孙蕾
- 作品数：21 被引量：164H指数：8
- 供职机构：中国农业科学院作物科学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技基础条件平台建设计划热带作物种质资源保护项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 中国绿豆种质资源初选核心种质构建被引量：26
- 2008年
- 以国家作物种质资源数据库中5072份国内绿豆资源为材料,根据14个农艺性状,利用地理来源(省)和性状群进行分组,分别采用比例法、平方根法和多样性指数法确定取样数及聚类选择和随机选择2种个体选择法构建了13个不同的绿豆初选核心样本,对不同的取样方法及总资源间进行了品种间平均相似性系数、性状符合度、遗传多样性指数和数量性状变异系数的比较。结果表明,聚类选择取样优于随机取样,按照性状群分组优于按省分组;在聚类选择条件下采用多样性指数法确定取样数优于平方根法和比例法。最终确定按性状群分组,利用多样性指数确定取样数,聚类选择个体为绿豆核心种质构建的最佳方案。用此方案,构建了包含719份绿豆种质的初选核心种质,取样比例为14.2%,性状符合度达100%。
- 刘长友王素华王丽侠孙蕾梅丽徐宁程须珍
- 关键词：绿豆种质资源核心种质
- 2个玉米ZmCRY1a基因的克隆及其响应光质处理的表达模式被引量：3
- 2016年
- 隐花色素(cryptochrome,CRY)是植物蓝光的主要受体,参与其调节生长发育及生物钟过程。为研究隐花色素在玉米光形态建成及生物钟调控方面的作用,本研究利用同源克隆的方法得到玉米自交系B73的2个ZmCRY1a基因的c DNA序列,分别命名为ZmCRY1a1和ZmCRY1a2。这2个基因的编码区(coding DNA sequence,CDS)序列长度都为2124个核苷酸,编码707个氨基酸。生物信息学分析表明ZmCRY1a1和ZmCRY1a2推测的氨基酸序列均包含DNA photolyase、FAD binding和Crytochrome C结构域;与拟南芥及其他常见作物的CRY比对并构建系统发育树显示,这2个基因与水稻Os CRY1a氨基酸序列一致性最高,而与拟南芥和大豆等双子叶植物的CRY1氨基酸序列一致性相对较低。利用实时荧光定量PCR分析了ZmCRY1a1和ZmCRY1a2在不同器官及响应光质、光质转换及长日照与短日照处理的表达模式。在检测的器官中,ZmCRY1a1的表达丰度均高于ZmCRY1a2;这2个基因在成株期叶片中表达丰度最高,分别是根中ZmCRY1a1的52.1倍和6.2倍。相对于黑暗下,二者在各种持续光质中的表达丰度均较高,尤其在蓝光和远红光条件下。尽管是作为编码蓝光受体的基因,2个ZmCRY1a的表达却能强烈地响应远红光和红光转换处理。同样二者也能响应不同光周期处理,长日照条件下,ZmCRY1a1的转录在一个光周期内共出现5个峰值,而ZmCRY1a2的转录只有4个峰值;短日照条件下,2个ZmCRY1a的表达出现了极其相似的模式,均在进入黑暗后10 h和14 h时出现2个最高峰。由此推测2个ZmCRY1a可能在玉米光形态建成与开花调节中发挥重要作用。
- 闫蕾杨宗举苏亮肖阳郭林宋梅芳孙蕾孟凡华白建荣杨建平
- 关键词：玉米隐花色素光信号转导基因克隆
- 玉米隐花色素CRY1b和CRY2基因转录丰度对不同光质处理的响应被引量：7
- 2018年
