苏兰莹
- 作品数:3 被引量:3H指数:1
- 供职机构:吉林大学计算机科学与技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于递归神经网络构建基因调控网络的研究
- 分子生物学的深入研究揭示了复杂生命现象是基因相互调控的结果,但是至今为止人们尚未完全清楚基因调控的机制,为理解生物系统的内在模式和机制,有效构建基因调控网络是当前功能基因组学研究的重要内容。 本文在分析了现有各基因调控网...
- 苏兰莹
- 关键词:基因调控网络递归神经网络模拟退火算法免疫系统
- 文献传递
- 采用结构与参数训练相结合的RNN模型构建基因调控网络被引量:2
- 2010年
- 提出一种采用递归神经网络模型构建基因调控网络,将结构训练与参数训练相结合的方法进行网络的权值训练.采用模拟退火算法训练网络结构,找出调控关系权值,再引入基于免疫思想的粒子群算法对权值进行参数优化,得到基因调控网络图.并分别用人工数据和大肠杆茵DNA修复系统基因数据进行实验.实验结果表明,该方法能有效地从基因时序数据中揭示基因间的调控关系.
- 苏兰莹刘桂霞杨雅辉刘昱昊周春光
- 关键词:基因调控网络递归神经网络模拟退火算法免疫系统粒子群算法
- 边排序贝叶斯网络结构学习算法应用于基因调控网络构建被引量:1
- 2010年
- 提出一种基于多数据源融合思想的贝叶斯网络结构学习算法.该方法在现有贝叶斯网络结构学习算法的基础上,进行网络结构再学习,能有效处理不同数据源无法简单合并的问题.实验结果表明:在现有基因芯片数据节点数过多但数据量过少的前提下,该算法能有效提高建网精度;基于酿酒酵母细胞周期对不同实验条件下的表达数据进行融合,可以将正确率提高约12%.
- 刘昱昊刘桂霞苏兰莹郑山红王晗周春光
- 关键词:基因调控网络贝叶斯网络