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费忠安

作品数:4 被引量:8H指数:2
供职机构:四川大学生命科学学院更多>>
发文基金:国家科技支撑计划质检公益性行业科研专项项目国家质检总局科技计划项目更多>>
相关领域:生物学农业科学轻工技术与工程化学工程更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 3篇生物学
  • 1篇化学工程
  • 1篇轻工技术与工...
  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇多样性
  • 1篇衣藻
  • 1篇油菜
  • 1篇油菜菌核
  • 1篇油菜菌核病
  • 1篇油菜菌核病菌
  • 1篇脂肪酶
  • 1篇脂肪酶菌株
  • 1篇中肠
  • 1篇生境
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇全基因组
  • 1篇群落
  • 1篇系统发生树
  • 1篇细菌群落
  • 1篇菌核
  • 1篇菌核病
  • 1篇菌核病菌
  • 1篇克隆文库

机构

  • 4篇四川大学
  • 1篇四川出入境检...

作者

  • 4篇乔代蓉
  • 4篇曹毅
  • 4篇费忠安
  • 2篇岳建宇
  • 2篇徐辉
  • 1篇赵锋
  • 1篇吕林峰
  • 1篇费保进
  • 1篇钟玮
  • 1篇余英鹏
  • 1篇刘杨
  • 1篇林家富
  • 1篇赵锐

传媒

  • 4篇应用与环境生...

年份

  • 1篇2015
  • 1篇2013
  • 2篇2012
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
基于全基因组预测莱茵衣藻的新miRNA及其靶基因被引量:3
2015年
莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)是一种重要的模式生物,其miRNA的发现相对较晚.为系统化地预测分析莱茵衣藻的miRNA,采用比较基因组和同源比对相结合的方法,根据mi Rbase中已知的莱茵衣藻miRNA序列以及前体的特点,并且基于莱茵衣藻的全基因组对其miRNA的前体序列和成熟miRNA进行系统的分析和筛选,使用unigene和JGI的莱茵衣藻相关序列数据库对预测结果进行靶基因预测和功能的分析.最终发现可能存在的miRNA 36条,其前体结构符合miRNA前体的基本特征且具有高度的同源性,两个数据库所得相匹配靶基因分别为64和32条,其中部分是与莱茵衣藻各项生命活动相关的基因.本研究表明莱茵衣藻的基因组中具有可能存在的新miRNA家族,并且部分有高度匹配的靶基因,为其后续研究提供了可靠的理论支持.
岳建宇费忠安郎小强徐辉乔代蓉曹毅
关键词:莱茵衣藻MIRNA全基因组比较基因组学靶基因生物信息学
家蝇中肠细菌群落组成分析被引量:3
2013年
家蝇(Musca domestica)是重要的医学媒介昆虫,是许多病原体传播的机械媒介和生物媒介.为了研究家蝇中肠内微生物的群落结构,了解家蝇在疾病传播中的作用,构建了家蝇中肠细菌的16S rRNA基因克隆文库.文库包括88条序列,分别属于22个操作分类单元(OTUs),其中12个OTUs属于变形菌门(Proteobacteria),9个OTUs属于厚壁菌门(Firmicutes),1个OTU属于拟杆菌门(Bacteroidetes).变形菌门中,Gammaproteobacteria有10个OTUs,Betaproteobacteria和Epsinoproteobacteria各1个OTU,未发现Alphaproteobacteria和Deltaproteobacteria.厚壁菌门中,6个OTUs属于Lactobacillales,1个OTU属于Clostridia,2个OTUs属于Bacillales.文库中Gammaproteobacteria有71条序列,占总序列数的80.7%,是优势种类.文库中的肠杆菌属(Enterobacter)、克雷伯菌属(Klebsiella)、普罗威登斯菌属(Providencia)、变形杆菌属(Proteus)、气单胞菌属(Aeromonas)和葡萄球菌属(Staphylococcus)中的许多种类都是条件致病菌和致病菌.研究结果将有助于了解家蝇在疾病传播中的作用.
刘杨钟玮费忠安赵锋乔代蓉曹毅
关键词:家蝇中肠细菌群落RRNA基因克隆文库
油菜菌核病菌(Sclerotinia sclerotiorum)与细菌间的基因水平转移被引量:2
2012年
油菜菌核病(Sclerotinia sclerotiorum)是油菜生产上最重要的病害之一,其致病性可能来源于基因水平转移(Horizontal gene transfer,HGT).为认识其致病原理和寻找新的真菌抑制剂的靶点,首先通过BLASTp发现其基因XM_001585458.1编码蛋白XP_001585508.1与细菌比对结果中出现低E值3.23e-109和高SCORE值436,暗示存在HGT现象;进一步通过系统进化树的建立,发现该蛋白在进化分枝上更接近于细菌中由Streptomyces sp.C的NZ_CM000832.1基因编码的蛋白ZP_07291173;同时核苷酸组成分析也发现该基因与油菜菌核病菌基因组的碱基组成有较大差别,GC含量提高了14.95%.这些结果证明了XM_001585458.1的确存在基因水平转移事件.结构分析和COG蛋白功能分类显示该HGT序列编码蛋白XP_001585508.1具有FA58C_3(Coagulation factors 5/8 type C domain)、Kelch repeat type 1、Galactose-binding domain-like、Galactose oxidase/kelch,beta-propeller等保守结构域,应为一个膜蛋白并参与多糖代谢,推测该水平转移基因与S.sclerotiorum在侵染植物时进行细胞壁水解和致病性有关.
吕林峰岳建宇费忠安赵锐乔代蓉曹毅
关键词:基因水平转移油菜菌核病系统发生树碱基组成
不同生境产脂肪酶菌株的筛选及多样性
2012年
为发掘不同特性脂肪酶微生物资源,采用纯培养方法从青海高寒草地、雅安山区、成都平原分离得到产脂肪酶菌株54株.通过对菌株的DNA进行ERIC-PCR指纹图谱分析,按聚类树划分为5个操作分类单元.16S rDNA序列测定和聚类分析显示,分离菌株分布于芽孢杆菌属(Bacillus)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、假单胞菌属(Pseudomonas)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、肠杆菌属(Enterobacter).多样性分析表明,与青海高寒草地、雅安山区相比,成都平原产脂肪酶菌株遗传多样性更为丰富.在54株菌中都出现了300 bp和1 300 bp两个特异且稳定出现的条带,这两个特异条带可能是产脂肪酶菌株的SCAR标记条带.
徐辉林家富费忠安费保进余英鹏乔代蓉曹毅
关键词:碱性脂肪酶ERIC-PCR
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