丁晓琴
- 作品数：67 被引量：125H指数：7
- 供职机构：北京药物化学研究所更多>>
- 相关领域：理学医药卫生化学工程生物学更多>>
- 短裸甲藻毒素的结构—活性关系研究
- 陈常英冯珊丁晓琴
- 关键词：构效关系活性
- 计算化学与化学武器公约（CWC）
- 1997年正式生效的《关于禁止发展、生产、储存和使用化学武器及销毁此种武器的公约》（简称化学武器公约（CWC））,至今已有22年。CWC制定了严格的宣布与核查措施（包括常规例行视察和质疑性视察）,并要求在其生效后全面执行...
- 丁晓琴丁俊杰潘里李大禹王亮亮
- 文献传递
- 甲胺磷碱性水解机理与反应速率常数理论计算被引量：1
- 2013年
- 运用密度泛函(DFT)理论,研究了农药甲胺磷分子在碱性条件下,水解微观反应机理和速率常数。在B3LYP/6-31+G(d,p)水平上分别优化了水溶液相反应途径上各反应态的几何结构,溶剂化模型采用连续极化连续模型(CPCM)。并用频率分析方法和内禀反应坐标(IRC)计算,分别确认了过渡态的结构和反应途径。计算结果表明,反应决速步骤为第一步氢氧根离子进攻反应物,对3个不同离去基团(甲氧基TS2、甲硫基TS1和氨基TS5)活化自由能分别为15.64 kcal/mol、17.19 kcal/mol和25.80 kcal/mol。采用经Wigner校正的Eyring过渡态理论,计算了(100～1200)K温度范围内的各通道反应速率方程分别为,InK(C-O)=11.19524-2.37134×1000/T;Ink(C-S)=11.68184-3.28612×1000/T;Ink(C-N)=12.03234-7.73338×1000/T,3个方程的相关系数分别为R=-0.99809;-0.99891;-0.99981。计算结果显示甲胺磷在碱性条件下不稳定,能水解,并首先解离的是甲氧基和甲硫基,反应具有较大的自发反应趋势,氨基在碱性条件下不易离去。研究结果为解析有机磷杀虫剂在不同条件下的水解反应机制提供理论依据。
- 丁晓琴丁俊杰孙杨陈冀胜
- 关键词：甲胺磷速率常数
- 葡萄球菌肠毒素B亲和体的分子设计研究
- 亲和体是一种新型的蛋白质配体,可作为抗体的替代品,用于蛋白质识别、实验诊断、分子显像及靶向治疗等。本文采用分子模拟的方法,对应用噬菌体展示方法获得的9个亲和体和葡萄球菌肠毒素B（SEB）进行三维结构搭建和优化,应用蛋白-...
- 丁俊杰高川潘里王亮亮丁晓琴
- 关键词：分子对接分子设计
- 文献传递
- 二氢吡啶类化合物的三维定量构效关系被引量：7
- 2003年
- 通过分子力学和量子化学计算,得出两种二氢吡啶衍生物的低能构象,再应用比较分子力场分析方法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA)分别对两种构象的43个二氢吡啶衍生物进行3D-QSAR研究.计算结果表明,用两种方法建立的两种构象的构效关系模型均有较好的预测能力.通过分析CoMFA和CoMSIA的系数等势图,直观地了解二氢吡啶衍生物的结构对生物活性的影响,为进一步设计高活性的二氢吡啶衍生物提供一定的理论依据.
- 丁俊杰丁晓琴赵立峰陈冀胜
- 关键词：三维定量构效关系钙离子通道心血管疾病
- 磷酸酯类胆碱酯酶不可逆抑制的反应性指数理论计算
- 丁晓琴李大禹丁俊杰裴承新陈冀胜
- 基于概念密度泛函理论磷酸酯类反应性物质毒性预测被引量：3
- 2018年
- 磷酸酯类反应性物质是乙酰胆碱酯酶不可逆抑制剂。本文应用概念密度泛函理论(CDFT),采用四组条件(B3LYP/6-311++G(2d,3p)/gas,B3LYP/6-311++G(2d,3p)/CPCM/water,MP2/6-311++G(2d,3p)/gas,MP2/6-311++G(2d,3p)/CPCM/water),对20多个磷酸酯反应性物质进行反应性描述指数计算,包括分子的化学势μ,绝对硬度η、亲电性指数ω、分子的前线轨道能量等分子整体描述参数,以及原子福井函数、自然键轨道(NBO)电荷、Wiberg键级、NBO键级等分子局域描述参数。通过对反应性描述指数以及定量构性关系(QSPR)方程预测结果的比较分析,得出结论:大多数化合物亲电进攻的反应中心发生在磷原子上;磷酸酯类化合物侧链乙胺基叔氮的质子化,将显著增强反应中心磷原子的亲电进攻能力;B3LYP/6-311++G(2d,3p)/gas为最合理的计算条件;应用反应性描述指数建立的QSPR模型明显优于常规的2D-QSPR模型,能够用于乙酰胆碱酯酶不可逆抑制剂的精确毒性预测。
- 丁晓琴丁俊杰李大禹潘里裴承新
- 关键词：定量构性关系
- 蓖麻毒素与单链抗体分子识别理论研究
- 毒素的单链抗体免疫检测是一种高效且安全的检测方法。我们应用分子模拟技术，采用同源模建及分子动力学方法，构建并优化实验获得的新型蓖麻毒素单链抗体Scfv-16三维结构，结合Profile-3D和拉氏图方法，评价单链抗体三维...
- 丁俊杰高川丁晓琴李大禹潘里童朝阳
- 关键词：蓖麻毒素单链抗体分子识别分子模拟
- 短裸甲藻毒素(Brevetoxins)的电子结构与构效关系研究被引量：8
- 2000年
- 对短裸甲藻毒素衍生物进行了电子结构研究和构象分析,确定了它们的活性部位,探讨了作用方式,讨论了它们的结构-活性关系及与受体的相互作用,解释了衍生物之间活性差异的原因.研究结果表明,分子骨架中段环上的烯键,A环及R烯键对活性有重要影响,分子骨架的折曲程度对活性也有较大影响.
- 陈常英冯珊丁晓琴
- 关键词：电子结构空间结构构效关系
- 有机化合物或药物热分解稳定性理论预测
- 有机化合物的热分解稳定性与化合物或药物的储存期密切相关,通常分子的稳定性由热分析方法(TG,DTG,TGA,DSC等)实验测定。由于计算机技术和理论有机化学的发展,越来越多的化学工作者,利用量子理论计算或理论与实验相结合...
- 丁晓琴丁俊杰李大禹孙杨陈冀胜
- 关键词：QSPR
