刘志昕
- 作品数：240 被引量：774H指数：13
- 供职机构：中国热带农业科学院热带生物技术研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学环境科学与工程医药卫生更多>>
- 基因及其表达调控中遗传密码选择的偏爱性被引量：6
- 2001年
- 遗传密码在基因及其表达调控中具有明显的选择性 .在低等生物及细胞器基因组中 ,同义密码优先选择A、T ;在高等生物的核基因组中 ,同义密码首先考虑C、G ;编码基因的邻近序列对基因转录调控影响很大 .
- 刘柱胡新文刘志昕
- 关键词：基因表达调控遗传密码
- 香蕉条斑病毒ORF Ⅰ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析被引量：1
- 2019年
- 【目的】探明杆状DNA病毒属病毒的ORFⅠ基因功能。【方法】本研究从香蕉条斑病毒云南分离株(BSV-YN)中克隆了BSV ORFⅠ基因,通过核苷酸和氨基酸序列分析和同源关系分析,确定了BSV-YN的分类地位;对其编码蛋白及同源物的理化性质、氨基酸序列组成、亲疏水性、跨膜区域、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点、同源结构域、蛋白二级和三级结构等进行预测和分析。【结果】BSV ORFⅠ基因片段大小为528 bp,编码175个氨基酸,通过核苷酸和氨基酸序列分析和同源关系分析,确定了BSV-YN属于BSGFV种。生物信息学分析表明,BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白都是不稳定的、亲水性蛋白,以丝氨酸和苏氨酸磷酸化为主。这些蛋白二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,无信号肽或跨膜区域。亚细胞定位预测表明,BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白主要在细胞核分布,推测它们在病毒感染的宿主细胞核中发挥重要作用。【结论】推测BSV-YN ORFⅠ在病毒感染的宿主细胞核中参与病毒复制、转录等相关过程。本研究为进一步开展该蛋白的功能研究提供科学线索。
- 黎维丽余乃通李俊成王健华李宾宾刘志昕
- 关键词：同源蛋白生物信息学分析
- 不同培养基对橡胶树红根病菌的生长影响被引量：1
- 2018年
- 将7个橡胶树红根病菌(Ganoderma pseudoferreum)不同株系,分别在玉米培养基(CMA培养基),PDA培养基,PDA + 胡萝卜培养基,1/2(MS + CMA)培养基(玉米和MS培养基二者各一半混合而成的培养基)上培养,结果发现,其中5个菌株在CMA培养基上生长最佳,2个菌株在PDA + 胡萝卜培养基上生长最佳。同时,3个菌株在1/2(MS + CMA)培养基上生长最慢,2个菌株在CMA培养基上生长最慢,2个菌株在PDA+胡萝卜培养基上生长较慢,这说明橡胶树红根病菌营养需求具有差异性,但也有一定的共性,PDA + 胡萝卜培养基可以选为红根病菌生长的较好培养基。本研究结果为筛选合适的红根病菌培养基,探寻病原菌的生理代谢途径及病害防控奠定基础。
- 周慧珍刘志昕秦云霞
- 关键词：培养基营养需求
- 马铃薯Y病毒属病毒通用RT-PCR检测方法的建立及运用
- 章绍延余乃通王健华张雨良刘志昕
- 菠萝凋萎相关病毒-1实时荧光定量RT-PCR检测体系的建立与应用被引量：3
- 2014年
- 菠萝凋萎相关病毒-1(Pineapple mealybug wilt associated virus-1,PMWaV-1)是田间检出率最高的菠萝凋萎病毒。本研究根据PMWaV-1CP基因保守序列设计特异性TaqMan探针和引物,建立并优化了PMWaV-1实时荧光定量RT-PCR检测方法。优化后的反应体系制备的标准曲线为y=-3.307×log x+38.18,相关系数r2为0.998。试验结果表明,该方法能特异性地检测PMWaV-1,对PMWaV-2、3和阴性对照均无反应;最低检测限达到40拷贝。重复性试验表明批内和批间变异系数均小于1.98%,是一种操作简便、特异性强、灵敏度高、重复性较好的PMWaV-1定量检测方法。样品检测结果表明PMWaV-1在菠萝植株老叶、嫩叶和吸芽中的病毒含量呈递减趋势。
- 胡加谊罗志文李向宏范鸿雁周朋章绍延张治礼刘志昕何凡
- 关键词：TAQMAN探针实时荧光定量RT-PCR
- 甘蔗条螟蜕皮调节转录因子cDNA及其克隆方法与重组应用
- 本发明属于生物基因工程领域，甘蔗条螟蜕皮调节转录因子<I>CsHR3</I>具有SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的序列。本发明克隆方法是：从甘蔗条螟预蛹期幼虫中提取总RNA，反转录合成cDNA；根据不同...
