
- 李桂满古文鹏侯敏贾森泉王媛媛白璐璐尹建雯周永明伏晓庆卢金星吴媛
- 关键词:艰难梭菌腹泻毒素基因多位点序列分型共感染
- 一起由B群沙门菌污染聚餐食品所致食物中毒调查分析被引量:9
- 2018年
- 目的调查一起农村婚宴聚餐引起食物中毒的致病因子、致病食品及其污染来源,采取有效措施控制事件蔓延,预防今后类似事件的发生。方法开展现场流行病学调查,制定病例定义并主动搜索病例,采用描述流行病学方法分析本次事件病例的流行病学特征。通过个案调查访谈,对参加聚餐的108人开展病例对照研究,分析可能的致病食品。现场勘查和访谈厨师,了解婚宴菜品的制作过程、原料来源和所用水源等,并采集病例肛拭子、婚宴剩余食品、饮用水样进行实验室检测。结果本次食物中毒罹患率为21.6%(138/640),临床表现以腹泻、腹痛、发热为主。单因素分析结果显示94.4%(51/54)的病例和66.7%(36/54)的对照食用过由灌肚、里脊肉片、炸排骨、萝卜丝四种食品组成的凉菜拼盘,食用凉菜拼盘增加发病风险(比值比=8.50, 95%置信区间:2.32~31.02)。叉生分析结果显示同时食用拼盘中两种以上凉菜将增加发病风险(比值比=9.25, 95%置信区间:2.46~34.82)。4份病例肛拭子和1份凉菜拼盘中灌肚均检出B群沙门菌。5株检出的沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)指纹图谱为同一带型,提示病例和食品分离株在分子水平具有高度的同源性,为同一暴露源。结论本次事件是一起由B群沙门菌污染聚餐食品导致的食物中毒。凉菜拼盘是主要的致病食品,食品加工卫生环境与制作过程不规范操作是导致本次食物中毒发生的危险因素。当前农村自办宴席仍存在诸多食源性疾病发生的风险环节,应加强监管。
- 韦蝶心常利涛常利涛郝林会古文鹏徐闻古文鹏徐然
- 关键词:食源性疾病农村聚餐潜伏期脉冲场凝胶电泳
- 耶尔森菌致病机理研究被引量:3
- 2010年
- 古文鹏景怀琦
- 关键词:小肠结肠炎耶尔森菌假结核耶尔森菌鼠疫耶尔森菌短小杆菌
- 云南省首例人感染猪链球菌病的病原学分析被引量:11
- 2012年
- 目的对猪链球菌菌株进行鉴定,了解其病原学特征。方法对菌株进行了菌落形态、生化鉴定、血清凝集、PCR检测、16S rRNA细菌种属鉴定、PFGE检测和MLST分型。结果菌落形态、生化鉴定、血清凝集、16S rRNA细菌种属鉴定,证明此菌株为猪链球菌2型;经PCR检测16SrRNA和毒力基因均为阳性;PFGE检测结果表明此株菌同3株参考菌株相似性很低;MLST分型属于高致病性ST1型。结论此次分离到菌株的为云南省首例人感染的猪链球菌2型,是强毒力株。
- 尹建雯徐闻古文鹏曹亿会杨建斌伏晓庆
- 关键词:猪链球菌2型PCRPFGEMLST
- 实验树鼩肠道螺杆菌属细菌特征分析被引量:2
- 2020年
- 近年来,树鼩(Tupaia belangeri)作为一种新型的实验动物被广泛应用于生物医学研究的各个领域。本研究组前期的研究结果显示,螺杆菌属(Helicobacter)是树鼩肠道微生物群落中相对丰度最高的一类细菌,但其具体的细菌种类和结构特征仍然不清楚。因此,本研究将开展实验树鼩肠道中螺杆菌属细菌的分布种类和特征分析,为后续实验研究工作提供资料。通过系统采集72只树鼩的粪便样本,提取核酸后采用巢氏PCR法应用属特异性引物扩增螺杆菌属特异性片段,再分别采用7个种特异性引物对属特异性阳性样本扩增螺杆菌种特异性片段,包括肝螺杆菌(H.hepaticus)、家鼠螺杆菌(H.muridarum)、胆汁螺杆菌(H.bilis)、啮齿类螺杆菌(H.rodentium)、弯曲螺杆菌(Flexispira rappini)、鼩螺杆菌(H.suncus)和盲肠螺杆菌(H.typhlonius)。