背景与目的:在DNA水平进行个体同一认定及亲缘鉴定,是目前获得准确结论的最直接的方法,而短串联重复序列(short tandem repeat,STR)复合扩增荧光检测技术是目前应用最广泛的DNA技术。但已有研究表明STR基因座在肿瘤组织中会发生明显高于正常组织或血液的变异。该研究的目的为探索20个常染色体STR基因座及Amel基因座在人肺癌组织中的变异规律,为肺癌组织的个人识别及亲缘鉴定提供依据。方法:收集75例人肺癌组织和相对应的癌旁正常组织,采用组织DNA提取试剂盒提取DNA,MicroreaderTM 21Direct ID System试剂盒进行PCR扩增,采用3130序列分析仪进行毛细管电泳,用Gene Mapper ID V3.2基因分析软件进行基因分型。结果:75例癌组织中有24例发生了STR位点的变异(32%),在21个常用STR基因座上共检出55次变异,其中等位基因增加10次,杂合性等位基因完全丢失10次,部分性丢失35次。D2S441、Penta E基因座未检出变异。结合目前实验结果与肺癌患者的临床资料分析,发现STR位点的变异与肺癌的分型、患者性别无联系(P>0.05),与肺癌的分期及患者年龄正相关,各组间比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论:肺癌组织中STR基因座较常发生变异,并且变异更可能在年龄大、恶性程度高的肺癌中发生;该实验检出D2S441、Penta E基因座无变异,在今后的研究中可加大样本量,进一步验证可否将其纳入稳定的STR基因座,为肿瘤组织等特殊检材的鉴定提供依据。
目的:研究高温后人体组织DNA的提取方法对DNA-STR分型的影响。方法:用不同浓度TritonX-100处理高温后的人体组织样本,采用Chelex-100提取DNA的方法,经DNA-STR复合扩增,用ABI-3130序列分析仪电泳分离并运用Genemapper ID V3.2基因分析软件对基因进行分型。结果:用1%TritonX-100+Chelex-100处理样本后提取DNA,再经QIA quickPCR纯化后可检出全部基因座且基因座能较平衡地扩增。结论:该方法简便易行,实验效果好,是法科学领域中一种值得推荐的方法,尤其适合检案。
