鲁志
- 作品数：19 被引量：21H指数：2
- 供职机构：清华大学更多>>
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- 相关领域：生物学医药卫生理学文化科学更多>>
- 体液样本中鉴定胞外RNA生物标志物的试剂盒及方法
- 本发明公开了体液样本中鉴定胞外RNA生物标志物的试剂盒及方法。本发明提供了获得癌症患者体液exRNA生物标志物的方法，本发明研究出针对体液exRNA特点的预处理、降噪、归一化方法，同时利用机器学习为主的最新人工智能技术，...
- 鲁志史斌斌李洋陈旭鹏
- Predict noncoding RNAs' secondary structures by integrating high-throughput probing data and energy model
- I will introduce and present two bioinformatics software packages,RNAfinder and RNAstructure and their biologi...
- 胡龙吴杨鲁志
- 非编码RNA的生物信息学研究方法:RNA结构预测及其应用被引量：5
- 2014年
- 近10多年来的研究逐步揭示了RNA的各种生物学功能。RNA不仅是信息从DNA传递到蛋白质的中间体,还直接参与基因沉默、表观遗传学修饰等生物学过程。单链的RNA在体内通过碱基配对折叠成一定的二级结构。介绍了现在预测RNA二级结构的主要算法及其应用,其中包括基于热力学、同源比对和统计学习的各种算法,以及如何引入实验数据辅助预测。二级结构预测算法被广泛用于寻找RNA功能单元和预测新非编码RNA等各种问题。如何利用高通量实验数据帮助结构预测,探索长非编码RNA功能,研究RNA与蛋白质相互作用,是RNA二级结构预测算法和应用的一些前沿方向。
- 张浩文杨禹丞鲁志
- 关键词：RNA二级结构预测自由能非编码RNA
- 一种RNA文库的构建方法
- 本发明提供了一种RNA文库的构建方法，包括在反转录阶段引入样本标签序列(barcode)，实现多样本混合建库(multiplexing)，从而显著提高实验的效率，并降低样本的投入量，并采用CRISPR‑Cas9的方法，去...
- 鲁志王红科
- 多物种特征选择及鉴定未知基因的方法
- 本发明公开一种多物种特征选择及鉴定未知基因的方法，属于生命科学领域。所述多物种特征选择的方法，包括对覆盖全基因组的小片段区域进行特征赋值和贴注标签处理及物种内、物种间特征选择部分。本发明依靠整合不同物种间的基因共性来构建...
- 鲁志胡龙
- Characterize novel lncRNAs by integrating structure prediction with sequencing data
- 我将介绍一种具有整合性的基于机器学习的算法--incRNA,它可以鉴定全基因组内的非编码RNA(ncRNA)。这种算法可以在蛋白质和核酸的层面上将大量的表达数据、表观遗传学数据、RNA二级结构稳定性以及进化保守性结合起来...
- 鲁志
- 一种与肝癌相关的非编码RNA生物标志物及其应用
- 本发明公开了一种与肝癌相关的非编码RNA生物标志物及其应用。本发明公开的与肝癌相关的非编码RNA为如下a1)或a2)或a3)：a1)RN7SL1S结构域片段，为序列表中序列1的第242‑299位所示的RNA分子；a2)R...
- 鲁志曹静怡谈畅
- 文献传递
- 一种用于肝细胞癌早期筛查的系统
- 本发明公开了一种用于肝细胞癌早期筛查的系统。所述用于肝细胞癌早期筛查的系统包括检测SNORD3B‑1、hsa‑circ‑0080695和hsa‑miR‑122三个ncRNA表达量的系统。所述检测SNORD3B‑1、hsa...
- 鲁志朱昱敏
- 文献传递
- 体液样本中鉴定胞外RNA生物标志物的试剂盒及方法
- 本发明公开了体液样本中鉴定胞外RNA生物标志物的试剂盒及方法。本发明提供了获得癌症患者体液exRNA生物标志物的方法，本发明研究出针对体液exRNA特点的预处理、降噪、归一化方法，同时利用机器学习为主的最新人工智能技术，...
- 鲁志史斌斌李洋陈旭鹏
- 文献传递
- 新型长链非编码RNA(lncRNA)的生物信息学研究进展被引量：15
- 2013年
- 非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)是指不被翻译成蛋白质的一类RNA,近几年来关于它们的功能研究越来越引起人们的重视.现在已经发现了一些中小型ncRNA,比如microRNA、snoRNA、tRNA等,但是关于长ncRNA(lncRNA)的研究还不够完善.本篇综述回顾了ncRNA特别是lncRNA的生物信息学研究进展,包括它们的研究历程、基本特点、与疾病的关系,以及对已有的预测非编码RNA的计算机方法进行了分析和比较,并且介绍了利用机器学习模型整合新一代高通量测序数据的方法.
- 原佳沛张浩文鲁志
- 关键词：非编码RNA长链非编码RNA
