万平
- 作品数：2 被引量：12H指数：1
- 供职机构：军事医学科学院放射与辐射医学研究所更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 22周孕龄胎肝蛋白质相互作用网络的构建
- 目的:建立在胎肝中存在的蛋白质相互作用的网络以及其中与造血的相互作用和通路。方法:利用多个蛋白质数据库以及邻域基因法、基因融合法、种系发生谱法等三种生物信息学方法,相互补充,相互验证。结果:从数据库中得到508个胎肝蛋白...
- 程钢吴松锋陈廷贵万平朱云平贺福初
- 文献传递
- SARS-CoV及其他冠状病毒基因组比较分析被引量：12
- 2003年
- 对病毒种内和种间基因组的比较分析能获得很多关于病毒起源与演化的信息。对17株SARS-CoV的种内基因组变异分析发现共有137个变异位点,估算出SARS-CoV的突变率为8.04×10^(-3)核苷酸替换/位点/年。变异位点在基因组上的分布不均匀,变异位点最多的是基因组中编码S1蛋白的区域,而在编码依赖于RNA的RNA聚合酶区域中几乎没有变异位点。核苷酸和氨基酸替换的偏性预示变异可能不仅仅是由随机漂变产生。对冠状病毒种间基因组结构比较分析发现,SARS-CoV的基因组结构与IBV很相似;而保守基因系统发育分析表明,SARS-CoV属于冠状病毒的一个新分支,并且与血清型第二组冠状病毒进化关系较近。对其他某些分子特征的分析发现,在不同的方面SARS-CoV和不同组冠状病毒有不同的相似点。进一步对基因组非保守开放阅读框(ORF)的基序(motif)和跨膜区分析发现,各组冠状病毒基因组中位于基因S-E间的非保守ORF可能是同源的,但不是绝对必要的;而IBV和SARS-CoV的基因组中位于基因M-N间ORF可能不是同源的。综合分析SARS-CoV与3组血清型冠状病毒进化关系、宿主分布,以及SARS-CoV和IBV的s2m的进化关系,可以推测SARS-CoV有可能来自禽类。
- 吴松锋杜春娟万平陈廷贵荔建琦李栋朱云平曾衍钧贺福初
- 关键词：严重急性呼吸系统综合征SARS冠状病毒多态进化
