严鑫
- 作品数：9 被引量：5H指数：1
- 供职机构：中山大学药学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术理学医药卫生更多>>
- 基于环境编码树状拓扑筛和多核并行算法的化学结构数据库检索引擎(英文)
- ＜正＞While high throughput screening（HTS） and combinational chemistry（CC） become mature, the need of processing ...
- 严鑫卢峰徐峻
- 关键词：CHEMINFORMATICSCUDA
- 文献传递
- 基于环境编码树状拓扑筛和多核并行算法的化学结构数据库检索引擎
- 严鑫卢峰徐峻
- 关键词：SUBSTRUCTURESEARCHPARALLELCHEMINFORMATICSCUDA
- 图论和AI算法在药物发现中的应用
- 如果药物分子被视为分子机器/器件,药物设计学需要回答下述基本问题:如何将分子划分成子结构单元?从子结构单元如何组装成分子?如何预测/评价分子的活性/性质。为了解决这些问题,在已有的图论算法工作基础上(如分子图识别算法GM...
- 徐峻严鑫周晖皓顾琼
- 关键词：图论人工智能
- 文献传递
- 一种分子体积计算方法及两分子的形状比较方法
- 本发明涉及药物分子的设计和筛选，特别是一种分子体积计算方法及两分子的形状比较方法。所述方法包括：读入第一分子的三维结构信息，所述三维结构信息包括第一分子中每个原子的类型及其坐标数值；根据第一分子中各原子的类型得到相应的范...
- 徐峻严鑫
- 文献传递
- 基于结构的化合物稳定性预测算法
- <正>化合物在贮存中受到环境中温度,湿度,光照等因素的影响,随时间推移将发生物理或化学变化,即化合物稳定性问题,化合物的稳定性直接影响到生物筛选的结果。本文根据Specs公司提供的15,000个化合物实测的稳定性数据,建...
- 刘志红郑铭浩严鑫巫瑞波徐峻
- 关键词：贝叶斯分类
- 文献传递
- 双向长短期记忆循环网络模型预测小分子与受体共价结合
- 2021年
- 预测小分子与蛋白质的共价结合对基于共价结合的药物筛选十分重要。目前基于结构的虚拟筛选工具主要面向药物和靶标的非共价对接。本文在前期研究的基础上,用深度学习技术中的双向长短期记忆循环网络方法和自注意机制,根据实验数据,预测小分子与蛋白质的共价结合能力。蛋白质与小分子配体共价结合主要有半胱氨酸或丝氨酸结合类型。半胱氨酸共价结合类型的数据量较大,本文主要预测半胱氨酸类型的共价结合。与传统的机器学习模型,如随机森林,逻辑回归,支持向量机模型相比,该深度学习模型的预测能力有显著的改进。
- 胡立钊严鑫文畅徐峻
- 应用深度学习算法发现肝X受体β亚型选择性激动剂
- 肝X受体（liver X receptor,LXR）是人类和哺乳动物脂质平衡的关键调节因子,以组织依赖的方式控制参与胆固醇摄取、转运、排出和排泄1。一般认为LXR是治疗脂质代谢相关疾病的重要靶点。近年来,人们发现LXR有...
- 严鑫徐峻
- 关键词：药物发现LXR
- 文献传递
- 药物分子设计中的大数据问题被引量：5
- 2015年
- 药物创新领域的大数据主要来源于高通量实验、高效能模拟计算、信息化、科技出版物和专利文献4个方面.这些大数据使我们有可能在系统层面上看到药物分子与许多靶标相互作用的新现象、新规律,提高药物创新的效率,也带来新的挑战,如存储、标引/标注和质控、可视化、数据挖掘和计算复杂度等问题.这些问题可以通过在超算和云服务技术的支持下发展并行计算方法而逐渐得到解决.从离散、不完备且信噪比低的大数据中难以找到物质活性与结构之间的连续函数关系,贝叶斯学习机及其与支持向量机、决策树技术的组合是大数据挖掘的发展方向.大数据既是科学实验通量化和社会信息化的结果又是原因,正确解决大数据挖掘问题是提高药物创新效率的核心.
- 严鑫丁鹏刘志红王领廖晨钟顾琼徐峻
- 关键词：大数据药物设计生物信息学化学信息学
- 一种药物分子形状的比较方法
- 本发明涉及药物分子的设计和筛选，特别是一种分子体积计算方法及两分子的形状比较方法。所述方法包括：读入第一分子的三维结构信息，所述三维结构信息包括第一分子中每个原子的类型及其坐标数值；根据第一分子中各原子的类型得到相应的范...
- 徐峻严鑫
- 文献传递
