简平
- 作品数：14 被引量：55H指数：4
- 供职机构：四川农业大学动物医学院动物微生态研究中心更多>>
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- Illumina MiSeq测序平台测定蒙古羊瘤胃液相和固相菌群多样性被引量：19
- 2015年
- 本研究旨在比较蒙古羊瘤胃液相和固相细菌菌群多样性。应用Illumina Miseq测序平台的16S r RNA基因扩增子技术对采集自5只蒙古羊的瘤胃液相和固相样品进行高通量测序,采用UPARSE-操作分类单元(OTU)法和非加权组平均(UPGMA)法分析试验结果。结果表明,共获得91 971条序列和15 321个OTU,平均每个样品有13 138条序列和2 189个OTU。液相与固相样品相比:门水平分类上存在显著性差异的优势菌群为拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)(P<0.05),拟杆菌门在液相和固相样品中的比例分别为67%和45%;属水平分类上存在显著性差异的优势菌群为普氏菌属(Prevotella)和1种未鉴定(unknown)的属(P<0.05),液相样品优势菌群为普氏菌属,所占比例为53%,而固相样品优势菌群来自1种未鉴定的属,所占比例为32%;种水平分类上存在显著性差异的是栖瘤胃普雷沃菌(Prevotella ruminicola)(P<0.05),在液相和固相样品中所占的比例分别为41%和11%。与液相样品相比,固相样品的alpha多样性较好;主成分分析(PCA)和主坐标分析(PCo A)显示来自同一动物个体的瘤胃液相和固相样品聚类在一起。结果提示,蒙古羊瘤胃液相和固相样品均具有丰富的细菌菌群;与液相样品相比,固相样品细菌的多样性更好。
- 曾燕简平倪学勤周毅祝辉曾东
- 关键词：ILLUMINA液相固相多样性
- Illumina MiSeq测序平台测定蒙古羊瘤胃液相和固相菌群多样性
- 本研究旨在比较蒙古羊瘤胃液相和固相细菌菌群多样性。应用Illumina Miseq测序平台的16S rRNA基因扩增子技术对采集自5只蒙古羊的瘤胃液相和固相样品进行高通量测序,采用UPARSE-操作分类单元(OTU)法和...
- 曾燕简平倪学勤周毅祝辉曾东
- 关键词：液相固相多样性
- 文献传递
- 16S rRNA高通量测序分析川金丝猴肠道菌群研究
- 川金丝猴(Rhinopithecusroxellana)是中国特有的珍稀动物,具有极高的生态地位和研究价值,被誉为中国的第二国宝。人工饲养条件下,由于生存环境和食物结构的改变,川金丝猴的生长发育受到一定影响,免疫力下降、...
- 祝辉倪学勤简平
- 关键词：金丝猴肠道菌群高通量测序
- 植物乳杆菌BS22对黄曲霉毒素B_1的吸附效果及对肉鸡消化道菌群的影响被引量：7
- 2015年
- 为探明植物乳杆菌BS22对黄曲霉毒素的解毒作用及对肉鸡肠道菌群的影响,设饲料添加不同量的BS22试验(不饲喂)和饲料添加BS22饲喂肉鸡试验。在含有50μg黄曲霉毒素B1(AFB1)的1 kg饲料中加入106、107、108 CFU/g植物乳杆菌BS22,于加入0、15、30 d检测AFB1含量。检测结果:加入BS22后,各组饲料中的AFB1含量均显著下降;同一添加量下,随饲料贮存时间的增加,AFB1含量均有所提高。肉鸡饲喂设3个组:I组(对照组),饲喂基础日粮;II组,饲喂基础日粮+50μg/kg黄曲霉毒素B1;III组,饲喂基础日粮+50μg/kg黄曲霉毒素B1+1.0×108 CFU/g植物乳杆菌BS22。试验期为28 d。采用RCR–DGGE比较4周龄肉鸡嗉囊、腺胃、十二指肠、空肠、回肠及盲肠内容物及黏膜细菌群落的结构。对消化道内容物而言,除回肠外,消化道其他部位的内容物的细菌多样性指数、均匀度和丰富度均是III组的高于II组和对照组;聚类图显示,除腺胃和盲肠外,其他部位均是II组与对照组聚在一起,而III组单独存在。对消化道黏膜而言,除空肠和盲肠外,其他部位的黏膜的细菌多样性指数和丰富度均是II组的均高于III组和对照组,且III组和对照组的细菌多样性指数相近或相同;除回肠和盲肠外,其他部位III组和对照组聚在一起,而试验II组单独存在。综合分析,黄曲霉毒素B1对各肠段内容物菌群的作用不明显,对黏膜菌群有较大影响,尤其是对十二指肠的黏膜菌群影响更明显,植物乳杆菌BS22能调节由于黄曲霉毒素B1引起的肠道黏膜菌群失衡。
- 张艳曾东倪学勤王剑曾燕简平
- 关键词：植物乳杆菌黄曲霉毒素B1肠道菌群变性梯度凝胶电泳肉鸡
- 植物乳杆菌BS22对饲喂含黄曲霉毒素B1日粮肉鸡消化道菌群的影响
- 本试验旨在分析植物乳杆菌BS22对饲喂含黄曲霉毒素B1日粮肉鸡消化道内容物和黏膜菌群的影响。试验分为对照组Ⅰ(基础日粮);试验组Ⅱ(基础日粮+50μg/kg黄曲霉毒素B1);试验组Ⅲ(基础日粮+50μg/kg黄曲霉毒素B...
