胡园园
- 作品数：19 被引量：60H指数：4
- 供职机构：中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心传染病预防控制国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 中国南方四省区流行的HIV-1 CRF01_AE病毒株基因特征研究被引量：18
- 2009年
- 目的分析中国南方四省区HIV-1感染者中流行CRF01_AE病毒株的遗传特征。方法从广东、广西、江西和湖南省（自治区）2006年新报告HIV-1感染者的血浆样本中提取病毒RNA，用反转录／巢式PCR方法扩增gag和env基因片段，对获得的CRF01_AE病毒株核酸序列进行系统进化分析，并通过计算基因距离和Entropy核苷酸多态性差异方法分析毒株的遗传特征。结果从210例CRF01_AE病毒株感染者中，发现四省区流行的CRF01_AE病毒株存在2个主要的流行簇。流行簇Ⅰ共有123例样本，未发现与之直接相关的国际参考毒株。流行簇Ⅱ共有57例样本，与越南CRF01AE病毒株关系密切，且存在不同时间样本的混杂。gag和env基因遗传距离分析结果表明，流行簇Ⅰ内基因遗传多样性均明显小于流行簇Ⅱ；核苷酸多态性分析结果显示，在gag基因片段42个位点核苷酸组成具有显著差异，env基因片段40个位点核苷酸组成存在显著差异；流行簇Ⅰ相对于流行簇Ⅱ多态性减少的位点上有61个，多态性增加的位点有21个。结论在中国南方四省区流行的CRF01_AE病毒株中首次观察到2个独立的流行簇。流行簇I病毒株为该地区最主要的CRF01_AE病毒株，其流行时间相对较短，在人群中所占比例较多，可能是病毒在流行过程中形成的具有传播优势的病毒株。流行簇Ⅱ病毒与来自于越南的CRF01_AE病毒株有较高同源性，且存在与越南病毒株问的多次传播。
- 程春林冯毅何翔林鹏梁淑家易志强贺健梅胡园园邢辉范雁吴士良邵一鸣
- 关键词：病毒株HIV-1进化分析
- HIV-1 B′亚型毒株感染者广谱中和活性样本不同时间点env基因变异研究
- 2017年
- 目的探讨具有广谱中和活性的艾滋病病毒-1型(HIV-1)B′亚型毒株感染者,连续五个时间点样本的膜蛋白基因(env)序列的特征。方法采用单基因组扩增法扩增env基因。分析不同时间点env基因序列的特征及代表性广谱中和抗体(bNAbs)表位的变异。结果 env基因系统进化分析发现,感染者体内包含优势和劣势两个不同株系的病毒,优势株系毒株可变区多样性随时间增大,尤以V1V2环序列长度和糖基化位点变异程度最高;优势和劣势株系病毒的顶端四肽分别为GQGR和GPGK,辅助受体均为CCR5。代表性广谱中和抗体表位分析显示,2G12和PG9/PG16识别的关键位点存在变异。结论 B′亚型毒株感染者体内包含优势和劣势两个不同株系的病毒,优势株系病毒在中和选择压力下不断进化;单抗表位变异分析表明,感染者体内可能存在2G12和PG9/PG16样抗体。
- 胡园园邹森齐中伟侯佳丽张岱任莉邵一鸣郝彦玲
- 关键词：膜蛋白基因中和抗体免疫逃逸
- HIV-1B'亚型毒株感染者Nef蛋白氨基酸序列变异分析被引量：3
- 2015年
- 目的分析HIV-1 B’亚型毒株Nef蛋白重要功能区及CTL表位氨基酸序列变异特征。方法从137例HIV-1感染者的血浆样本中提取病毒RNA,进行逆转录获得c DNA,再经巢式PCR扩增全长Nef基因并纯化测序。利用Bio Edit、Mega6.0软件分析所获得的Nef基因重要功能区的氨基酸变异,并比较所获得的Nef基因共享序列与我国B亚型Nef共享序列及国际B亚型Nef共享序列的CTL表位情况。结果 HIV-1 B’亚型毒株Nef蛋白N端豆蔻酰化信号区、蛋白酶加工区、酸性区、Pak结合区、Pxx P区等功能区氨基酸序列较为保守,但有3个功能区中存在变异率大于30%的氨基酸位点,其中长度可变区的21号密码子上的R被E/K/Q取代的变异率达56.21%(R21E 24.09%,R21K 19.71%,R21Q 12.41%),COPI结合区EE154-155的E154被K取代的变异率为32.85%,双亮氨酸基序Exxx LL160-165的S163被C取代率为30.66%。本研究所得的137条Nef蛋白的共享序列的CTL表位与我国HIV-1 B亚型的共享序列CTL表位一致,而与国际B亚型共享序列相比有两个肽段表位的氨基酸发生了变异。结论 HIV-1 B’亚型毒株Nef蛋白多数重要功能区及CTL表位的氨基酸序列较保守,但有3个功能区存在变异率大于30%的氨基酸位点,这种特性可能影响病毒致病作用。
