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吴智明: 作品数：55 被引量：216H指数：9; 供职机构：仲恺农业工程学院园艺园林学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目更多>>; 相关领域：农业科学文化科学生物学轻工技术与工程更多>>

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基于SSR分子标记的‘汇丰2号’辣椒杂交种子纯度和真实性鉴定: 2023年; 【目的】‘汇丰2号’辣椒为杂交一代新品种,具有中早熟、抗病性强、耐储运和品质佳等特性,深受农户和消费者喜爱。为保障种子质量,拟建立一套快速、简便的种子纯度和真实性鉴定方法。【方法】基于辣椒基因组已公开的SSR分子标记资源,以‘汇丰2号’父、母本为材料,筛选多态明显、条带清晰且扩增稳定的SSR标记,对‘汇丰2号’杂交种子进行纯度鉴定,并结合田间形态鉴定验证分子标记鉴定的准确性。此外,利用筛选出的SSR标记对‘粤红1号’、‘汇丰1号’、‘汇丰2号’和‘汇丰5号’4个品种进行真实性鉴定。【结果】筛选出2个SSR标记L0143和L0622,其多态明显,且条带清晰、扩增稳定。其中,标记L0143在母本W2280中PCR扩增条带为149 bp,在父本W2102中的扩增条带为141 bp;标记L0622在母本和父本中的扩增条带分别为208 bp和196 bp。2个标记单独使用时均可以准确鉴定‘汇丰2号’种子纯度,且2个标记同时使用可以将‘粤红1号’、‘汇丰1号’、‘汇丰2号’和‘汇丰5号’4个品种区分开,即可鉴定它们的真实性。【结论】筛选出的SSR分子标记L0143和L0622能够快速、准确、低成本、有效的对‘汇丰2号’杂交种子进行纯度和真实性鉴定,该鉴定方法操作简单,能够替代传统杂交种子纯度和真实性鉴定的方法,具有较高的商业应用前景。; 赵威徐晓美徐小万衡周王恒明陈金金吴智明; 关键词：辣椒种子纯度 SSR分子标记

不同果色辣椒类胡萝卜素累积差异分析被引量：4: 2018年; 为探究辣椒果实类胡萝卜素积累与代谢的分子机制,以RF1601(成熟期红果)和PF1511(成熟期紫果)两个辣椒(Capsicum annuum L.)自交系为材料,分别提取5个发育时期果实的类胡萝卜素,利用高效液相色谱法对叶黄素、辣椒红素和β-类胡萝卜素进行了定性和定量分析,并通过Real-time PCR对7个与类胡萝卜素生物合成相关基因的表达进行了分析.结果表明,随着果实发育成熟,类胡萝卜素总含量逐步增加,到成熟期达到最高值,在RF1601和PF1 511两个材料中分别达到173. 0和37. 9μg/g FW.成熟红果叶黄素含量接近紫果的3倍.青果期的辣椒果实不含有辣椒红素,但随着果实发育,RF1601中辣椒红素呈现逐步增加的趋势,PF1511紫色果实品种中始终检测不到辣椒红素.β-胡萝卜素呈现先逐步下降再上升的趋势.红果自交系RF1601中PSY、PDS、ZDS、LYC等基因在青果期到转色期表达量低,但从转色后期开始,辣椒红素合成酶关键基因CCS开始大量表达;紫果自交系PF1511中基因PSY、PDS、ZDS和LYC在转色前期大量表达,但基因CCS生育期内的表达都不明显.; 陈奕聪杜奋澄许杰纯杨雨欣黎祖瑜吴智明; 关键词：类胡萝卜素基因表达

辣椒EST-SSR标记的开发与应用被引量：7: 2012年; 通过对数据库中32 295条非冗余的辣椒EST序列进行搜索,发现3 396个SSR分布于3 277条EST序列中,EST-SSR频率为10.52%,平均分布距离为4.46 kb.在辣椒EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占总SSR的43.02%和37.84%.优势重复基元为GA/TC、AG/CT和AT,分别占15.99%、11.98%和11.37%.用Primer Premier 5.0软件设计了420对引物,对辣椒抗疫病自交系‘B072’和感疫病自交系‘B088’进行PCR扩增,403对引物有扩增产物,引物有效扩增率为95.96%,其中76对引物有多态性,多态性引物占可扩增引物的18.86%.试验证明,利用辣椒EST序列开发SSR标记是可行的.; 吴智明刘伟强唐鑫崔竣杰程蛟文胡开林; 关键词：辣椒 EST-SSR

