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刘梦源

作品数：9 被引量：7H指数：2
供职机构：天津医科大学药学院天津市临床药物关键技术重点实验室更多>>
发文基金：天津市自然科学基金国家教育部博士点基金国家自然科学基金更多>>
相关领域：医药卫生生物学理学化学工程更多>>

合作作者

文献类型

  • 9篇中文期刊文章

领域

  • 7篇医药卫生
  • 2篇生物学
  • 1篇化学工程
  • 1篇理学

主题

  • 7篇分子
  • 4篇动力学
  • 4篇分子动力学
  • 3篇动力学研究
  • 3篇突变
  • 2篇动力学模拟
  • 2篇药物
  • 2篇抑制剂
  • 2篇制剂
  • 2篇分子动力学模...
  • 2篇分子动力学研...
  • 2篇分子力学
  • 1篇蛋白
  • 1篇底物
  • 1篇信号
  • 1篇信号通路
  • 1篇药物设计
  • 1篇胰岛
  • 1篇胰岛素
  • 1篇胰岛素抵抗

机构

  • 9篇天津医科大学
  • 4篇天津药物研究...
  • 1篇北京协和医学...

作者

  • 9篇刘梦源
  • 9篇王润玲
  • 4篇徐为人
  • 4篇周慧
  • 4篇程先超
  • 2篇董卫莉
  • 1篇王树青
  • 1篇刘桂友
  • 1篇杨冰
  • 1篇刘鹏
  • 1篇汤立达
  • 1篇贾林
  • 1篇谢宪斌
  • 1篇平川
  • 1篇刘培毅
  • 1篇梁静
  • 1篇董振科
  • 1篇朱彧
  • 1篇胡鳞方

传媒

  • 6篇天津医科大学...
  • 1篇中国现代应用...
  • 1篇中国医院药学...
  • 1篇计算机与应用...

