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徐维维

作品数：3 被引量：0H指数：0
供职机构：苏州大学计算机科学与技术学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金更多>>
相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>

合作作者

文献类型

  • 2篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 2篇生物学
  • 1篇自动化与计算...

主题

  • 3篇蛋白
  • 3篇蛋白质
  • 3篇白质
  • 2篇水分子
  • 2篇分子
  • 1篇蛋白质结构
  • 1篇对接
  • 1篇雅可比
  • 1篇雅可比矩阵
  • 1篇生物活性
  • 1篇配体
  • 1篇氢键
  • 1篇下降法
  • 1篇显式
  • 1篇小分子
  • 1篇活性

机构

  • 3篇苏州大学
  • 1篇苏州科技学院
  • 1篇江苏省计算机...

作者

  • 3篇徐维维
  • 2篇权丽君
  • 2篇吕强
  • 1篇吴宏杰
  • 1篇孙路

传媒

  • 1篇生物物理学报
  • 1篇软件导刊

年份

  • 2篇2013
  • 1篇2012
共 3 条 记 录，以下是 1-3
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排序方式：
含特殊小分子的蛋白质结构预测研究
蛋白质中通常包含一些不同于配体的特殊小分子。这些特殊小分子在实现蛋白质生物活性以及在蛋白质结构的确定上扮演着重要角色，如水分子和铜离子。在计算预测蛋白质结构时，此类特殊小分子一般不会被显式地考虑进计算过程。将此类小分子引...
徐维维
关键词：蛋白质生物活性水分子
文献传递
蛋白质loop区域闭合数值方法分析与比较
2013年
针对蛋白质loop区域的闭合问题,比较分析了两种来源于机器人学的数值方法——循环坐标下降法(CCD)和雅可比矩阵方法,进行了实现并设计实验。在计算时间和闭合效率方面循环坐标下降法要明显优于雅可比矩阵方法,而雅可比矩阵方法则可以较平均地改变每一个二面角值。
孙路吕强徐维维权丽君
关键词：蛋白质雅可比矩阵
引入显式水分子对接提高蛋白质配体复合物结构的预测精度
2012年
在蛋白质复合物界面一般都会存在着一定量的水分子,这些水分子通过空间占据和氢键方式影响蛋白质与配体的位置关系。应用现有的计算机方法研究蛋白质-配体对接时,一般不会显式地考虑水分子的作用。本文显式地将水分子引入蛋白质-配体对接过程,考虑水分子空间占据和氢键能量对复合物对接结构的影响,提出了一种包含水分子的蛋白质-配体对接算法。实验结果表明引入水分子使蛋白质-配体对接质量有明显提高。
徐维维吕强吴宏杰权丽君
关键词：水分子氢键
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