员涛
- 作品数：8 被引量：44H指数：5
- 供职机构：西南林业大学更多>>
- 发文基金：国家林业公益性行业科研专项国家自然科学基金云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 基于叶绿体片段序列的杨属系统发育关系分析被引量：6
- 2015年
- 以旱柳为外类群,对杨属5个派32个种及杂种63份个体叶绿体DNA(cpDNA)的rbc L-a、psb I-psb K、psb A-trn H、trn L-F序列片段进行系统发育分析。结果表明,4个片段联合后的序列长为2·416 bp,G+C含量为34.1%,含32个信息位点数。最大简约法(MP)和最大似然法(ML)构建的系统进化树的树形一致,白杨派和大叶杨派能各自聚类为单独分支,而青杨派树种被聚分为2组,显示出多系起源的特征。其中,三脉青杨、青杨、大青杨、辽杨为第1组,位于系统树的基部,与胡杨形成姐妹种关系,其余青杨派树种为第2组,与大叶杨亲缘关系较近。黑杨派中的钻天杨和北京杨与同派其他树种差异明显,但与白杨派树种具有同源性,MP和ML的支持率分别为95%和91%,其余黑杨派树种高度同源,以100%的MP和ML支持率呈姐妹群。该研究结果为杨属树种的起源与系统进化关系提供了分子水平的证据。
- 员涛李佳蔓周安佩颜璐茜纵丹李旦何承忠
- 关键词：杨属叶绿体DNA片段序列系统发育
- 基于cpDNA和rDNA ITS片段分析西南地区青杨派杨树的系统发育与进化关系被引量：5
- 2015年
- 西南地区青杨派杨树种质资源丰富,可为杨树遗传改良提供珍贵的基因资源,但树种之间形态学差异细微,该研究以山杨作为外类群,测定了西南地区及其他地区杨属青杨派17个种（杂种）共36份样本的3个叶绿体片段（atpF-atpH、trnL-F和matK）和核糖体ITS片段,并对其进行系统发育分析,以探讨西南地区青杨派树种的系统进化关系。结果表明：（1）在所有样本中,3个叶绿体片段atpF-atpH、trnL-F、matK的长度分别为605~634bp、957~1 010bp、819bp,3个片段拼接后的联合序列包含29个变异位点和15个信息位点;ITS片段对齐后的长度为646bp,变异位点19个,信息位点17个。（2）基于叶绿体联合序列和ITS片段的杨属青杨派树种的平均遗传距离分别为0.001 3和0.003 6。叶绿体联合片段的MP和Bayes系统树树型基本一致,青杨派树种可以划分为2组,第1组由青杨、三脉青杨、大青杨和辽杨构成;第2组中的小叶杨、小青杨、川杨、德钦杨、昌都杨、乡城杨、康定杨、西南杨、滇杨和藏川杨不能有效区分,且均与缘毛杨的遗传关系较近。（3）基于ITS的系统树与叶绿体联合片段构建的系统树差异不大,仅在于第2组中的小青杨与小叶杨、川杨等差异明显,与第1组中的树种紧密聚拢。
- 李佳蔓员涛周安佩纵丹李旦何承忠
- 关键词：青杨派系统发育
- 马缨杜鹃不同完整性居群遗传多样性的AFLP分析被引量：5
- 2014年
- 采用选择性扩增片段多态性（AFLP）技术对马缨杜鹃5个不同完整性居群的遗传多样性进行检测和分析。结果表明：筛选出的7对引物组合共扩增出527条带，其中多态带382条，多态带百分率为72.49%；5个居群间的多态性百分率在52.23%～69.64%之间，居群平均多态性百分率为57.80%；Nei’s基因多样性变化范围在0.1139～0.1738之间，Shannon信息指数为0.1868～0.2777；居群间遗传分化系数Gst为0.1688，表明83.12%遗传变异发生在居群内，居群间基因流为2.4624，足以维持居群间现有的遗传结构；AMOVA分析结果表明，18.34%的遗传变异存在于居群间，81.66%的遗传变异存在于居群内；基于UPGMA聚类结果，可将5个马缨杜鹃居群分为3组，紫溪山和板凳山居群、马雄山和小营地居群之间各为一组，老湾地居群独自一组。研究表明，该物种有些居群虽遭受严重的人为破坏，但居群的遗传多样性仍然较高。
- 纵丹员涛李佳蔓周安佩胡世俊何承忠
- 关键词：马缨杜鹃居群AFLP标记
- 地理隔离对西南藏区山杨居群遗传结构影响的SRAP分析被引量：5
- 2015年
- 采用SRAP分子标记技术,对分布于我国西南3个藏族地区山杨9个居群130个个体进行了遗传结构分析。结果表明,筛选出的7对引物组合共检测到多态性条带(AP)99条,多态性条带百分比(PPB)为59.28%。采用POPGENE软件分析,山杨9个居群平均多态位点百分率(PPB)为33.80%,Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)分别为0.130 9和0.213 7,较东北地区山杨具有偏低的遗传多样性。遗传分化系数Gst=0.325 5,表明遗传变异主要存在于居群内个体间。地理距离与遗传距离之间具有弱相关关系(r=0.349,P=94.5%),山脉阻隔效应是导致西南藏族地区山杨居群间遗传分化的主要因素。UPGMA聚类表明,甘孜地区4个居群与迪庆地区的维西居群具有较近的亲缘关系,迪庆地区的德钦、香格里拉居群和昌都地区2个居群的遗传相似度较高。基于西南藏族地区山杨遗传结构分析,建议实施就地保护的同时,建立山杨种质资源库,促进不同居群间的基因交流。
