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克雷伯菌16S rDNA和rpoB基因系统进化及序列特征分析被引量：5: 2009年; 目的比较分析克雷伯菌属的种之间16S rDNA和rpoB系统进化发育关系和序列进化特征。方法选取经生化鉴定的克雷伯菌18株，提取菌株染色体作为模板，分别使用16S rDNA和rpoB通用引物扩增并测序16S rDNA和rpoB序列。与GenBank中目前已公布的8种克雷伯属菌株16S rDNA和rpoB序列各8条、除克雷伯菌外其他肠道菌株的16S rDNA和rpoB序列各9条一起，共计各35条16S rDNA和rpoB序列，在MEGA4．0中建立进化树并进行分群分析，使用DNAStar／MegAlign程序比较分析8种克雷伯菌的种间16S rDNA和rpoB序列变异碱基位点，并做分歧度分析。结果在所有受试的16SrDNA和rpoB的各35条序列中，16S rDNA和rpoB进化发育树都将克雷伯菌区分为3个群：分离的18株克雷伯菌中，15株肺炎亚种与GenBank中除产酸克雷伯菌和运动克雷伯菌外的其余6种克雷伯菌聚为一群（Ⅰ），其余3株克雷伯菌（FX246、FX280和FX286），经生化鉴定为产酸克雷伯菌，与GenBank中产酸克雷伯菌（DQ835530）聚为一群（Ⅱ）；而GenBank中的运动克雷伯菌单独聚为一群（Ⅲ）；进一步的分析，在rpoB进化发育树中，无论是Ⅰ群和Ⅱ群，还是Ⅰ群内的两个亚群，rpoB进化发育树的结点处自引导值都明显高于16S rDNA进化发育树；而且rpoB对产酸克雷伯菌的分群优于16S rDNA。对克雷伯菌的序列分析发现，16S rDNA序列存在41个碱基变异位点，有4个易变区，rpoB序列存在63个碱基变异位点，有1个易变区；克雷伯菌16S rDNA和rpoB的相似性分别为95．9％～100％和90．2％～100％。进一步的克雷伯菌种间序列分歧值分析，rpoB分歧值（0～10．6）高于16S rDNA（0～4．0）。结论克雷伯菌rpoB比16S rDNA具有更高的分歧度，在克雷伯菌属内种的分子分类和鉴定中，rpoB比16S rDNA基因更具优越性。; 郭晓琳王多春阚飙张燕敏张怡左颖魏来高燕; 关键词：克雷伯菌 RDNA RPOB

腹泻标本中肺炎克雷伯菌的分离鉴定和16S rDNA系统进化分析被引量：2: 2008年; 目的探讨腹泻标本中肺炎克雷伯菌属亚种的分类和鉴定。方法腹泻标本使用麦康凯和SS培养基划线培养，挑取可疑菌落分纯后使用细菌生化鉴定仪鉴定到亚种；提取菌株的全基因组DNA，以克雷伯菌16S rDNA引物PCR扩增菌株的1500bp16S rDNA序列，扩增产物进行测序，测序结果经截取后，使用Blastn程序在GenBank库中搜索16S rDNA序列的相似性匹配；用PHYLIP程序建立分离菌株及GenBank库中16S rDNA序列的进化发生树并进行分析。结果113份腹泻标本中，经生化鉴定有25株（分离率22．2％）肺炎克雷伯菌株，其中，肺炎亚种21株（分离率18．6％）、鼻炎亚种4株，未分离到鼻硬结亚种。这些标本中未分离到常见腹泻病原菌。生化鉴定的肺炎亚种菌株均对青霉素G耐药，而对多黏菌素敏感，对呋喃坦叮、头孢噻吩、卡那霉素和妥布霉素有部分耐药。菌株的16S rDNA序列在GenBank库中搜索发现，生化鉴定为鼻炎亚种的4株菌株与沙门菌等肠道致病菌株有最大相似性匹配；16S rDNA序列系统进化树将生化鉴定的肺炎亚种聚为一群，但不能将肺炎克雷伯菌属的3个亚种完全区分开来。结论16S rDNA序列进化分析在肺炎克雷伯菌的鉴定和分类中有一定意义。; 郭晓琳王多春张燕敏王晓梅张怡左颖张冬梅阚飙魏来高燕; 关键词：腹泻标本肺炎克雷伯菌 RDNA

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左颖

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