- 陈燕丽胡园园郝金娟任莉邵一鸣洪坤学
- 关键词：HIV-1NEF蛋白功能区CTL表位
- HIV-1广谱中和活性感染者假病毒的中和表型分析被引量：2
- 2017年
- 目的分析HIV-1广谱中和活性感染者基于膜蛋白基因(env)的假病毒对自体血浆和代表性广谱单克隆中和抗体(bm NAbs)的中和表型。方法单基因组扩增(SGA)广谱中和活性感染者第0月血浆的env基因并克隆至pc D-NA^(TM)3.1 Directional TOPO表达载体,将env表达质粒与HIV-1骨架质粒p SG3△env共转染293T/17细胞制备假病毒,用假病毒分别与自体连续时间点血浆和代表性bm NAbs进行中和实验分析中和表型。结果共获得11株功能性假病毒,假病毒对8个连续时间点自体血浆的中和敏感性呈现先升高(第0~15月),后下降(第16~32月),之后再上升(第33~45月)的波动。所有假病毒对10E8、PGT121和VRC01中和敏感(IC_(50)<6μg/m L);各有18.2%(2株)的假病毒对12A21和2G12高度敏感(IC_(50)<1μg/m L);所有病毒均对PGT135呈中和抗性。结论假病毒对当前时间点血浆的中和敏感性低,对之后时间点血浆中和敏感性增强,提示感染者体内病毒与中和抗体的动态进化过程。同一时间点假病毒对特定bm-NAbs的敏感性差异明显,提示感染者准种毒株间中和表型的复杂性。
- 邹森张岱胡园园齐中伟侯佳利任莉邵一鸣洪坤学
- 关键词：HIV-1膜蛋白假病毒
- HIV-1广谱中和抗体的结合表位研究被引量：2
- 2020年
- 目的在1例具有广谱中和活性的慢性HIV-1感染者(DRVI01)血浆样本中,分析潜在的中和抗体特异性。方法查找已知的HIV-1广谱中和抗体(bNAbs)的关键氨基酸位点,分析DRVI01来源不同时间点的膜蛋白序列。对存在频繁变异的关键氨基酸位点进行回复突变,比较突变前后的假病毒与自体血浆中和敏感性的差异,推测可能存在的bNAbs。结果在DRVI01来源的6个时间点155条膜蛋白序列中,查找存在频繁突变的10类bNAbs的关键氨基酸位点,其中gp41融合肽、gp120/gp41交界面两类bNAbs的关键氨基酸位点存在较多的变异。对这些位点回复突变后,后一个时间点及同一时间点的自体血浆,对大部分突变株病毒的中和能力明显增强。结论具有广谱中和活性的HIV-1感染者(DRVI01)体内,可能存在与gp41融合肽类及gp120/gp41交界面类bNAbs的中和特异性。
- 张岱张岱胡园园邹森邹森
- 关键词：HIV-1膜蛋白中和抗体进化
- 河南睢县3岁以下儿童携带屎肠球菌耐药性及多位点序列分型研究被引量：1
- 2016年
- 目的：了解河南睢县3岁以下儿童携带屎肠球菌耐药性和携带毒力基因情况,并对分离菌株进行多位点序列分型研究。方法应用K-B纸片法检测屎肠球菌对15种常见抗生素的耐药性；PCR方法检测屎肠球菌携带毒力基因的情况；多位点序列分型（ multilocus sequence typing, MLST）方法对分离菌株进行分型。结果从120份河南睢县3岁以下儿童粪便标本中分离到47株屎肠球菌。在47株屎肠球菌中耐药菌株的比例为95.7%,分离菌株对大环内酯类、四环素以及利福平等多种抗生素广泛耐药,对临床常用于屎肠球菌感染治疗的β-内酰胺类以及氨基糖苷类抗生素耐药率亦高。未检测到对万古霉素、利奈唑胺、氯霉素和呋喃妥因耐药的菌株。3种以上抗生素耐药菌株都属于一个克隆群,其中包括12株携带透明质酸酶（ hyalronidase,hyl）毒力基因的克隆复合群17（clonal complex 17, CC17）屎肠球菌。结论河南睢县3岁以下儿童携带屎肠球菌对多种抗生素广泛耐药,耐药菌株中存在携带毒力基因的CC17克隆群的菌株。
- 胡守奎周娟胡园园熊衍文金东
- 关键词：屎肠球菌耐药性毒力基因
- 广谱中和活性样本HIV-1 Env基因的氨基酸及密码子使用特点研究
- 2021年
- 目的:分析具有高广谱中和活性的HIV-1感染者包膜蛋白(Env)基因的氨基酸及密码子使用特点。方法:根据中和宽度是否高于90%将样本分为高广谱中和活性组(hBCN+组)和非高广谱中和活性组(hBCN-组),采用单拷贝基因组扩增法(SGA)分离全长Env基因,通过两组样本Env基因的相对氨基酸使用度(RAAU)的对应性分析(COA),并基于相似性指数D(A,B)计算及与宿主相对密码子使用度(RSCU)的比对探讨两组毒株的氨基酸及密码子使用特点。结果:对应性分析结果显示hBCN+组和hBCN-组毒株RAAU数据沿两个主轴分布形成两个相对独立的簇,表明两组毒株Env基因具有相对独特的氨基酸使用模式;相似性指数分析结果显示hBCN+组(0.097)低于hBCN-组(0.102),且两组毒株相比较,hBCN+组Env基因与人具有相似使用模式的密码子少于hBCN-组,提示hBCN+组毒株在感染者体内的适应性较hBCN-组毒株低。结论:hBCN+和hBCN-两组毒株的Env基因具有相对独特的氨基酸使用模式,hBCN+组毒株对宿主的适应性较hBCN-组毒株低。