年份

  • 1篇2012
  • 3篇2011
  • 3篇2009
  • 2篇2008
共 9 条 记 录，以下是 1-9
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排序方式：
人朊蛋白Glu200残基突变的分子动力学研究被引量：2
2011年
目的:探索Glu 200残基突变对人朊蛋白二级结构的影响。方法:从RCSB数据库下载人野生型和E200K突变型朊蛋白NMR结构,利用Desmond 9.0分子动力学软件包进行10ns分子动力学模拟。结果:E200K会使人朊蛋白α2和α3螺旋骨架氢键稳定程度下降,从而使上述两螺旋发生解旋现象。结论:人朊蛋白E200K突变会使朊蛋白本身二级结构稳定性下降,可能导致传染性海绵状脑病的发生。
周慧刘梦源杨冰程先超王润玲
关键词：朊蛋白突变分子动力学
咪唑烷二酮类PTP1B抑制剂的分子对接研究
2008年
目的:设计蛋白酪氨酸磷酸酯酶1B(PTP1B)抑制剂。方法:利用ChemOffice 2008绘制出70个具有咪唑烷二酮结构母核的小分子化合物平面结构,然后利用Schrodinger Suite 2007构建小分子化合物库、蛋白结构优化、分子对接。结果:分子对接研究表明,设计的小分子化合物大部分对接得分优于原始配体,都可与活性位点底部和顶部的残基形成氢键,而原始配体只能与活性位点顶部的残基形成氢键。结论:设计小分子与PTP1B的结合能力理论上优于原始配体。
平川王润玲刘梦源徐为人周慧
关键词：咪唑烷二酮糖尿病计算机辅助药物设计分子对接胰岛素抵抗
蛋白酪氨酸磷酸酯酶1B活性位点Asp 48突变理论研究被引量：1
2009年
目的:利用点突变研究PTP1B中Asp 48的重要性。方法:理论研究采用分子力学原理,使用HyperChem 7.0的AMBER99力场。首先对PTP1B中Asp 48进行点突变,然后利用Polak-Ribiere共轭梯度法对复合物结构进行优化。计算优化结构的静电相互作用能、范德华相互作用能、二面角等指标,并通过比较突变后这些指标的变化,分析酶与底物的相互作用变化。结果:突变后活性位点的形状、PTP1B的空间构象及底物与催化相关残基的相互作用能均未发生显著变化。而D48K、D48I和D48T则导致底物与非催化相关残基的相互作用降低。结论:点突变对活性位点的形状、PTP1B的空间构象和催化活性的影响较小,但D48K、D48I和D48T会导致底物与PTP1B的结合能力下降。
刘桂友刘梦源王润玲程先超周慧谢宪斌
关键词：突变分子力学
过氧化物酶体增殖物激活受体-γ激动剂诱导契合机制的分子动力学研究
2011年
目的:研究激动剂能够使过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(PPAR-γ)的α螺旋结构更稳定的原因以及PPAR-γ可能的活化机制。方法:利用分子动力学模拟的方法研究激动剂对PPAR-γ的α螺旋的诱导契合效应。结果:激动剂的存在能够增加PPAR-γ中α螺旋H2’、H3和H12(AF-2)的骨架氢键概率。结论:激动剂能够使PPAR-γ的α螺旋H2’、H3及H12(AF-2)结构更稳定,同时也影响α螺旋之间氢键的形成与断裂,而且残基侧链二面角的分布也同样能佐证上述观点。
梁静刘梦源程先超董卫莉徐为人王润玲
关键词：过氧化物酶体增殖物激活受体-Γ激动剂分子动力学模拟
单/双磷酸化酪氨酸底物与蛋白酪氨酸磷酸酯酶1B相互作用分子动力学研究
2011年
目的:探索双磷酸化酪氨酸底物与蛋白酪氨酸磷酸酯酶1B(PTP1B)亲和能力比单磷酸化酪氨酸底物高的原因。方法:利用分子动力学模拟的方法来研究上述两种底物与PTP1B相互作用的差异。结果:双磷酸化酪氨酸底物和单磷酸化酪氨酸底物对PTP1B骨架运动影响模式相近。但双磷酸化酪氨酸底物可以增强底物与PTP1B的Asp48之间的形成氢键的概率。能量分解分析表明双磷酸化酪氨酸底物两个双磷酸化酪氨酸与PTP1B之间的强静电作用是导致双磷酸化酪氨酸底物与PTP1B相互作用能的主要原因。结论:双磷酸化酪氨酸底物与PTP1B比单磷酸化酪氨酸底物亲和力高的主要原因是双磷酸化酪氨酸底物与PTP1B中Asp48强氢键作用以及双磷酸化酪氨酸底物的两个双磷酸化酪氨酸与PTP1B之间的强静电作用。
董振科刘梦源程先超王润玲
关键词：抑制剂分子动力学
PTP1B中Arg221各种突变下底物与催化结构域相互作用变化的理论研究(英文)
2009年
蛋白酪氨酸磷酸酯酶1B(PTP1B)在胰岛素受体去磷酸化过程中发挥重要作用。本研究目的在于阐述PTP1B催化位点中Arg 221的作用。各种Arg 221的突变体通过HyperChem Release 7.0软件生成。结果表明Arg 221的突变会对底物与蛋白相互作用产生显著影响。当Arg 221突变为碱性残基时,底物与蛋白之间总静电相互作用能增加,但与催化相关残基的静电相互作用能降低,其余的突变则导致底物与蛋白之间总静电相互作用能降低。这一结果表明,Arg 221突变为碱性残基可减弱PTP1B的催化活性,但使底物与蛋白的结合能力增强,其余的突变则会同时减弱酶的催化活性及底物与蛋白的结合能力。
刘梦源王润玲刘鹏汤立达徐为人周慧贾林
关键词：PTP1B突变分子力学
γ-氨基丁酸脂溶性前体药物合成及脂水分配系数测定被引量：3
2008年
目的合成γ-氨基丁酸脂溶性前体药物。方法以香豆素和γ-氨基丁酸为原料经过碱催化水解、乙酰化、醇解及DCC-HOB t活化酯法四步制备出目标化合物,并采用摇瓶法测定其在正辛醇/水中的分配系数。结果所得产物经熔点、红外谱图、核磁共振氢谱确证其结构,正辛醇/水分配系数为3.03。结论该合成方法简便易行,最终产物具有一定的脂溶性。
朱彧刘梦源刘培毅王润玲
关键词：Γ-氨基丁酸前体药物
糖原合成酶激酶3β活性调节机制的分子动力学模拟被引量：1
2012年
目的:探讨研究糖原合成酶激酶(GSK-3β)的活性调节机制。方法:利用Desmond 9.0软件对GSK-3β-轴素复合物和GSK-3β-FRATtide复合物进行分子动力学模拟研究。结果:与GSK-3β-轴素复合物相比,在GSK-3β-FRATtide复合物中,Lys205同Glu211、Asn213之间的氢键作用消失,Lys205与Glu211不能形成稳定的盐键;FRATtide的Arg219与GSK-3β的Asp264,GSK-3β的Gly259与Arg220之间能形成稳定的氢键。此外,Phe67和Phe93显示出位置的偏移。这些都将导致GSK-3β活性环的构象变化进而抑制GSK-3β的催化活性。结论:GSK-3β的活性调节是通过改变其活化环构象来实现的。
胡鳞方刘梦源董卫莉徐为人王树青王润玲
关键词：糖原合成酶激酶-3ΒWNT信号通路分子动力学模拟
环氧酶-2抑制剂抗肿瘤活性及其机制研究进展
2009年
目的:综述环氧酶-2抑制剂在肿瘤治疗作用机制的研究进展。方法:以近几年国外该领域有代表的文献为根据,进行归纳、总结。结果:环氧酶-2抑制剂可有效地抑制肿瘤的生长、繁殖和转移。结论:环氧酶-2抑制剂对肿瘤预防和治疗发挥重要作用,但其作用机制尚需进一步讨论。
刘梦源王润玲
关键词：环氧酶-2抑制剂肿瘤
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