孙蓓丽
- 作品数：17 被引量：18H指数：2
- 供职机构：东南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项广东省“十五”攻关项目更多>>
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- 可脱保护的硫代核苷酸单体
- 可脱保护的硫代核苷酸单体涉及到化学基团修饰的硫代核苷或核苷酸分子，修饰硫代核苷或核苷酸分子的化学基团在一定条件下能够转变成羟基，并能被用于多聚核苷酸序列的分析，该硫代核苷或硫代核苷酸单体分子结构为：<Image file...
- 陆祖宏罗俊峰肖鹏峰孙蓓丽贾超
- 文献传递
- 脯氨酸脱氢酶基因单核苷酸多态性与偏执型精神分裂症的关联研究被引量：2
- 2009年
- 目的:探讨脯氨酸脱氢酶(PRODH)基因单核苷酸多态性(SNP)与偏执型精神分裂症的关系。方法:应用聚合酶链反应技术及聚丙烯酰胺凝胶芯片技术对中国广东潮汕地区汉族276例偏执型精神分裂症患者与100例正常对照者的PRODH基因4个(2026、1945、1766、1852)SNP位点进行基因型检测,并对分型结果进行测序鉴定。结果:联合统计发现,PRODH基因的4个位点的单倍型频数两组分布差异有统计学意义(P<0.05)。结论:PRODH基因多态性与偏执型精神分裂症存在关联,PRODH基因可能通过多个多态位点相互作用影响了偏执型精神分裂症的发病风险。
- 孔凡芝洪晓虹王常青彭志珍程璐孙蓓丽
- 关键词：偏执型精神分裂症单核苷酸多态性
- 三维聚丙烯酰胺凝胶DNA芯片用于大样本单核苷酸多态分型的方法研究
- 2009年
- 目的建立三维聚丙烯酰胺凝胶DNA芯片用于大样本单核苷酸多态（single nucleotide polymorphisms，SNP）分型的方法。方法丙烯酰胺基团修饰的PCR产物与丙烯酰胺单体混合后，在丙烯酰胺基团修饰的玻片上点样进行共聚合，建成三维凝胶DNA阵列；芯片与一对特异探针和一对分别标记了Cy3或Cy5的通用序列标签（Tag1和Tag2）进行杂交；杂交后用施加电场的方法去除非特异吸附和错配，最后通过双色荧光共聚焦扫描进行SNP分型。结果3-D凝胶芯片不但具有很高的固定效率，而且可以提供高效的杂交环境；通用序列标签的使用不需对每个位点都标记荧光，使检测成本大幅降低；外加电场使得单碱基错配容易识别，且能显著降低芯片的信噪比。结论基于3-D凝胶的基因芯片技术用于大样本SNPs分型简单易操作，且高通量、高特异性、低成本，该方法将可以更广泛地应用于不同需求的DNA检测中。
- 程璐肖鹏峰孙蓓丽葛芹玉陆祖宏
- 关键词：DNA芯片单核苷酸多态
- 一种基于细长反应腔的RNA转录组分析方法
- 本发明公开了一种基于细长反应腔的RNA转录组分析方法，包括将RNA反转录扩增反应体系注入细长型的反应腔中，完成对目标RNA转录组的捕获和放大。细长形的反应腔体将RNA反转录反应体系相对分隔于一个细长的反应腔中，各微观反应...
- 涂景黄梦婷刘文丽陆祖宏孙蓓丽
- 文献传递
- 基于聚丙烯酰胺凝胶微阵列的冠心病相关SNPs关联性分析
- 本文采用了一种具有自主产权的新型聚丙烯酰胺凝胶芯片进行单碱基多态性（SNP）分型检测的方法,对氧化低密度脂蛋白受体1（OLR1）基因上两个SNP位点与冠心病相关性进行了研究。聚丙烯酰胺凝胶因其特殊的三维网状结构,能高效率...
