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吕巧明

作品数：1 被引量：5H指数：1
供职机构：浙江大学化学系更多>>
发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域：理学更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇理学

主题

  • 1篇动力学
  • 1篇动力学模拟
  • 1篇分子
  • 1篇分子动力学
  • 1篇分子动力学模...
  • 1篇并行计算

机构

  • 1篇南京大学
  • 1篇浙江大学

作者

  • 1篇张秉坚
  • 1篇吕巧明
  • 1篇胡文暄
  • 1篇秦星

传媒

  • 1篇计算机与应用...

年份

  • 1篇2005
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
微孔隙中流体扩散系数分子动力学模拟的并行算法研究被引量：5
2005年
扩散系数计算量非常大,为提高计算效率研究采用并行计算替代单机计算:用非阻塞通信替代阻塞通信;利用元胞分解的成果创建要拷贝的外层粒子列表;用拷贝粒子和移动粒子的重叠部分来减少通信量,在空间分解(SD)算法的基础上对MD模拟的并行算法进行了改进,使并行计算的效率提高了28.64%。用改进的SD并行计算方法,以RedHat Linux 8.0位操作系统和基于Message Passing Interface(MPI)消息传递界面的四节点计算机集群系统(PC Cluster)。对水分子在宏量条件下以及受限于硅酸岩狭缝中的速度自相关函数进行了MD模拟计算。结果表明,并行算法可以使速度自相关函数及相应的自扩散系数的MD模拟时间大为缩短。
秦星张秉坚吕巧明胡文暄
关键词：并行计算分子动力学模拟
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