吕彦霞
- 作品数:3 被引量:2H指数:1
- 供职机构:浙江大学更多>>
- 发文基金:浙江省重点科技创新团队项目国家级星火计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 植物NAC转录因子的研究进展
- NAC转录因子是植物最大的转录因子家族之一,并广泛存在于各种各样的陆生植物中。这类转录因子在调控植物生长发育、响应逆境胁迫及激素信号转导过程中都起着非常重要的作用。研究表明,NAC转录因子还受microRNA和蛋白水平的...
- 吕彦霞张海娟张梅余小林
- 关键词:NAC转录因子生长发育逆境胁迫
- 文献传递
- 基于梨EST和基因组序列SSR引物的批量开发与应用被引量:2
- 2015年
- 目前基于梨属植物基因组开发的SSR引物太少,远不能满足其品种鉴别、遗传多样性分析和分子标记辅助育种等研究与应用的需要。为进一步开发更多的梨SSR引物,本研究从NCBI公共数据库检索到梨的4 338条ESTs和478条基因组序列。通过前处理和聚类去冗余后得到全长为343.81 kb的无冗余的686条ESTs,搜索获得725个SSRs,其平均长度为17.34 bp。在一至九个核苷酸的重复基元中,其主要类型是单核苷酸重复和二核苷酸重复,两者所占的比例分别为84.44%和10.34%。BLASTx同源性比较分析发现,上述686条ESTs中305条在数据库中可以找到同源序列,占ESTs总数的44.46%,功能已知蛋白质中碧桃来源的ESTs所占比例最大,为41.37%。GOA功能分类结果表明,293条ESTs可划分为生物过程、分子功能和细胞成分3大功能类,其中与细胞过程相关的ESTs数量最多,为103条。序列分析结果显示,EST-SSRs与基因组SSRs的平均检出频率分别为2 108.74 loci/Mb和91.11 loci/Mb,两者具有显著的差异。本研究基于梨的EST和基因组序列,应用MISA批量开发技术分别获得了111对EST-SSR引物和291对基因组SSR引物,随机抽取及合成11对引物的验证结果表明,开发得到的SSR引物在梨属植物中具有较好的通用性。
- 吕彦霞吕彦霞孙志栋王芳展余小林
- 关键词:SSREST分子标记
- 白菜MtN3/saliva/SWEETs基因家族的鉴定及BcNS的功能分析
- MtN3/Saliva/SWEETs domain又称为PQ loop repeat,它包括一对重复,每个横跨两个跨膜螺旋,由一个loop连接。MtN3/Saliva/SWEETs基因家族进化过程中非常保守的,普遍存在于...
- 吕彦霞
- 关键词:白菜