许杰 作品数:6 被引量:15 H指数:2 供职机构: 哈尔滨医科大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 黑龙江省科技攻关计划 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
快速老化小鼠模型中Tau蛋白与NgR表达情况及其关系的研究 目的:观察快速老化小鼠模型(SAMP-8小鼠)大脑中Tau蛋白与NgR的表达情况;注射NgR抑制剂NEP1-40后,观察NgR及tau蛋白的表达情况对改善神经元形态及发挥保护作用机制进行研究。 方法:将重量在25-30... 许杰关键词:阿尔茨海默病 TAU蛋白 动物模型 利用基因表达谱对组织样品分类方法的研究 被引量:11 2003年 目的 探讨在基因表达谱数据分析中用主成分分析方法结合层次聚类法与K -均值聚类方法两种分类方法对组织样品分类的分类效果。方法 用主成分分析方法对数据降维后进行聚类分析 ,与不经主成分分析直接聚类 ,并结合筛选与组织样品分型相关的基因的各种筛选水平 ,评价聚类效果。结果 用约当指数进行评价两种聚类方法 :经主成分分析后用提取的主成分聚类与不用主成分的直接聚类效果不同 ;不同筛选相关基因的筛选水平对聚类效果也有影响。结论 对组织样品做聚类分析时 ,主成分分析能提高聚类质量 。 张瑞杰 许杰 王增权 郭政 李霞 李康关键词:基因表达谱 聚类分析 主成分分析 差异表达基因 通过表达谱区分基因突变类型的可行性的仿真分析 2002年 以线性状态空间模型为基础 ,对不同类型突变情况下的基因表达谱进行仿真。通过对基因进行层次聚类的方法提取表达谱的模式特征 ,将模式特征类别与基因突变类型之间进行了比较分析。结果显示 ,每一种突变类型对应一种独特的取类结果 ;聚类对象不包括突变基因时仍具特异性 ;对仿真表达谱数据加一定噪音后聚类结果仍保持较好的稳定性。 许杰 郭政 李霞关键词:突变 聚类分析 基因芯片 不同类型胶质瘤基因表达谱的初步分析 被引量:5 2002年 背景与目的:区分不同类型胶质瘤的分子发病机制具有重要的临床和生物学意义。基因芯片可揭示肿瘤基因表达谱,可能成为肿瘤分子病理学的新工具。我们拟应用cDNA微阵列技术来分析不同类型胶质瘤的基因表达谱差异。方法:提取来自4例脑胶质瘤患者3种类型的胶质瘤标本(包括少支细胞胶质瘤、间变性星形细胞瘤以及室管膜瘤)以及1例正常脑组织标本的总RNA,逆转录成32P标记的cDNA探针,与Atlas微阵列膜杂交、放射自显影,用专用软件和聚类分析法分析基因表达谱。结果:与正常脑组织相比,各肿瘤的差异表达基因数量从11到118个不等,选取107个差异表达基因作为聚类分析指标,可将4例胶质瘤分成3种类型且与神经病理学诊断相符。结论:使用微阵列技术可分辨不同类型胶质瘤的基因表达谱。 江荣才 浦佩玉 许杰 于士柱 焦保华 郭政 李霞 康春生关键词:CDNA微阵列 星形细胞瘤 室管膜瘤 基因表达谱 基因表达谱信息分析软件IDEA与WebGEA 2003年 基因芯片具有高通量快速并行检测基因表达水平的功能,是功能基因组研究的有力工具。针对基因芯片常规的信息分析需要,我们初步设计开发了基因表达谱的信息学分析平台,包括基于单机的软件IDKA(Information Digger for Experiments of microArray)与网络应用程序WebGEA(WEB GeneChip Expression Analysis),分别支持用户运行独立程序与在因特网上提交数据运行服务器程序来完成数据采掘分析任务。该平台得到良好的应用,是解决基因芯片常规的信息分析问题的一个方便工具。 王琦 许杰 郭政 李霞关键词:基因表达谱 数据挖掘 WEB平台 一种从微阵列提取相关基因的非参数得分系统及其界值确定方法 被引量:1 2002年 用一种非参数得分方法研究了如何从 DNA微阵列中筛选相关基因 (信息基因 )。该方法能够从复杂的原始数据中识别相关基因且不受原始数据分布特征的影响 ,大大减少了进一步寻找致病基因需要分析的数据量 ,是一种鲁棒的微阵列数据预处理方法。 张瑞杰 许杰 张瑞敏 吕飒丽 郭政 李霞关键词:相关基因 微阵列 差异表达基因