唐莹
- 作品数：16 被引量：49H指数：5
- 供职机构：扬州大学动物科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家肉鸡产业技术体系建设专项江苏省高校自然科学研究项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 京海黄鸡肌细胞生成素基因的克隆和生物信息学分析
- 2014年
- 本试验根据GenBank中公布的原鸡肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因序列设计1对引物,采用RT-PCR方法,从京海黄鸡肌肉组织中克隆MyoG基因的编码区序列,并使用多种生物软件和在线工具对目的序列进行生物信息学分析,分析MyoG基因与其他物种的同源性、蛋白质的理化性质、蛋白质序列的跨膜区、亚细胞定位、亲水性、潜在的磷酸化位点、保守结构域及该基因编码蛋白的二级结构和三级结构。最终获得了包括编码区在内的长754bp的MyoG基因序列,生物信息学分析显示,京海黄鸡MyoG基因的保守性较低,与GenBank中原鸡、火鸡、鹌鹑、马、人、野猪、牛、山羊、大鼠、绵羊的同源性分别为99.7%、94.4%、92.0%、70.0%、70.0%、73.3%、69.0%、67.9%、67.8%、73.5%;氨基酸分析发现,MyoG蛋白为水溶性蛋白,分子质量为25854u,理论等电点为5.46,不属于跨膜蛋白;亚细胞定位显示,大部分蛋白位于细胞质内,不属于分泌蛋白;预测含有6个潜在的磷酸化位点,1段碱性序列,1段HLH序列,1段低复杂度序列;二级结构以无规则卷曲为主,三级结构显示MyoG蛋白的结构域呈螺旋状。
- 张涛张跟喜王金玉樊庆灿王文浩魏岳陈学森唐莹王永娟
- 关键词：京海黄鸡肌细胞生成素克隆生物信息学分析
- 边鸡Myf-3基因与生长性状的关联分析
- 2014年
- 本实验采用PCR-SSCP技术检测边鸡生肌决定因子3(Myf-3)的多态性,并分析其对边鸡生长性状的遗传效应。结果表明:在P3位点上发现C576T的突变;在P4位点上发现C1837T和G1846A的突变。P3和P4位点均属于低度多态,其中P3位点处于哈代-温伯格平衡(P>0.05);P4位点偏离了哈代-温伯格平衡(P<0.05)。利用PHASE软件对其进行单倍型分析后结果显示,共产生4种单倍型H1(TCG)、H2(TTA)、H3(CCG)、H4(CTA)。经关联分析发现,单倍型组合H1H1型和H2H2型对所测定的边鸡各周龄体重具有显著或极显著影响。由此推测,边鸡Myf-3基因的多态性对其生长性状有一定影响,但是否可以作为影响边鸡生长性状的遗传标记仍需进一步研究。
- 魏岳张跟喜王金玉樊庆灿唐莹丁馥香张丽
- 关键词：SNPS生长性状边鸡
- MyoG与Myf5基因与京海黄鸡生长性状的相关分析被引量：5
- 2015年
- 以京海黄鸡为材料,采用PCR-SSCP方法检测MyoG和Myf5基因的单核苷酸多态性(SNPs),并分析基因型间的互作以及基因型对生长性状的遗传效应。结果表明,MyoG基因外显子3上存在一个T36C突变,形成了AA、AB和BB 3种基因型;Myf5基因外显子1上存在一个A1313G突变,形成了CC、CD和DD 3种基因型。对生长性状的最小二乘分析结果显示,BB型个体的2~16周龄均显著或极显著的高于AA型个体(P<0.05或P<0.01)。CD型个体仅在初生体质量上显著优于CC型个体。基因互作分析结果显示,互作效应对6、8周龄体质量的影响达到了极显著水平(P<0.01)。本试验为京海黄鸡生长性状的标记辅助选择提供了参考依据。
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- 关键词：京海黄鸡MYOG基因基因互作生长性状
