吴初新
- 作品数：26 被引量：21H指数：3
- 供职机构：南昌师范高等专科学校更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江西省重点科技攻关项目江西省研究生创新基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生理学更多>>
- 鱼类eIF2α激酶PKR和PKZ研究进展被引量：1
- 2015年
- PKR和PKZ是eIF2α激酶家族中2个重要的成员。由于其特殊的进化地位,鱼类具有一些自身特有的免疫因子和免疫机制。研究发现,斑马鱼、鲫鱼和草鱼的基因组中同时存在PKR和PKZ,其结构与功能既相似又不同。在细胞中,PKR是一种ds RNA受体,PKZ为一个Z-DNA/Z-RNA识别受体,它们都可能对病毒侵染产生应答。在病毒侵入鱼类细胞时,PKR和PKZ有功能的重叠,但也有作用机制的分化。
- 吴初新胡成钰
- 关键词：PKR干扰素抗病毒作用鱼类
- 鲫鱼PKZ Zα结构域与d(GC)、d(TA)重组质粒的结合被引量：1
- 2009年
- Zα是能够特异性识别并结合左旋DNA(Z-DNA)的蛋白结构域,首先在人ADAR1中鉴定,随后又在ZBP-1(DLM-1)和E3L等蛋白质中发现了该结构域.鲫鱼PKZ是首次报道的具有Zα结构域的鱼类eIF2α激酶.为深入了解鲫鱼PKZZα的功能,原核表达并亲和层析纯化了3种多肽,即野生型PZα(Zα1Zα2)、替换型P(Zα1)2(Zα1Zα1)和点突变型(PZαK34A、PZαS35A、PZαR39A、PZαP57A).同时,构建了含有d(GC)6、d(GC)13、d(TA)13特殊插入序列的3种重组质粒,用于体外模拟Z-DNA.凝胶阻滞实验分析了3种多肽分别与重组质粒的亲和性.结果表明,PZα和P(Zα1)2能够与d(GC)重组质粒结合,并且随着多肽含量的增加,阻滞效应越明显.与野生型PZα相比,替换型P(Zα1)2结合d(GC)重组质粒的能力更强.PZα和P(Zα1)2还能微弱地与d(TA)13重组质粒结合.点突变型多肽都不能与重组质粒结合,暗示鲫鱼PKZZα结构域中这4个氨基酸残基在结合核酸分子的过程中非常关键.该文结果有利于进一步揭示鱼类PKZZα结构域与Z-DNA结合的分子机理.
- 杨攀吴初新李琴夏玉洁胡成钰
- 关键词：鲫鱼重组质粒
- 草鱼Wap65基因的克隆和鉴定被引量：1
- 2011年
- 经Poly I∶C诱导的草鱼肝肾cDNA文库中筛选并克隆了一个Wap65(HM629798)。草鱼Wap65全长cDNA为1510 bp,包括5’非编码区55 bp,3’非翻译区327 bp,最大开放阅读框为1128bp。草鱼Wap65是一个376 aa的蛋白质,其中,第56～95 aa、102～153 aa、155～199 aa、200～243 aa、262～305 aa和307～352 aa为重复血红素结合域。进化树显示,草鱼Wap65与斑点叉尾鱼回Wap65-2进化关系最近。定量PCR研究草鱼Wap65的表达特征,Wap65在肝中有较强的本底表达,而在脾、肾、脑和肠等组织中该基因表达非常微弱。34℃热激2 h后,在脾脏中,Wap65的表达量有一定的上调;在肝脏中的该基因的相对表达量大量增加,而在其他受检组织中Wap65的表达无明显变化。因此,草鱼Wap65主要在肝脏中表达。以上结果表明,本研究克隆的草鱼Wap65可能是Wap65-2。
- 赵风云吴初新朱玉娇胡成钰
- 关键词：应激蛋白草鱼
- 鲫鱼PKZ Zα结构域翻转发夹d(GC)nT4(GC)n构象分析
- 鲫鱼PKZ是最早报道的鱼类PKZ,为eIF2α激酶家族新成员,其N-端为Z-DNA结合域(Zα),C-端具有eIF2α激酶催化结构域。鲫鱼PKZ Zα与负超螺旋下的d(GC)n具有很高的亲和性。为进一步研究鲫鱼PKZ Z...