- 孙蓓丽程璐肖鹏峰陆祖宏
- 关键词：生物芯片聚丙烯酰胺凝胶冠心病
- 文献传递
- 一种基于移动切割内切酶的DNA结合蛋白检测方法
- 一种基于移动切割内切酶的DNA结合蛋白检测方法针对被测的DNA结合蛋白的识别序列设计一段双链核酸探针，其中一条单链5’端标记一个连接基团1并固定到固相载体表面2，另一条单链5’端标记一个信号分子6；在含有待测蛋白的识别位...
- 白云飞王进科张定东孙蓓丽葛芹玉陆祖宏
- 文献传递
- 神经型烟碱乙酰胆碱受体α7亚单位基因多态性与精神分裂症的关联研究被引量：8
- 2007年
- 目的:探讨神经型烟碱乙酰胆碱受体α7亚单位基因(CHRNA7)多态性与精神分裂症的关系。方法:采用聚合酶链反应及聚丙烯酰胺凝胶芯片技术检测精神分裂症患者(223例)与正常对照者(98例)CHRNA7基因3个(rs2337980、rs1909884、rs883473)单核苷酸多态性位点,并对分型结果进行测序鉴定。结果:两组rs1909884基因型及等位基因频率分布差异有统计学意义(P<0.05),对照组有较多的变异等位基因T。结论:CHRNA7基因rs1909884多态性可能与精神分裂症有关联,其等位基因T可能是精神分裂症的保护性因子。
- 彭志珍万晓娜蒋廷云程璐孙蓓丽洪晓虹
- 关键词：精神分裂症单核苷酸多态性
- 基于信号组合编码的DNA连接测序方法
- 本发明基于信号组合编码的DNA连接测序方法，涉及一种采用信号组合编码的DNA连接测序方法，属于生物技术领域。本发明的特征在于连接测序反应中的信号编码，实现了利用相同数量标记物，在一次连接反应中同时检测标记物的指数量的碱基...
- 涂景陆祖宏白云飞葛芹玉孙蓓丽
- 文献传递
- 基于信号组合编码的DNA连接测序方法
- 本发明基于信号组合编码的DNA连接测序方法涉及一种采用信号组合编码的DNA连接测序方法，属于生物技术领域。本发明的特征在于连接测序反应中的信号编码，实现了利用相同数量标记物，在一次连接反应中同时检测标记物的指数量的碱基类...
- 涂景陆祖宏白云飞葛芹玉孙蓓丽
- 文献传递
- 潮汕地区食管癌患者O^6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶基因多态性的分析被引量：8
- 2006年
- 背景与目的初步研究中国食管癌高发区之一潮汕地区食管癌患者和正常人群O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)基因编码84、143及160位密码子的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)。材料与方法应用双色荧光杂交微阵列技术分别检测潮汕地区100例食管鳞状细胞癌患者及65例健康对照外周血MGMT基因84位密码子(C2740214T)单核苷酸多态性;用同样的方法检测76例食管鳞状细胞癌患者和50例健康对照MGMT基因143位密码子(A2798995G)、160位密码子(G2799046A)单核苷酸多态性。结果基因型分布符合Hardy-Weinberg定律。统计分析显示食管鳞状细胞癌组与对照组84位密码子2740214C和2740214T等位基因频率差异无统计学意义(P=0.402),2740214CT基因型在病例组和对照组中所占的比例分别为16%和12.3%,2740214TT基因型在病例组中所占的比例是2%。食管鳞状细胞癌组变异基因型拥有者(CT+TT)高于对照组,但差异无统计学意义(P=0.327),2740214TT基因型仅见于个别肿瘤患者,而在正常对照中未发现。143位密码子A2798995G位点仅在对照组中发现一例杂合子,其余均为野生型纯合子,病例组与对照组基因型和等位基因频率差异均无统计学意义。160位密码子G2799046A位点检测在所有的病人和对照中均为野生型纯合子。结论潮汕地区食管鳞状细胞癌患者和正常人群中存在MGMT基因多态性,84位密码子C2740214T位点的突变型纯合子仅见于肿瘤患者,可能与食管鳞状细胞癌有关。
- 刘淑慧苏敏程璐孙蓓丽陆祖宏
- 关键词：单核苷酸多态性杂交食管癌