- 10个SNPs与京海黄鸡生长性状的关联性分析
- 2015年
- 为了筛选影响京海黄鸡生长性状的SNP标记，寻找影响生长性状的关键基因，本研究利用定制的SNP芯片，对396只京海黄鸡10个SNPs住点直接进行SNP分型，并与京海黄鸡12个生长性状进行关联分析。结果显示，10个SNPs中，共检测到9个SNPs与京海黄鸡1个或多个生长性状显著相关（P〈0．05），这其中有6个SNPs与2个以上的生长性状显著相关（P〈0．05），另外3个SNPs（rs431883888，rs16432721和rs16434767）分别与8周龄体质量（BW8）、0-4周龄平均日增重以及2周龄体质量（BW2）显著相关（P〈0．05）。此外，rs15618356，rs15618356和rs15620544与很长一段时期内（2-16周龄）的生长性状相关（P〈0．05）。rs431883888，rs16438236，rs16432721和rs16434767对京海黄鸡早期生长性状（2-8周龄体质量）有显著影响（P〈0．05），而rs14489341和rs13939265与京海黄鸡后期生长性状（8-16周龄体质量）显著相关（P〈0.05）。遗传学参数表明需要进一步对京海黄鸡进行选育来增加有利基因型的频率。在显著SNPs位点附近共找到8个可能的候选基因，大部分基因在鸡尚属首次报道，其功能尚需进一步研究。本研究验证了之前鸡生长性状的GwAS结果，为京海黄鸡乃至地方鸡种的分子标记辅助选择奠定了基础。
- 张涛樊庆灿张向前张跟喜王金玉唐莹薛倩王永娟
- 关键词：京海黄鸡生长性状
- 肌细胞生成素基因多态性对京海黄鸡繁殖性状的遗传效应研究被引量：1
- 2014年
- 本研究旨在探讨肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因多态性与鸡繁殖性状间的相关性。以378只京海黄鸡为研究对象,采用PCR-SSCP技术研究MyoG基因外显子的多态性。运用最小二乘法分析这些突变位点形成的基因型与京海黄鸡繁殖性状间的相关性。结果表明,MyoG基因外显子1上存在1个G102A突变,外显子3上存在1个T36C突变,分别形成基因型AA、AB、BB和CC、CD、DD。关联分析结果显示,基因型AA、AB和BB在京海黄鸡繁殖性状上无显著差异(P>0.05);基因型CC和DD在京海黄鸡开产体重上存在显著差异(P<0.05),在其余性状上各基因型差异均不显著(P>0.05)。因此,推测MyoG基因对京海黄鸡的繁殖性状无显著影响,为探索鸡育种过程中的标记辅助选择提供参考资料。
- 唐莹王金玉张跟喜葛莹薛倩王亚男王永娟
- 关键词：肌细胞生成素基因多态性京海黄鸡繁殖性状
- 京海黄鸡甲状腺激素应答蛋白Spot14α基因外显子1多态性与屠体和腹脂性状的相关性分析被引量：1
- 2014年
- 本研究旨在寻找甲状腺激素应答蛋白Spot14α(thyroid hormone responsive Spot14α,THRSPα)基因的多态位点,并分析其对京海黄鸡屠体和腹脂性状产生的影响。针对THRSPα基因外显子区,利用PCR-SSCP结合测序技术对379只140日龄京海黄鸡进行SNP检测,结果发现,该基因第1外显子区存在9bp插入缺失多态位点,形成3种基因型:AA、AB和BB,2种等位基因:A、B,基因频率分别为0.4485、0.5515。相关分析结果表明,该位点对京海黄鸡140日龄活重、屠体性状(包括屠体重、头重、脚重、翅重、胸肌重、腿肌重、全净膛重、半净膛重)和腹脂性状均没有显著影响(P>0.05)。因此推断该多态位点在京海黄鸡分子辅助标记育种中不能作为屠体和腹脂性状筛选的候选分子辅助标记。
- 薛倩王金玉张跟喜王亚男唐莹魏岳施会强