- 何承忠李佳蔓员涛纵丹周安佩欧光龙尹五元
- 关键词：山杨SRAP标记地理隔离
- 滇杨遗传多样性的SRAP分析被引量：9
- 2016年
- 采用SRAP标记分析滇杨的遗传多样性和遗传结构。用筛选出的7对引物组合分析来自7个居群共208个样本,共扩增得到条带146条,多态性条带73条,多态带百分率为50%。滇杨物种水平上的观测等位基因数(Na)为1.500 0,有效等位基因数(Ne)为1.230 9,Nei’s基因多样性指数(H)与Shannon’s信息指数(I)分别为0.136 6与0.210 0。遗传分化系数(Gst)为0.529 4,基因流(Nm)为0.444 4,表明居群间的遗传变异大于居群内,其基因交流处于中等水平。AMOVA分析也表明居群间的变异占总变异的55.61%。UPGMA、PCo A和Bayesian聚类分析结果一致,均显示丽江与曲靖居群、楚雄与昭通居群的亲缘关系较近。Mantel test结果表明滇杨居群间的遗传距离与地理距离不相关。
- 颜璐茜李佳蔓员涛周安佩纵丹李旦辛培尧何承忠
- 关键词：滇杨SRAP标记
- 滇杨倒置插穗的生长素极性运输被引量：4
- 2015年
- 生长素是唯一具有极性运输的内源激素,在植株生长发育过程中发挥着重要的调控作用。为探讨倒置插穗在生根发芽过程中生长素的极性运输规律,以滇杨1年生根萌苗主干制作插穗,分别正向放置和倒向放置后进行水培,采用高效液相色谱法(HPLC)测定正置、倒置插穗不同部位树皮与侧芽内生长素(IAA)和脱落酸(ABA)含量的动态变化。结果表明,不同时期滇杨正置、倒置插穗树皮和侧芽内IAA和ABA总含量的动态变化规律存在差异,极性对倒置插穗的生理生化活性有一定的影响。滇杨正置插穗树皮和侧芽内IAA的运输符合极性运输规律。倒置插穗分别在21 d和28 d之前,其树皮和侧芽内IAA的运输符合极性运输规律,即从形态学上端(插穗的下端)向形态学下端(插穗的上端)运输;之后,倒置插穗内重新建立了IAA的运输方向,即从形态学下端(插穗的上端)向形态学上端(插穗的下端)运输。正置与倒置插穗不同部位树皮和侧芽内ABA的含量从上到下依次递增,运输规律遵循向重力性。研究结果初步表明:滇杨倒置插穗内IAA的极性运输可能会发生逆转。
- 李佳蔓员涛王军民郑元周安佩纵丹何承忠
- 关键词：滇杨生长素极性运输
- 滇杨优树遗传多样性的AFLP分析被引量：10
- 2014年
- 以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条带174条,多态带百分率为64.52%,检测到有效等位基因数(Ne)为1.184,基因多样度(H)为0.121,Shannon信息指数为0.201,平均遗传相似系数为0.877;对56份杨树样本共扩增出325条带,其中多态性条带共247条,多态带百分率为75.21%,检测出有效等位基因数(Ne)为1.185,基因多样度(H)为0.122,Shannon信息指数为0.209,平均遗传相似系数为0.876。UPGMA聚类分析结果显示,除滇杨优树QXB007与QXJ030外,其余杨树分析样本均能够被鉴别。基于采集地和遗传相似系数的模糊聚类分析表明,52株滇杨优树除开远采集地外,丽江采集地样本与其他采集地样本之间均有交集,说明丽江可能是滇杨的分布中心和起源中心。该研究结果为滇杨人工选择育种、遗传改良、种质资源收集与保存等提供了理论依据。
- 纵丹员涛周安佩刘东玉郑元段安安何承忠
- 关键词：AFLP遗传相似系数UPGMA聚类分析
- 西南地区乡土杨树遗传变异的SRAP分析被引量：10
- 2015年
- 采用SRAP分子标记技术对西南地区11种乡土杨树共333份样本的遗传变异进行分析,7对引物组合共扩增出215条带,其中多态性条带158条,多态性条带百分率为73.49%,表明11种乡土杨树间存在广泛变异。AMOVA分析结果显示,种间遗传变异分量为10.84,占总变异的48.70%,遗传差异达极显著水平（P〈0.001）。种间的遗传相似系数变幅在0.8199~0.9607之间,平均遗传相似系数为0.8983。聚类结果表明,昌都杨和藏川杨之间的遗传差异最小,大叶杨和三脉青杨之间的遗传差异最大。本研究结果为西南地区乡土杨树基因资源的保护、开发和利用提供了一定的科学理论依据。
- 员涛颜璐茜李佳蔓周安佩纵丹李旦于雷何承忠
- 关键词：乡土杨树SRAP标记