园艺作物香气成分及合成调控机理的研究进展: 2023年; 园艺作物的香气由其细胞中的挥发性有机物(Volatile organic compounds,VOCs)产生,主要由酯类、醇类、醛类、酮类、醚类、萜类、烷烃等物质组成,是其重要品质指标。园艺作物主要分为果树、蔬菜、花卉、茶4大类。不同类型园艺作物的VOCs种类各不相同,是造成园艺产品风味多样性的重要因素。影响园艺作物VOCs的因素主要有基因表达、栽培条件、采后处理等。不同的基因的表达是不同园艺作物之间VOCs差异的重要原因;光照强弱、栽培环境、肥料施用以及嫁接砧木的品种等栽培条件直接或间接影响园艺作物VOCs的合成;采后处理中储藏温度和乙烯含量是影响园艺作物VOCs的重要因素。植物中VOCs合成途径主要有脂肪酸途径、氨基酸途径、莽草酸/苯丙素途径、萜类途径、脂氧合酶(LOX)途径等。直链醛、醇、酯主要通过脂氧合酶途径以及β-氧化途径产生,支链醛、醇、酯由氨基酸途径产生,萜类化合物由萜类途径产生,多酚类化合物由莽草酸/苯丙素途径产生。本文综述了近年来园艺作物香气物质成分、影响香气挥发的因素以及挥发性香气化合物的生物合成调控,提出了当前园艺作物香气的相关酶的生理功能、香气的遗传控制及其影响因素、香气物质与代谢机制研究较少的问题,并对未来的研究方向进行了展望。; 叶楚谢炳春李涛徐小万徐晓美王恒明吴智明衡周; 关键词：园艺作物挥发性有机物香气成分生物合成途径

夏季高温对15个苦瓜杂交组合(品系)产量及其构成性状的影响被引量：8: 2011年; 为了研究夏季高温对苦瓜的影响,以苦瓜15个杂交组合(品系)为材料,在夏季自然高温条件下栽培,并以秋季栽培为对照,对各杂交组合(品系)的产量、商品果数、商品率、平均单果质量及各指标的变化率进行统计分析。结果显示,夏季高温导致所有苦瓜杂交组合(品系)的小区产量、商品率均明显降低,商品果数明显减少;除了杂交组合29×62、9808×68、62×68和品系47外,其余杂交组合的平均单果质量均低于秋季,从而导致苦瓜减产。此结果表明产量、商品果数和平均单果质量的变化率可能可作为苦瓜成株期耐热与否的鉴定指标,但还需结合田间生长势、绝对产量和品质性状等因素进行综合评价。; 曾晶翟英芬吴智明胡开林; 关键词：苦瓜商品率

国外引进辣椒DNA表观遗传多样性分析被引量：1: 2021年; 从63对MSAP引物中筛选出9对重复性较好和条带清晰的引物,对30份国外引进的辣椒(Capsicum spp.)资源基因组DNA进行MSAP扩增。DNA甲基化模式分析表明,30份辣椒材料甲基化模式主要以全甲基化为主;但是MSP(Methylation-sensitive polymorphisms)聚类和MISP(Methylation-insensitive polymorphisms)聚类均比较离散,相关材料主坐标分析与其聚类分析结果基本一致,DNA甲基化研究并没有将一年生辣椒聚为1个类群。辣椒表观遗传变异相对于基因组遗传变异更为丰富。; 徐小万夏碧波吴智明田永红