- 玉米株高、开花期、产量、品质等性状与环境中的光密切相关。隐花色素是一类蓝光和近紫外光的受体,主要参与植物的光形态建成及动、植物的生物钟调控。通过研究玉米隐花色素基因对不同光处理的表达模式,可为进一步研究其对玉米光形态建成的作用奠定基础。本研究采用RT-PCR技术克隆了玉米Zm CRY1b和Zm CRY2基因;利用生物信息学相关网站和软件对其编码蛋白的结构域及氨基酸进行了系统发育分析;利用q RT-PCR分析了玉米自交系B73中Zm CRY1b和Zm CRY2基因在不同组织、以及响应不同光质及长日照和短日照处理的转录丰度。研究发现,玉米与拟南芥、水稻和小麦的CRY蛋白有相同的结构域及较高的氨基酸序列的一致性,表明它们具有相似的功能。Zm CRY1b和Zm CRY2基因主要在玉米的叶片中表达;二者能迅速响应各种持续光质、黑暗到不同光质转换及长日照和短日照处理,且Zm CRY1b在各种处理下的转录丰度均高于Zm CRY2,可能暗示Zm CRY1b在玉米中功能更强。以上研究结果表明,Zm CRY1b和Zm CRY2基因均能有效地响应各种光质和光周期处理,并在玉米的光形态建成中发挥重要作用。本研究为进一步探明Zm CRY1b和Zm CRY2基因的功能及其在玉米品种改良中的应用提供了研究基础。
- 李红丹闫蕾孙蕾孙蕾樊晓聪张燕郭林郭林游光霞杨宗举苏亮苏亮
- 关键词：玉米隐花色素光形态建成
- 与绿豆抗豆象基因连锁的分子标记
- 本发明与绿豆抗豆象基因连锁的分子标记，用于绿豆抗豆象基因的筛选。用CTAB法提取V2709、VC1973(中绿1号)及其F<Sub>2</Sub>分离群体的单株DNA。采用63个RAPD分子标记、100对SSR分子标记及...
- 程须珍孙蕾王素华王丽侠刘长友梅丽徐宁
- 文献传递
- 抗孢囊线虫和白粉病小麦种质的创制与鉴定
- 禾谷孢囊线虫(cereal cyst nematode,CCN)在我国16个省(市、自治区)小麦产区上发生.CCN属于土传病原线虫,通过侵染小麦的根系发育危害小麦生产,我国发生的CCN包括禾谷孢囊线虫(Heteroder...
- 孙喜营崔磊孙蕾孙艳玲邱丹邹景伟王晓鸣李洪杰
- 关键词：禾谷孢囊线虫白粉病种质创新
- 栽培绿豆V2709抗豆象特性遗传及基因初步定位被引量：14
- 2008年
- 【目的】绿豆[Vigna radiata(L.)Wilczek]是豇豆属亚洲亚属(Ceratotropis)中的一个栽培豆种,豆象是危害绿豆的重要害虫,利用分子标记对抗豆象基因进行初步定位,为该材料在绿豆育种中的利用和抗豆象基因的分离奠定基础。【方法】利用原产于印度的抗豆象栽培绿豆V2709与农艺性状优良的感豆象推广品种中绿1号(VC1973A)配制杂交组合,对杂种F2、BC1F1和F3进行遗传分析;采用BSA法,以上述F2代为定位群体,利用抗、感亲本和抗、感池筛选63个RAPD引物和113对SSR/STS引物。【结果】遗传分析结果表明该抗豆象特性由一对显性基因控制;引物筛选结果表明2个引物能在抗、感池间扩增出多态性条带,用Mapmaker EXP3.0b软件作图,将该抗豆象基因初步定位在一个RAPD标记和一个STS标记之间,遗传距离分别为11.0cM和5.8 cM,并暂定名为Br2。【结论】本研究定位的基因标记可作为绿豆抗豆象育种分子标记辅助选择的一种工具。
- 孙蕾程须珍王素华王丽侠刘长友梅丽徐宁
- 关键词：STSRAPD
- 与小麦抗菲利普孢囊线虫主效QTL紧密连锁的KASP分子标记及其应用
- 本发明公开了三个与小麦抗菲利普孢囊线虫主效QTL紧密连锁的KASP分子标记及其应用。本发明利用iSelect 90K SNP芯片和BSA‑RNA‑seq技术，首次在小麦品种Madsen7D染色体上定位了一个新的抗菲利普孢...
