刘丽霞
- 作品数：97 被引量：263H指数：9
- 供职机构：西北民族大学生命科学与工程学院更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金国家级大学生创新创业训练计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程文化科学更多>>
- 荷斯坦牛DRA基因多态性及序列特征分析被引量：1
- 2019年
- 为探讨荷斯坦牛DRA基因的多态性及序列特征,本研究采用基因组DNA混合池扩增并直接测序的方法对荷斯坦牛DRA基因编码区进行多态性分析,同时利用生物信息学方法预测DRA基因的理化特性及其编码蛋白的高级结构。结果表明,荷斯坦牛DRA基因编码区上有4个碱基突变,包含1个错义突变和3个同义突变。DRA基因共编码253个氨基酸,编码产物是一种稳定的不可溶蛋白,具有15个潜在的磷酸化位点,二级结构为混合型,三级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲组成。本研究结果为荷斯坦牛的疾病相关基因筛选和抗病分子育种提供了一定的理论依据。
- 刘丽霞张丽欧阳霞辉乔自林付保强
- 关键词：荷斯坦牛编码区多态性
- 绿洲农田防护林系统水分生态特征研究
- 农田防护林是甘肃省景电灌区林业生态工程建设的重要内容之一。农田防护林建设对防御农业自然灾害、改善农田小气候和土壤水分条件,创造有利于农作物生长发育的环境条件,保证区域农业生产,均具有十分显著的作用。但农田防护林建设也带来...
- 刘丽霞
- 关键词：景电灌区绿洲
- 文献传递
- 植物酯酶分离纯化及酶促反应条件优化的研究被引量：6
- 2012年
- 目的:建立一种快速检测牛肉中有机磷农药残留的方法.方法:从新鲜小麦粉、黄豆粉和玉米粉中分离植物酯酶,真空冷冻浓缩,羧甲基纤维素层析,真空冷冻干燥提取植物酯酶,并通过试验测得其酶促反应最适温度36.8℃,最适pH 7.7,酶促反应时间3 min,敌敌畏对其抑制时间8 min,显色剂2,6-二氯靛酚的最大吸收波长606 nm.结论:在相同条件下,提纯后的植物酯酶检测模拟有机磷农药残留阳性牛肉样品抑制率为99.5%,市售丁酰胆碱酯酶测得的抑制率为99.8%%,两者检测结果高度一致.
- 陈士恩申晓蓉罗振兴霍生东阿依木古丽刘丽霞
- 关键词：植物酯酶分离纯化酶促反应
- SPE-HPLC法检测牛肉及牛奶中阿维菌素残留被引量：1
- 2016年
- 为了建立一种可检测牛肉及牛奶中阿维菌素残留含量的方法，试验以流动相甲醇：水=90：10，检测波长为245nm，流速为0．8mL／min为检测条件的高效液相色谱法测定其含量。结果表明：17min内可将阿维菌素完全分离，线性范围为0．3～5．0μg／L，相关系数为0．9997，牛肉和牛奶中阿维菌素平均回收率分别为91．20％-100．32％、89．93％-99．15％，相对标准偏差分别小于7％、4％。该方法简便、灵敏、准确，适用于牛肉及牛奶中阿维菌素残留量的测定，并能满足国内和国外检测的要求。
- 赫欣睿高旭东叶永丽武中庸陈士恩戎靖瑜申晓蓉刘丽霞
- 关键词：牛肉牛奶阿维菌素
- 中国荷斯坦奶牛Nramp1基因多态性与泌乳性状及产奶量的关联性分析被引量：5
- 2017年
- 为寻找与乳房炎相关的分子标记,为荷斯坦牛的抗病育种提供理论基础,试验采用PCR-SSCP技术和测序的方法对宁夏农垦303头中国荷斯坦奶牛的Nramp1基因进行了遗传多态性分析,利用一般线性模型分析Nramp1基因c.200C>G突变对泌乳性状及产奶量影响。结果显示,Nramp1基因c.200C>G突变与乳脂率、日产奶量和体细胞评分值存在显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)关联。因此,可以把该位点作为中国荷斯坦奶牛体细胞评分、测定日产奶量和日乳脂率的遗传标记进行进一步研究。
- 张丽刘丽霞陈红李强子刘吴鑫
- 关键词：荷斯坦牛遗传多态性泌乳性状产奶量
- 猪SLA-DRA基因SNP位点筛选及其生物信息学分析被引量：2
- 2017年
- 以八眉猪、蕨麻猪和甘肃黑猪为研究对象,利用PCR-SSCP和测序方法对SLA-DRA基因4个外显子进行SNP位点筛选,并利用生物信息学软件预测各SNP位点对DRA基因mRNA二级结构、蛋白质二级结构和三级结构的影响。结果在3个猪种中共检测到6个DRA基因SNP位点,分别为外显子1的A^(177)G,外显子2的A^(3093)C,以及外显子4的A^(4167)G、A^(4246)G、C^(4282)T和G^(4293)A,其中A^(3093)C、A^(4167)G和G^(4293)A为错义突变,分别导致甲硫氨酸(Met)变为亮氨酸(Leu)、谷氨酰胺(Gln)变为精氨酸(Arg)和精氨酸(Arg)变为组氨酸(His)。以3个错义SNP位点为基础,构建了6种DRA单倍型,其中H1、H3和H6为主要单倍型,频率分别为0.25、0.21和0.21。生物信息学分析表明,三个猪种DRA基因单倍型的mRNA二级结构、蛋白质二级结构和三级结构与野生型均存在一定的差异。研究结果可为八眉猪、蕨麻猪和甘肃黑猪的保种和抗病育种提供理论依据。
