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田优
作品数:
2
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供职机构:
湖南大学
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发文基金:
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相关领域:
生物学
医药卫生
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合作作者
冯海平
湖南大学
牛一乐
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欧阳清检
湖南大学
谭钟扬
湖南大学
赵相艳
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田优
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欧阳清检
1篇
牛一乐
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冯海平
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生物信息学
年份
2篇
2013
共
2
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人腺病毒B、D亚种基因组中简单重复序列的信息分析
简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)常被描述为基因“stutters”(结巴,口吃),它是由1-6个碱基对组成的串联重复DNA片段,广泛的存在真核及原核生物基因组中。目前,SSR的产生认为...
田优
关键词:
简单重复序列
人腺病毒
文献传递
人腺病毒B、D亚种基因组中简单重复序列分析
2013年
本文以人腺病毒B亚种31条基因组序列及D亚种39条基因组序列为研究材料,利用ImperfectMicrosatelliteExtractor和DNAMAN软件对这些基因组序列中简单重复序列(SSR)的分布情况进行了系统性分析和比较。分析结果显示:人腺病毒B、D亚种基因组中简单重复序列的平均相对密度是十分接近的,但在不同类型SSR中分布情况又有所不同。D亚种中二型SSR明显高于B亚种,在两亚种一型SSR中(A)n、(T)n都是比较多的,而在两亚种二型SSR中的(CG/GC)n表现出了较高的偏好性。在同亚种多序列比对分析中,D亚种表现出了更高的稳定性。B、D亚种中SSR的这种特异性分布可能与它们的进化机制和致病性有关。
田优
谭钟扬
赵相艳
牛一乐
冯海平
欧阳清检
关键词:
人腺病毒
亚种
简单重复序列
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