- 李洪杰崔磊周阳张宏军孙蕾孙玉李静婷邱丹杨丽刘宏伟
- 文献传递
- 武夷菌素活性成分分离纯化及结构鉴定
- 武夷菌素(Wuyiencin)是一种广谱、高效、低毒的核苷类抗生素,其产生菌是从福建省武夷山地区采集的一株链霉菌一不吸水链霉菌武夷变种(Streptomyces ahygroscopicus var.wuyiensis)...
- 崔增杰孙蕾张克诚
- 关键词：武夷菌素活性成分分离纯化
- 绿豆抗豆象研究进展被引量：26
- 2007年
- 绿豆象是豇豆属食用豆类作物重要的仓储害虫,严重影响其产量和品质。选育和利用抗虫品种是防治豆象最有效的途径。本文就绿豆抗豆象基因资源的发掘与利用及抗豆象特性的遗传机理与分离规律进行了总结与分析,对抗豆象的生化基础研究和分子标记进行了综述,探讨了抗豆象育种的重要性及尚需解决的问题,提出进行不同抗源的基因等位性鉴定、高效地利用抗源、培育多价抗豆象绿豆品种的重要性。
- 孙蕾程须珍王丽侠
- 关键词：绿豆象分子标记
- 2个玉米光敏色素C基因的转录丰度对多种光质处理的响应被引量：5
- 2017年
- 【目的】通过NCBI数据库获得2个玉米PHYC及相关数据,并进行相关生物信息学分析。利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)分析2个玉米PHYC在玉米各器官的转录丰度,以及其转录丰度对多种光质处理、黑暗到各种光质转换和光周期处理(长日照和短日照)的响应,为研究玉米PHYC在玉米幼苗去黄化与开花期的调控机制奠定基础。【方法】采用玉米B73自交系为研究材料,通过RT-PCR分别对Zm PHYC1和Zm PHYC2的全长ORF序列进行克隆;借助相关软件对其进行生物信息学分析,利用q RT-PCR分析这两个基因在玉米各器官中的转录丰度,及其转录丰度对各种光照处理的响应。【结果】Zm PHYC1和Zm PHYC2的全长ORF均为3 408 bp,编码1 135个氨基酸基序,分子量分别为126.14和126.07 k D。生物信息学分析表明,玉米phy C蛋白可以分为6个功能区段:节奏周期蛋白—Ah核转运接受蛋白—专一蛋白区段(Per-Arnt-Sim,PAS)、c GMP受激磷酸二酯酶区段(GAF)、色素区段(PHY)和PAS相关区段(PRD,包含2个PAS区段)、组氨酸激酶A区段和组氨酸激酶ATP酶区段,但是Zmphy C2在PRD区段仅有一个PAS区段。氨基酸水平的系统发育树分析表明,Zmphy C1和Zmphy C2与禾本科物种phy C有很高的一致性,且与甘蔗和高粱phy C的亲缘关系较近。q RT-PCR分析表明,Zm PHYC1和Zm PHYC2的表达在根和叶中的转录丰度均较高,同时对持续蓝光和白光响应强烈;在黑暗到各种光质转换处理中,这两个PHYC的表达模式相似。在黑暗转到远红光、红光、蓝光和白光的0.5 h,Zm PHYC1和Zm PHYC2的转录表达均急剧上升,随后迅速下降到自身起始黑暗时的水平以下,并上下波动。这两个基因对长日照和短日照的光周期处理也能积极响应,在长日照条件下,2个Zm PHYC出现了极其相似的表达模式,均在光照和黑暗阶段各出现1个峰值;在短日照条件下,这两个基因的表达模式差异较大,Zm PHYC1的峰值出现在进入黑暗
- 牛骧郭林杨宗举孙蕾李红丹游光霞徐宏孟凡华佘跃辉杨建平
- 关键词：玉米光信号转导