- 关键词：外显子多态性京海黄鸡
- Na+/H+交换泵基因在京海黄鸡各个组织的表达
- 陈学森王金玉张跟喜张涛唐莹施会强
- 关键词：京海黄鸡荧光定量
- 京海黄鸡促性腺激素释放激素1基因克隆与原核表达研究
- 2014年
- 本试验根据GenBank公布的原鸡（Gallusgallus）促性腺激素释放激素1（gonadotropinreleasinghormone1，GnRH1）基因mRNA序列设计1对引物，采用RT—PCR方法，从京海黄鸡下丘脑组织克隆GnRHl基因编码区序列，对其进行生物信息学分析，并构建原核表达载体pET32a—GnRH1，在大肠杆菌BL21感受态细胞中表达。最终获得了包括编码区、大部分启动子区和部分3’区域在内的长度为352bp京海黄鸡GnRH1基因序列，该核酸序列与火鸡、鸽子、人、牛、野猪、山羊、绵羊、藏羚羊、马和大鼠的GnRH1基因序列同源性分别为93％、81％、54％、58％、61％、76％、76％、59％、76％和66％。酶切测序鉴定结果显示，成功构建了原核表达载体pET32aGnRH1；SDS-PAGE检测结果显示，构建的重组质粒在大肠杆菌BL21感受态细胞中成功表达，分子质量为25～28ku，且上清表达量高于沉淀；Westernblotting检测结果显示，在大肠杆菌BL21感受态细胞中表达的蛋白为目的蛋白，且主要为可溶性表达。结果表明，成功克隆了京海黄鸡GnRH1基因，构建了GnRH1原核表达体系，并成功表达目的蛋白，为后续相关研究打下了基础。
- 张涛王金玉张跟喜王文浩魏岳陈学森唐莹王永娟
- 关键词：京海黄鸡克隆原核表达
- 边鸡MyoG基因与生长和屠体性状的关联分析被引量：5
- 2014年
- 本实验将肌细胞生成素(MyoG)基因作为研究边鸡生长和屠体性状的候选基因,采用PCR-SSCP技术对边鸡的MyoG基因进行SNPs检测,并利用荧光定量PCR技术探讨MyoG基因的多态性与边鸡生长和屠体性状之间的关系。结果表明:在MyoG基因上发现2处同义突变,MyoG基因多态位点对边鸡生长和屠体性状有显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01);MyoG基因在胸肌中的表达量极显著高于腿肌中的表达量(P<0.01)。由此推测,边鸡MyoG基因的多态性对其生长和屠体性状有一定影响,对肌纤维的生长发育存在调控机制,但是否可以作为影响边鸡生产性状的遗传标记需进一步研究。
- 魏岳张跟喜王金玉张涛唐莹樊庆灿薛倩王亚男丁馥香张丽
- 关键词：MYOG基因SNPS生长性状屠体性状实时荧光定量PCR边鸡
- 运用四种线性模型对京海黄鸡上市体重进行全基因组关联分析被引量：3
- 2014年
- 旨在使用4种模型对京海黄鸡的16周龄体重进行全基因组关联分析(GWAS)。试验以京海黄鸡母鸡为试验材料,通过60KSNP芯片分型,并使用2种线性回归模型和广义线性模型(GLM)、混合线性模型(MLM)4种模型对基因型数据和京海黄鸡16周龄体重进行关联分析。结果表明,虽然4种模型识别出的显著SNPs(P<0.05)数目不同,但各有优缺点。此外,本研究共识别20个与京海黄鸡上市体重关联显著的SNPs(P<0.05)。这些SNPs主要分布于1、4、19、25和Z染色体上,其中,1号染色体50.6~53.6Mb和Z染色体33.6~44.8Mb区域是显著SNPs(P<0.05)分布较为集中的区域。另外还有部分显著SNPs(P<0.05)位于之前报道的影响鸡生长性状的QTL内。最后,本研究还找到了17个候选基因,同时还探讨了FAM184B、NCAPG和NLK的功能,所有的这些结果将促进鸡生长性状标记的研究。
- 樊庆灿王金玉张跟喜唐莹张涛顾玉萍施会强
- 关键词：京海黄鸡GWASGLM