- 张艳曾东倪学勤王剑曾燕简平
- 关键词：植物乳杆菌黄曲霉毒素PCR-DGGE克隆测序肉鸡
- 三株益生菌对瘤胃体外发酵的影响
- 2016年
- 通过体外产气法研究三株益生菌(植物乳酸杆菌、枯草芽孢菌、啤酒酵母)对瘤胃体外发酵的影响。试验设乳酸杆菌组、酵母菌组、芽孢杆菌组和对照组,分别在4 h、6 h、9 h、12 h、18 h、24 h、36 h、48 h测定产气量,发酵48 h后检测乳酸杆菌、芽孢菌和酵母菌数量。结果表明:植物乳酸杆菌、啤酒酵母能明显促进瘤胃体外发酵,植物乳酸杆菌发挥作用较快,而啤酒酵母较慢但增殖能力更强。
- 陈泽慧白洁霞简平王跃麟倪学勤曾东
- 关键词：益生菌体外瘤胃发酵产气
- 不同年龄段川金丝猴肠道菌群结构差异分析被引量：18
- 2015年
- 本试验旨在分析幼年、成年、老年川金丝猴肠道菌群结构以及随年龄变化的趋势。将提取的幼年、成年、老年川金丝猴粪样总DNA进行聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(PCRDGGE),对结果进行UPGMA聚类分析、主成分分析、生物多样性比较。用荧光定量PCR技术检测肠道菌群中真细菌、乳酸杆菌属(Lactobacillus spp.)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、双歧杆菌属(Bifidobacterium spp.)的数量。结果显示:无论是UPGMA聚类分析,还是主成分分析以及生物多样性比较均表明,不同年龄段川金丝猴肠道菌群多样性存在明显差异;指纹图谱中成年与幼年川金丝猴的优势条带较多,老年川金丝猴的优势条带则较少。各年龄段川金丝猴肠道菌群中真细菌的数量都为同一数量级(1011);幼年川金丝猴肠道菌群中Enterobacteriaceae的数量显著少于成年和老年川金丝猴(P<0.05);成年川金丝猴肠道菌群中Lactobacillus spp.的数量极显著多于幼年和老年川金丝猴(P<0.01);老年川金丝猴肠道菌群中Bifidobacterium spp.的数量极显著少于成年和幼年(P<0.01)。由此得出,川金丝猴肠道菌群随年龄增长,多样性呈幼年到成年增加、成年到老年降低的趋势,老年时期优势菌群显著减少;此外,川金丝猴肠道各菌群的数量在不同年龄段有较大差异。
- 简平王强王剑牛李丽祝辉曾燕倪学勤曾东
- 关键词：川金丝猴年龄肠道菌群荧光定量PCRPCR-DGGE
- 荧光定量PCR检测圈养羚牛粪中三种纤维分解菌被引量：1
- 2013年
- 采用荧光定量PCR技术检测圈养羚牛粪样中3种纤维分解菌:白色瘤胃球菌、黄色瘤胃球菌、产琥珀酸丝状杆菌的数量。提取羚牛粪便中微生物总DNA,分别以3种纤维分解菌特异性引物进行模板片段扩增,10倍系列稀释,检测Ct值,建立标准曲线。提取各待测样品DNA,进行荧光定量PCR反应测定Ct值,并与标准曲线比较得出定量结果。结果显示,所构建的各标准曲线均具有很高的相关性(R2>0.99),说明成功构建了标准曲线。1号牛粪样中白色瘤胃球菌、黄色瘤胃球菌、产琥珀酸丝状杆菌的数量分别为3.09×107、2.24×106、5.13×107拷贝数/g,2号牛粪样中三种菌数量分别为4.57×106、2.24×106、2.88×107拷贝数/g,3号牛粪样中三种菌数量分别为5.12×106、1.86×106、8.91×107拷贝数/g。结果表明,3头羚牛之间的纤维分解菌的数量存在差异,但均以产琥珀酸丝状杆菌的数量最高,为主要的纤维分解菌。
- 王强牛李丽严慧娟简平曾东祝辉倪学勤
- 关键词：羚牛纤维分解菌荧光定量PCR
- 16S rRNA高通量测序分析川金丝猴肠道菌群研究
- 川金丝猴(Rhinopithecusroxellana)是中国特有的珍稀动物,具有极高的生态地位和研究价值,被誉为中国的第二国宝。人工饲养条件下,由于生存环境和食物结构的改变,川金丝猴的生长发育受到一定影响,免疫力下降、...
- 祝辉倪学勤简平
- 关键词：金丝猴肠道菌群高通量测序
- 文献传递
- 植物乳杆菌BS22对饲喂含黄曲霉毒素B1日粮肉鸡消化道菌群的影响
- 本试验旨在分析植物乳杆菌BS22对饲喂含黄曲霉毒素B1日粮肉鸡消化道内容物和黏膜菌群的影响.试验分为对照组Ⅰ(基础日粮)；试验组Ⅱ(基础日粮+50μg/kg黄曲霉毒素B1)；试验组Ⅲ(基础日粮+50μg/kg黄曲霉毒素B...
- 张艳曾东倪学勤王剑曾燕简平
- 关键词：植物乳杆菌黄曲霉毒素PCR-DGGE克隆测序肉鸡
