匡斌
- 作品数：5 被引量：11H指数：2
- 供职机构：电子科技大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金四川省应用基础研究计划项目四川省学术和技术带头人培养资金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 基于吉布斯采样算法的模体查找新斱法的研究
- 基因转录是遗传信息传递和表达的枢纽，是基因表达调控机制发挥作用的重要环节。转录过程的开启与否首先受到启动子、顺式调控元件、RNA聚合酶和相应转录因子特异性作用的控制，因此识别调控元件是理解基因转录调控机制和表达模式的的关...
- 匡斌
- 关键词：基因转录
- 文献传递
- 分块PCA提取细胞周期调控基因的研究被引量：3
- 2008年
- 用主成分分析(PCA)方法处理基因表达微阵列数据能够实现基因选择、基因表达模式提取、基因分类等,有其独特的优点。然而,PCA方法却存在容易丢失重要信息的弱点。为了克服这一方法的弱点,提出分块PCA,并以此为基础形成一种提取细胞周期调控基因的新方法。通过理论分析和对酵母微阵列数据的仿真实验研究,表明这种方法可行、有效,能够全面地提取出隐含在方差较小变量中的细胞周期调控基因,并能够给予实验结果较好的生物意义解释,在微阵列数据处理中具有应用前景。
- 饶妮妮匡斌王成雄任正隆陈曦
- 关键词：分块PCA微阵列数据细胞周期调控基因
- 基于吉布斯采样算法的模体查找新方法的研究
- 基因转录是遗传信息传递和表达的枢纽,是基因表达调控机制发挥作用的重要环节。转录过程的开启与否首先受到启动子、顺式调控元件、RNA聚合酶和相应转录因子特异性作用的控制,因此识别调控元件是理解基因转录调控机制和表达模式的的关...
- 匡斌
- 关键词：马尔科夫链
- 文献传递
- 基于小波变换技术预测DNA序列的编码区被引量：7
- 2007年
- 三周期性是大多数基因组序列的编码区具有的主要特征.本文提出利用小波变换分析DNA序列编码区的三周期性,形成一种新的基于小波变换的DNA序列编码区预测方法,理论和实验研究证实了新方法的可行性,探测率和正确率分别达到81%和75%,特别是探测率较目前常用的其它一些方法有较大改善.
- 王玉饶妮妮匡斌袁祚涌
- 关键词：DNA序列编码区小波变换
- 一种用于模体预测的改进吉布斯采样算法
- 2008年
- 当前有许多用于预测模体的算法,但没有一种算法能有效地应用在所有场合。依据位置权重矩阵的模体模型,提出一种改进的吉布斯采样算法来识别模体。该算法有效地克服了吉布斯采样算法的局部收敛性,并且可以直观地控制预测模体的保守度。同时引入了模体库的概念,并通过分析模体库数据,提高了模体预测的灵活性和准确率。设计了仿真数据,并选择了已被生物实验验证过的模体数据,证实本算法的可行性和有效性。与当前常用的基于吉布斯采样改进的算法比较,本算法有效地提高了模体预测的准确性、灵活性和稳定性。
- 匡斌饶妮妮韩凤君徐尚蕾
- 关键词：位置权重矩阵