- 孙莎莎胡园园刘颖任莉阮玉华马丽英邵一鸣洪坤学
- 关键词：HIV-1膜蛋白
- 一组靶向HIV膜蛋白的单克隆抗体的分离和功能鉴定
- 2021年
- 目的从中国人类免疫缺陷病毒I型(human immunodeficiency virus type I, HIV-1)慢性感染者体内筛选针对膜蛋白的单克隆抗体并对其进行功能鉴定。方法采用单细胞特异性分选的方法从HIV-1感染者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells, PBMCs)中筛选抗原特异性单个B细胞,通过逆转录和巢式PCR获得抗体重链和轻链的可变区基因。利用免疫遗传学数据库(immunogenetics database, IMGT)分析抗体基因家系及突变率。抗体表达纯化后,采用酶联免疫吸附实验(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA)鉴定其结合活性和识别表位,通过假病毒中和实验检测抗体中和能力。结果从1例慢性HIV-1感染者样本中筛选得到7个HIV-1膜蛋白特异性抗体。抗体重链可变区基因来自IGHV1-69*09、IGHV1-08*01、IGHV1-46*01、IGHV4-34*01、IGHV4-61*01和IGHV3-43*02家系,突变率为10.76%~21.05%。轻链可变区基因来自IGKV3-20*01、IGKV1-39*01、IGKV1-NL1*01、IGKV3-15*01和IGKV1-9*01家系,突变率为6.03%~18.64%。7个抗体均可以结合gp140,其中抗体508-B1、508-C1、508-C5、508-D4和508-E5主要识别gp41区;508-D6和508-F1结合gp120区。508-D4和508-F1分别可以中和Global Panel假病毒盘中的CNE8(Tier 2)和X2278(Tier 2),IC50值分别为38.1 μg/ml和41.7 μg/ml。结论本研究成功筛选得到7个HIV-1膜蛋白特异性的单克隆抗体,其中5个为识别gp41区的单克隆抗体,2个为gp120结合抗体。2个抗体具备有限的中和能力。该组抗体可为HIV-1检测试剂和抗体药物研发以及艾滋病疫苗免疫原设计提供技术储备。
- 胡园园亢佳星郝彦玲任莉王硕洪坤学邵一鸣王铮李丹
- 关键词：HIV-1中和活性表位单克隆抗体
- 昆明市静脉吸毒感染者HIV-1env基因C2-V4区序列特征分析被引量：3
- 2017年
- 目的分析昆明市静脉吸毒(intravenous drug user,IDU)感染者艾滋病病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)env基因C2-V4区序列特征及代表性广谱单克隆中和抗体(broadly monoclonal neutralizing antibodies,bm NAbs)的表位变异。方法在昆明市收集165份IDUHIV-1感染者血浆样品,提取RNA,通过逆转录得到cDNA,巢式聚合酶链反应(nested-polymerase chain reaction,nested-PCR)扩增HIV-1膜蛋白基因C2-V4区,应用Bio Edit和MEGA等生物信息软件分析所获得序列的特征,并分析2G12、PGT135、PGT128、b12和VRC01等bm NAbs的表位变异。结果 165条序列主要为CRF08_BC(74.55%)和CRF07_BC(23.03%)重组毒株,各可变环变异程度由小到大为V3区
- 邹森高占齐中伟任莉胡园园王铮洪坤学
- 关键词：人免疫缺陷病毒1型流行病学研究
- HIV-1 B’病毒包膜蛋白序列特征与广谱中和活性相关性的初步分析
- 研究背景动物实验表明被动输入中和单抗后经生殖道或者直肠黏膜攻毒能保护猴子不被SHIV感染;母婴垂直传播研究显示未传染给婴儿的孕妇体内的中和抗体反应要高于传染给婴儿的孕妇;给HIV-1病人输入中和抗体能够延缓停止抗病毒治疗...
- 胡园园
- 关键词：HIV单克隆抗体包膜糖蛋白
- 文献传递
