徐卫东
- 作品数：6 被引量：28H指数：4
- 供职机构：南京医科大学附属苏州医院更多>>
- 发文基金：苏州市“科教兴卫工程”青年科技项目江苏省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定临床病原菌的效果被引量：5
- 2015年
- 目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)对临床细菌的鉴定能力。方法收集2014年9月至2015年1月苏州市立医院门诊和住院患者临床标本中分离出的4 511株病原菌,包括3 727株常见细菌,784株真菌,32株少见菌,按标准操作流程分离和培养后,用MALDI-TOF MS和Phoenix-100分别鉴定所分离菌株,鉴定结果不一致菌株采用细菌16S r RNA基因测序技术予以确认;采用MALDI-TOF MS和传统手工法鉴定真菌。结果 3 727株常见细菌,MALDI-TOF MS检出率为97.0%,Phoenix-100检出率为98.6%。另有35株黏液性肺炎克雷伯菌和42株黏液性铜绿假单胞菌,MALDI-TOF MS未能鉴定出,而Phoenix-100均可正确鉴定。两者对克雷伯菌属和假单胞菌属的检出率差异有统计学意义(χ2值分别为36.219、17.288,P均=0.000),对摩根氏菌属、无色杆菌属、黄杆菌属、变形杆菌属的检出率均为100%,对其余菌属检出率差异均无统计学意义(葡萄球菌属、肠球菌属、埃希氏菌属、肠杆菌属、不动杆菌属、伯克霍尔德氏菌属的χ2值分别为2.304、0.000、0.000、1.185、1.343、0.611、0.000,沙雷氏菌属、枸橼酸杆菌属、普罗威登斯菌属、窄食单胞菌属均经fisher检验;P均>0.05)。两系统鉴定结果不一致的80例菌株经16S r RNA基因测序,有47株被MALDI-TOF MS正确鉴定,有28株被Phoenix-100正确鉴定,且差异有统计学意义(χ2=9.060,P=0.003)。MALDI-TOF MS对念珠菌属、酵母菌属以及丝孢酵母菌属的检出率分别为90.7%、100%和100%。32株临床少见菌(芽孢杆菌属、乳杆菌属、丝孢酵母菌属、莫拉氏菌属、产单核李斯特菌等)经MALDI-TOF MS鉴定均得到可信结果。结论 MALDI-TOF-MS能够对葡萄球菌属、肠球菌属、肠杆菌科、非发酵菌群等临床常见细菌以及念珠菌属、酵母菌属等真菌进行可信鉴定,是临床微生物实验室病原菌诊断
- 高晶晶王亚南钟桥陆文香周颖吴元健徐卫东
- 关键词：质谱细菌鉴定
- 碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌耐药基因调查被引量：8
- 2016年
- 目的分析临床分离碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌耐药基因携带情况。方法收集2012-2014年临床分离碳青霉烯类药物耐药肠杆菌科菌株37株,采用改良Hodge试验和EDTA双纸片协同试验筛查碳青霉烯酶及金属酶表型,采用PCR法及基因测序方法调查耐药基因携带情况。结果 37株碳青霉烯类耐药肠杆菌科菌株包括肺炎克雷伯菌16株(43.2%)、大肠埃希菌6株(16.2%)、黏质沙雷菌6株(16.2%)、阴沟肠杆菌4株(10.8%)和弗劳地枸橼酸杆菌、阿斯肠杆菌、产酸克雷伯菌、成团泛菌、芳香沙雷菌各1株(各2.7%);耐药表型显示33株改良Hodge试验阳性,8株金属酶表型阳性;其中35株检出耐药基因,包括bla_(KPC)(21株)、bla_(IMP)(6株)、blaOXA-48(3株)、bla_(NDM-1)(3株)和bla_(VIM)(2株)。结论本院临床分离碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌以bla_(KPC)为主要耐药基因,其次为bla_(IMP)基因。
- 钟桥陆文香高晶晶张宇蔺张宇琼徐卫东
- 关键词：肠杆菌科细菌碳青霉烯酶金属酶
- 苏州地区耐左氧氟沙星无乳链球菌临床分离株分子及质谱学特征分析被引量：2
- 2020年
- 目的回顾分析苏州地区临床分离左氧氟沙星耐药无乳链球菌菌株分子及蛋白质谱学特征。方法收集2018年1月至2019年1月临床连续分离非重复耐左氧氟沙星无乳链球菌58株,用PCR法及Sanger基因测序方法检测gyrA、parC和parE基因突变、细菌血清型以及多位点序列分型;用ClinPro Tools 3.0软件对左氧氟沙星耐药菌株蛋白质谱特征峰进行筛选并验证。结果测序检出耐左氧氟沙星菌株以携带gyrA_Ser81Leu+parC_Ser79Tyr+parE_His225Tyr突变为主,占44.8%(26/58),以血清Ⅲ型和ST19型为主,并伴有血清Ⅰb型及ST23型流行;耐药菌株蛋白质谱峰分析显示6894、3445、5076、4544以及3721 m/z为主要特征峰。结论本地区耐左氧氟沙星无乳链球菌主要为gyrA_Ser81Leu+parC_Ser79Tyr+parE_His225Tyr突变,且以血清Ⅲ型及ST19型为主,具有以6894 m/z为代表的质谱特征峰。