属特异性引物扩增阳性但种引物扩增阴性的样本进行核酸序列测定和BLAST比对分析,确认其最终所属的螺杆菌种类。结果显示,72份树鼩粪便样本中,属特异性引物扩增阳性有18份,总体阳性率为25.0%。其中,盲肠螺杆菌阳性8株、胆汁螺杆菌阳性6株,其余8份阳性样本经过测序和BLAST比对分析后确认为同性恋螺杆菌(H.cinaedi)阳性5株、猫螺杆菌(H.felis)阳性2株和猕猴螺杆菌(H.macacae)阳性1株。有4份树鼩粪便样本出现同时携带盲肠螺杆菌和胆汁螺杆菌的情况。将螺杆菌属细菌携带结果与实验树鼩的性别和年龄组进行比较分析后发现,不同性别间以及不同年龄组间,属或种阳性样本情况均无差异(P>0.05)。本研究结果表明,实验树鼩具有较高的螺杆菌携带率,且不分性别和年龄,主要以盲肠螺杆菌、胆汁螺杆菌和同性恋螺杆菌为主。
- 古文鹏古文鹏贾杰邱丹丹阮蕾颖李娜李娜仝品芬
- 关键词:PCR
- 云南省宁蒗县地震灾区震后重点传染病风险评估分析被引量:3
- 2013年
- 目的分析云南省宁蒗县地震灾区震后重点传染病的发生、传播风险及影响,为震区灾后传染病防控工作提供依据。方法收集并分析2007-2012年(截至6月24日)震前灾区的甲乙丙类传染病疫情数据;通过风险评估常用方法分析地震灾害对灾区传染病发生、传播可能产生的影响并对灾区重点传染病的发生和传播划分风险等级,提供防控建议。结果2007至2012年,宁蒗县主要报告病种为乙型病毒性肝炎和肺结核;其次是流行性腮腺炎、甲型病毒性肝炎和细菌性痢疾。综合评估判定细菌性痢疾和感染性腹泻在灾区发生局部暴发或流行的风险极高;甲肝、伤寒副伤寒和流行性感冒在灾区发生和流行的风险为中等至较高;肺结核、麻疹、风疹、手足口病、流行性腮腺炎风险为低至中等。结论灾后重点防控的疾病是肠道传染病,其次是呼吸道传染病。
- 伏晓庆古文鹏董毅张正飞赵建全张绪红杨军
- 关键词:地震传染病风险评估
- 致病性小肠结肠炎耶尔森菌生物血清型1B/O:8和2/O:9不同温度培养条件下相关抗原和蛋白质组学比较研究
- 小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica)是广泛存在于自然界的一种引起一系列肠道疾病的革兰氏染色阴性菌,是能在冷藏温度下生长的少数肠道致病菌之一。在许多国家已经证实由小肠结肠炎耶尔森菌引起的感染...
- 古文鹏
- 健康从业人员中产ESBLs鼠伤寒沙门氏菌的研究
- 2022年
- 目的研究健康服务从业人员中鼠伤寒沙门氏菌的耐药情况。方法分离来自某区健康体检的鼠伤寒沙门氏菌,通过商品化ESBLs培养基的筛选,用微量肉汤法、PCR和PFGE分型法分析菌株耐药情况。结果从60533名健康服务从业人员肛拭标本中分离得到的68株鼠伤寒沙门氏菌,其中6株检出ESBLs酶,检测出blaCTX-M-14和blaTEM-1,6株均为多重耐药菌,且分子分型不同于病例菌株。结论健康人群中检出含β-内酰胺酶基因的鼠伤寒沙门菌,且耐药性复杂,应加强对健康服务从业人员携带鼠伤寒沙门氏菌的监测,严控饮食卫生,开展预警,防止耐药鼠伤寒沙门氏菌感染发生。
- 尹建雯贾森泉周永明古文鹏赵智娴
- 关键词:鼠伤寒沙门氏菌Β-内酰胺酶多重耐药
- 一种传染病疫情传播监测系统
- 本发明涉及适用于特定应用领域的信息通信技术技术领域,尤其涉及一种传染病疫情传播监测系统,其包括设施层、接入层、处理层以及应用层;设施层与接入层通过安全套接字协议连接,接入层与处理层建立数据连接,处理层与应用层建立数据连接...
- 陈莉华高胡兴孙众古文鹏陈蕊