葫芦科作物抗氧化基因的全基因组鉴定及分析被引量：1: 2023年; 抗氧化(oxidation resistance, OXR)基因是含有TLDc结构域的一类基因,能有效清除活性氧,在抗氧化过程中发挥着重要作用。基于葫芦科基因组数据库,从6个葫芦科作物中共鉴定出37个OXR成员,其中冬瓜、西瓜、甜瓜、葫芦和黄瓜均有6个成员,南瓜有7个成员。通过系统发育以及保守结构域分析,将这些OXR成员分为5个亚族:OXR1、OXR2、OXR3、OXR4和OXR5。OXR基因在染色体上呈不均匀分布,同一亚族OXR成员所编码的氨基酸数、分子量、外显子数、内含子数以及保守基序的排列模式都极为相似,表明OXR基因具有高度保守性。顺式作用元件分析结果显示,OXR基因的启动子区域含有多种顺式作用元件以及MYB转录因子的结合位点。基因复制分析发现,葫芦科OXR2成员通过片段复制或全基因组复制发生了一定扩张,这些复制基因对均受到纯化选择。共线性分析结果显示,在亲缘关系较近的葫芦科作物之间,OXR基因所在的共线性区块较大。不同组织的表达谱分析结果显示,葫芦科OXR4成员有相似的表达模式,在叶片中表达量均较高;OXR2亚族内复制基因出现了非对称表达的现象。; 钱玉磊闫晋强刘文睿吴智明谢大森江彪; 关键词：葫芦科保守结构域顺式作用元件表达谱亲缘关系

马铃薯基因组中Dof转录因子家族的鉴定与表达特征分析被引量：10: 2015年; Dof（DNA-binding with one zinc finger）锌指蛋白是植物特有的一类转录因子,在多种代谢途径中发挥着重要作用。为全面了解Dof基因在马铃薯基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了马铃薯Dof基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域进行了预测,分析了Dof基因在不同组织和系列胁迫下的表达特征。结果表明,马铃薯Dof转录因子家族由35个基因编码43个蛋白质;基因分布于除7号和12号染色体外的其余10条染色体上;STDOF蛋白长度在165～503个氨基酸之间,等电点介于4.72～10.04;系统发生分析表明,STDOF蛋白分为4个亚族;转录组数据分析显示,St Dof基因的表达具有组织特异性,在不同胁迫条件下,多数St Dof基因的表达也呈现有不同程度的差异。本研究为深入探讨St Dof基因的功能及在马铃薯的遗传改良中的应用奠定了基础。; 吴智明张圣旭梁关生; 关键词：马铃薯生物信息学基因表达

基于表型和SRAP标记的盆栽菊遗传多样性分析被引量：5: 2020年; 基于20个表型性状和相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记技术对30个国外引进盆栽菊品种遗传多样性进行研究。结果表明,参试盆栽菊品种表型变异丰富,性状变异系数为14.67%~78.25%,最低和最高变异系数分别为冠幅和舌状小花数。性状主成分分析结果显示,前5个主成分贡献率达76.68%,综合反映了花型大小、叶片形态和花色的重要性。基于表型性状的聚类分析可将30个盆栽菊品种划为3个类群:第Ⅰ类群包含14个品种;第Ⅱ类群包含2个品种;第Ⅲ类群包含14个品种。表型性状的聚类结果与花径和观花期有一定联系。SRAP分析筛选到11对多态性引物,获得1866个多态性位点,多态性比例为92.61%。品种间的遗传相似系数为0.67~0.85,表明30个品种存在一定的遗传变异。基于品种间遗传距离构建的NJ(neighbor joining)进化树结果显示,30个盆栽菊品种可划分为3个类群:第Ⅰ类群包含2个亚群,共17个品种;第Ⅱ类群包含10个品种;第Ⅲ类群包含3个品种。2种分类方法均将研究对象分为3个类群,但这3个类群的品种组成并不一致,推测可能和菊花材料本身复杂的遗传背景与试验选材的局限性有关。; 沈瑶王晗璇侯海娴吴智明周厚高; 关键词：盆栽菊花表型 SRAP标记聚类分析

用AFLP技术分离辣椒mtDNA中与雄性不育相关的基因片段被引量：5: 2010年; 采用AFLP技术对辣椒胞质雄性不育系‘北A’、相应保持系‘北B’及其杂种F1的m tDNA进行了比较分析,获得了9条差异谱带,对全部差异谱带进行了克隆测序和同源性比对分析。结果表明,部分序列同烟草NADH脱氢酶亚基1和核糖体蛋白L2基因、矮牵牛线粒体嵌合基因nad4L-orf25等核苷酸序列存在90%以上的相似性。推断这些差异片段可能与辣椒细胞质雄性不育相关。; 吴智明胡开林陈晓莹乔爱民; 关键词：辣椒细胞质雄性不育 AFLP

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