- 卢普忠吴初新闫永彬朱友林胡成钰
- 关键词：Z-DNA圆二色光谱硬骨鱼
- 鲫鱼PKR-like Zα与d(GC)_(13)质粒的结合及其适应性进化被引量：6
- 2008年
- Zα是一类能特异性识别与结合左旋DNA(Z-DNA)的蛋白质结构域,分布于不同物种的多种蛋白质中,其结构保守并分化自一个共同的祖先Z-结构域。适应性进化分析显示Zα没有经历正达尔文选择,表明与其结构对应Zα的功能相当保守。凝胶阻滞试验表明原核表达的鲫鱼PKR-like Zα多肽(CaPZα)不与pMD18-T质粒结合,而却能与包含d(GC)13的重组质粒pMD18-T/(GC)13结合。同时,与ADAR1Zα相比,CaPZα与d(GC)13质粒的结合能力较弱,即CaPZα1和CaPZα2子域单独不能结合d(GC)13质粒。这表明Zα功能虽然没有异化,但有很大的不同。实验结果还表明负超螺旋和d(GC)n可能都是正常生理条件下,DNA形成潜在Z-DNA必不可少的因素。定点突变试验证实38N与60W两个氨基酸位点对于CaPZα结合Z-DNA非常关键。
- 陶敏吴初新杨攀胡成钰
- 关键词：适应性进化
- Z-DNA的形成及其与基因转录的关系
- 2013年
- Z-DNA是一种非常独特的DNA二级结构.与B-DNA相比,Z-DNA最显著的结构特征是左手螺旋和磷酸-核糖骨架呈"zigzag"状.虽然目前对Z-DNA功能的了解还不确切,但毫无疑问,Z-DNA与基因的转录和调控密切相关.一方面,在体内Z-DNA在基因转录过程中产生;另一方面,分布于启动子等不同区域的Z-DNA又可以反过来调控基因的转录,即Z-DNA能够增强一些基因转录,也能抑制某些基因的表达,但其调控机制还不清楚.这种调控似乎与Z-DNA在启动子中的位置、基因和细胞类型有关.研究Z-DNA的形成及其与基因转录的关系对理解基因转录调控理论具有十分重要的意义.
- 黄胜和吴初新李东明饶泽昌胡成钰
- 关键词：Z-DNA基因转录启动子基因调控
- 鲫鱼PKR-like Zα结构域与Z-DNA的结合
- Zα是能够识别并特异性结合左旋DNA(Z-DNA)的蛋白结构域。鲫鱼PKR-like是首次报道的具有Zα结构域的鱼类蛋白激酶。为深入了解Zα结构域的生物学功能,本文体外表达了3种多肽,分别为野生P(Zα1Zα2)、替换型...
- 杨攀吴初新赵风云胡成钰
- 文献传递
- 草鱼Annexin A4基因克隆、表达特性及进化被引量：1
- 2009年
- 草鱼(Ctenopharyngodon idellus)Annexin A4基因克隆于肝肾cDNA文库,该cDNA全长为1307bp,其中,5′非编码区为104bp,3′非编码区为237bp,开放阅读框为966bp,编码321个氨基酸。草鱼Annexin A4编码的蛋白质N端由15个氨基酸残基组成,C端具有4个重复序列,每个重复序列都有一个Ⅱ型钙结合位点,在第4个钙结合位点中包含一个"KGD"序列。Annexin A4在草鱼肝、肾、脾、心、鳃、肠中的表达量均较高,而肌肉和脑中不表达;PolyⅠ:C诱导后,其表达均有所下调。系统发育树显示,草鱼Annexin A4与斑马鱼(Danio rerio)的进化距离最近。适应性进化分析没有检测到正选择位点,表明Annexin A4非常保守,受到强烈的功能约束。
- 吴初新马梅生王丽坤胡成钰
- 关键词：适应性进化POLY草鱼
- 痘苗病毒E3L蛋白的结构与功能
- 2013年
- E3L蛋白是痘苗病毒基因组所编码的一种非常重要的毒力蛋白。E3L结构高度保守,其N端为Z-DNA结合域(Zα),C端为双链RNA结合域(dsRBM),两者均为其致病性所必需。E3L具有抵御宿主细胞干扰素及其诱导蛋白的抗病毒作用,以及抑制细胞凋亡、抵抗RNA干扰等多方面的重要功能,这些策略有助于逃避宿主的抗病毒免疫。
- 吴初新胡成钰
- 关键词：痘苗病毒
- 热休克、Poly I:C上调草鱼GRP78基因表达被引量：4
- 2009年
- 葡萄糖调节蛋白78(GRP78)是细胞内一种应急蛋白,它通过对细胞内、外胁迫因子产生强烈的应答而调节内质网稳态.草鱼(Ctenopharyngodon idellus)GRP78克隆于草鱼肝肾cDNA文库,全长2490bp.其中,5'非编码区为155bp,含有7个热休克元件,3'非编码区为373bp,最大开放阅读框为1962bp,编码653个氨基酸.序列分析表明,草鱼GRP78的N端包含3个HSP70家族的签名序列,C末端为内质网蛋白滞留信号KDEL,草鱼GRP78与人及其它动物的同源性很高.适应性进化分析也显示GRP78非常保守,受到强烈的功能约束,说明该蛋白质在进化中非常重要.RT-PCR分析表明,相对于本底水平,34℃热激和Poly I:C诱导后,草鱼GRP78在肝、肾等组织中的表达明显上调.
- 吴初新刘毅马梅生王丽坤胡成钰
- 关键词：热休克POLYGRP78草鱼胁迫