- 刘志昕张雨良张树珍王健华熊国如余乃通王俊刚
- 甘蔗黄叶病毒CP蛋白基因ihpRNA表达载体构建及烟草转化
- 为提高甘蔗抗病性,本研究根据甘蔗黄叶病毒海南分离物ScYLV-CHN-HN1全基因组序列(GenBank no.HQ342888),利用病毒CP蛋白介导的RNAi技术,针对病毒外壳蛋白CP,设计两对含有酶切位点的特异性引...
- 张雨良熊国如王健华张树珍官梅花杨文君刘志昕
- 关键词：甘蔗外壳蛋白烟草转化
- 文献传递
- 诺丽花叶病及其病原鉴定
- 2020年
- 主要介绍了近年来诺丽植株严重花叶病的发病特征、病毒病原鉴定方法、昆虫传播媒介,并提出相应的防控建议与措施,为有关政府部门和种植户提供重要科学信息。
- 余乃通杨焱蔡志英刘志昕
- 关键词：病原症状
- 寄生椰心叶甲绿僵菌的培养特性及ITS序列鉴定被引量：3
- 2010年
- 测定了8株分离于自然罹病死亡的椰心叶甲虫体绿僵菌的培养特性并采用其ITS序列进行系统发育分析,结果表明:绿僵菌在以玉米粉作碳源,牛肉膏、蛋白胨作氮源的条件下菌丝的生长速率最快,产孢量最高;绿僵菌对温度和pH的适应范围较广,最适宜的生长温度是26～28℃,pH为6～7时,菌丝生长最快,孢子量最多,绿僵菌的致死温度为55℃.基于8个菌株rDNA的ITS1-5.8S-ITS2区域序列的系统研究结果表明,8个菌株均聚在金龟子绿僵菌小孢变种(Metarhiziumanisopliae var.anisopliae)构成的分支中,明显可分成两群,HY-4、YP-6、SX-2、QH-4为一群,与标准菌株FI1091-AF135214接近,另一群为HK-5、SY-2、SS-2、WC-1,与标准菌株Mb5-EF113340接近.
- 谭志琼张雯龙宋根苗张荣意刘志昕
- 关键词：绿僵菌ITS进化树
- 利用CRISPR/Cas9系统编辑拟南芥2个双链结合蛋白
- 2018年
- CRSPR/Cas9系统可对植物的内源基因进行有效定点编辑,为获得基因缺失突变体提供了新的方向。本研究在双链结合蛋白(ds RNA-binding protein,DRB)DRB3和DRB5两个基因外显子的保守序列设计2个靶点,并构建与t RNA串联的双靶点CRISPR/Cas9表达载体。通过一次转化,获得了DRB3或DRB5单独被编辑或同时被编辑的拟南芥突变体dcl2drb4转基因T_1代植株,为研究DRB3、DRB5是否参与DCL4介导的抗病毒RNA沉默通路奠定基础。
- 吴坤鑫武亚丹张春微刘志昕王健华余乃通张秀春
- 关键词：拟南芥