- 刘丽霞张丽田晓静陈红寸海霞金丽谭小音谢德琼
- 关键词：SNP位点生物信息学
- 草鱼GHR2基因生物信息学分析被引量：2
- 2023年
- 试验旨在研究草鱼GHR2基因的理化性质和结构,利用生物信息学软件对GHR2基因进行预测分析。结果显示:在草鱼GHR2基因序列中存在一条长度为1 800 bp的开放阅读框;通过对该基因的理化性质预测可知,该基因编码了599个氨基酸,分子式为C3015H4674N774O909S31,编码产物的分子质量为67 302.78 Da,理论等电点为4.89,不稳定指数为59.45,疏水性/亲水性平均值为-0.182,存在7个潜在的N-糖基化位点和73个磷酸化位点,在第25位氨基酸上存在信号肽剪切位点,二级结构以无规则卷曲为主。研究表明,草鱼GHR2蛋白是一种不稳定的可溶性酸性蛋白,也是一种跨膜蛋白,结果可为进一步阐明草鱼GHR2基因的功能奠定分子生物学基础。
- 李雅靖王进千韦姗姗刘丽霞
- 关键词：草鱼生物信息学
- 务川黑牛TLR2基因的单核苷酸多态性(SNP)筛查及生物信息学分析被引量：1
- 2021年
- 采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,对务川黑牛TLR2基因的单核苷酸多态性(SNP)位点进行筛查,并利用生物信息学软件预测各SNP位点对TLR2基因mRNA和蛋白质结构的影响。结果表明,务川黑牛TLR2基因共有18个SNP位点,其中有9个位点是错义突变,分别导致相应的氨基酸发生改变。生物信息学分析发现,T978A、G1010A和G1688A位点导致mRNA自由能升高,降低了mRNA二级结构稳定性,其余位点均导致自由能降低,增加了mRNA二级结构稳定性。预测结果显示,务川黑牛TLR2基因各SNP位点的蛋白质二级结构和三级结构也相应发生了改变。研究结果可为务川黑牛TLR2基因的深入研究提供基础资料,为务川黑牛抗病分子标记筛选提供理论基础。
- 姜涛秦雅晶罗皎兰米小梅王进千刘丽霞
- 关键词：SNP生物信息学
- 中国荷斯坦牛与务川黑牛TLR_(5)基因SNPs及序列特征分析被引量：1
- 2023年
- 为了筛查牛Toll样受体家族(toll-like receptors,TLRs)基因TLR_(5)的单核苷酸多态性(SNPs)位点,试验采用DNA混合池扩增后直接测序的方法对中国荷斯坦牛和务川黑牛8个外显子SNPs位点进行检测,并估算SNPs位点的等位基因频率,同时利用生物信息学分析方法对TLR_(5)基因的mRNA二级结构、氨基酸理化性质、编码蛋白质的亲/疏水性、蛋白质二级和三级结构进行预测与分析。结果表明:中国荷斯坦牛和务川黑牛TLR_(5)基因上共有5个SNPs位点,分别为g(N).T^(1850)C、g(N).G^(2549)A、g(W).T^(1850)C、g(W).G^(2297)C、g(W).G^(2549)A,其中g(N).T^(1850)C、g(W).T^(1850)C位点为错义突变,均导致氨基酸由亮氨酸变为丝氨酸,其余为同义突变。TLR_(5)基因错义突变位点g(N).T^(1850)C和g(W).T^(1850)C的mRNA二级结构自由能增加,均为-3593.55 kJ/mol,增加了mRNA二级结构的稳定性;而同义突变位点中仅g(W).G^(2297)C的mRNA二级结构的自由能略减少,为-3574.14 kJ/mol,降低了mRNA二级结构的稳定性。中国荷斯坦牛和务川黑牛TLR_(5)基因均编码909个氨基酸,均表现为编码的丝氨酸占比最多,编码氨基酸的不稳定指数均大于40,平均亲/疏水性分值为0.064分和0.067分,编码的蛋白质是不溶性蛋白质,二级结构中均为无规则卷曲占主导地位,三级结构突变前后均没有发生明显变化。说明TLR_(5)基因的突变可能与奶牛乳房炎相关,其突变位点有可能成为中国荷斯坦牛和务川黑牛乳用性状选育的分子标记。
- 王媛媛秦雅晶钟泽宇韦姗姗刘丽霞张丽
- 关键词：中国荷斯坦牛
- 奶牛TLR4基因编码区生物信息学分析
- 2020年
- TLR4基因在哺乳动物细胞表面有较高的表达量,在抗击感染性免疫中发挥重要的作用。本研究对奶牛TLR4基因编码蛋白质的结构和功能进行分析表明,奶牛TLR4基因编码区长度为3738bp,共1246个氨基酸残基,编码20种不同的氨基酸,α-螺旋(Hh)为329bp,延伸链(Ee)为30bp,自由卷曲(Cc)为378bp;编码蛋白原子数为13521个,其中H原子较多,分数正残数为0.09,等电点为6.74;分子体积为115841.00V/M,脂肪族指数105.75,其疏水性残基只有0.02。
- 高成宏文亮马博妍任稳稳李宏旭彭帅刘丽霞张丽
- 关键词：编码蛋白质奶牛生物信息学