- 张宇蔺苏宁陈海鹏秦国英陆文香徐卫东袁栎钟桥
- 关键词：无乳链球菌左氧氟沙星基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
- MALDI-TOF MS技术在快速鉴别肺炎链球菌与口腔/缓症链球菌中的应用被引量：6
- 2018年
- 目的 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）快速鉴别肺炎链球菌与口腔/缓症链球菌.方法 收集2013年4月至2016年12月南京医科大学附属苏州医院和苏州大学附属儿童医院临床分离的110株肺炎链球菌和108株口腔/缓症链球菌,并选择肺炎链球菌ATCC49619作为质控菌株,以菌落形态、奥普托欣敏感性试验、胆汁溶菌试验及PCR法检测lytA、spn9802和recA等基因作为判定菌株鉴定结果的参考方法.应用MALDI-TOF MS对所有菌株进行鉴定.选取其中的143株细菌（73株肺炎链球菌和70株口腔/缓症链球菌）作为模型建立菌株,选取剩余的76株细菌（38株肺炎链球菌和38株口腔/缓症链球菌）作为模型验证菌株.采用ClinProTools软件对所有细菌的质谱图谱进行分组统计分析.结果 通过GA、SNN和QC算法得出的敏感度均大于95%,而特异度均为100%.3种算法显示,质荷比为3443、4990、6956和9949 m/z的质谱峰是用于区分肺炎链球菌与口腔/缓症链球菌最为主要的特征性峰,其对应的曲线下面积（AUC）分别为0.884、1、0.999和0.972.峰统计图显示,肺炎链球菌组的3443、4990和9949 m/z峰的强度高于口腔/缓症链球菌组,而6956 m/z峰的强度低于口腔/缓症链球菌组.外部验证显示,除GA模型对肺炎链球菌组和口腔/缓症链球菌组的鉴定正确率分别为97.37%和100.0%,其余2种模型（SNN和QC）对两组细菌的鉴定正确率均为100.0%.结论 MALDI-TOF MS联合ClinProTools可快速准确地鉴别肺炎链球菌与口腔/缓症链球菌,具有高敏感度、高特异度等特点,可为临床诊断肺炎链球菌感染节约时间.
- 高晶晶王亚南杨艺陶云珍陆文香钟桥吴元健徐卫东
- 关键词：肺炎链球菌口腔链球菌光谱法基质辅助激光解吸电离
- 多重耐药鲍曼不动杆菌相关耐药基因的分析被引量：6
- 2015年
- 目的研究多重耐药鲍曼不动杆菌(MDR-AB)的耐药性,并分析其相关耐药基因tetA,tetB,sul1,dfrA,mdfA。方法 2012年8月至2013年3月江苏省镇江市第一人民医院住院患者的痰液标本中分离得到的MDR-AB菌株50株。应用纸片扩散法检测对抗菌药物的敏感度。采用聚合酶链反应(PCR)检测耐药基因tetA,tetB,sul1,dfrA1,mdfA。结果 50株MDRAB对头孢哌酮/舒巴坦、氨苄西林/舒巴坦、米诺环素、复方磺胺甲噁唑的耐药率分别为38%、64%、40%、50%,对其他参与试验的8种常见抗菌药物的耐药率均大于或等于94%。50株MDR-AB中检测到tetB、sul1和mdfA基因的表达,阳性率分别为70%、95%和45%。结论该研究中MDR-AB多重耐药情况比较严重,MDR-AB对四环素、复方磺胺甲噁唑类抗菌药物耐药与tetB、sul1及广谱抗菌药物外排泵基因mdfA等的表达密切相关。
- 高晶晶邢丽丹吴元健徐卫东钟桥王亚南李文静
- 关键词：鲍曼不动杆菌多重耐药耐药基因
- 多重耐药铜绿假单胞菌群体感应系统与主动外排基因表达的研究被引量：1
- 2011年
- 目的研究临床多重耐药铜绿假单胞菌群体感应(QS)系统与主动外排泵MexAB-OprM系统基因表达水平与抗生素耐药关系。方法收集苏州市立医院和上海市江湾医院2011年2月至6月间临床标本中分离的铜绿假单胞菌,定量分析细菌生物被膜形成能力;MIC法检测细菌抗生素耐药性,用多重聚合酶链反应(PCR)扩增群体感应系统lasI、lasR及主动外排泵系统mexA基因,实时定量逆转录RT-PCR检测lasI、lasR和mexA基因的相对表达量。结果临床样本分离出84株铜绿假单胞菌,其中产生物被膜菌58株,占比69%;多重耐药菌共24株,占比28.6%;多重耐药菌株中产生物被膜有11株,占45.8%;多重耐药菌中mexA基因表达上调有18株,占75%;lasI基因表达上调有8株,占33.3%。结论多重耐药菌株的生物被膜形成率显著低于非多重耐药组,多重耐药铜绿假单胞菌的主动外排泵MexAB-OprM系统基因表达出现显著上调,生物被膜菌的lasI基因表达显著上调而lasR基因的表达无明显变化。
- 李美芬徐卫东王莹超解范迪
- 关键词：多重耐药铜绿假单胞菌抗生素耐药生物被膜菌
