- 白纹佛蝗和暗褐蝈螽线粒体基因组序列测定与分析
- 线粒体基因组是研究基因组结构、功能和进化的最佳模型。通常,后生动物的线粒体基因组大小在14-20kb,其编码的基因包括22个tRNA、2个rRNA、13个蛋白质基因以及一个AT丰富区。自1981年人类mtDNA测序完成以...
- 师红雯
- 关键词：线粒体基因组直翅目系统发育比较基因组学
- 文献传递
- 白纹佛蝗和暗褐蝈螽全线粒体基因组序列测定与分析
- 师红雯
- 关键词：线粒体基因组直翅目系统发育比较基因组学
- 白纹佛蝗线粒体全基因组序列(英文)被引量：8
- 2008年
- 通过长PCR扩增线粒体全基因组进行保守引物步移法结合克隆测序技术,对白纹佛蝗mtDNA全序列进行了测定和分析.结果表明：白纹佛蝗线粒体基因组全长15 657 bp,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因以及1个非编码的控制区域,它们的长度分别是11 202 bp,1 486 bp,2 156 bp和728 bp.37个基因的位置与飞蝗的一致,有9对基因间存在41 bp重叠,重叠碱基数在1 ～8 bp之间;基因间隔序列共计21处126 bp,间隔长度从1 ～20 bp不等,最大的基因间隔是20 bp,是在tRNALys和ATP8基因之间.还对lrRNA和srRNA二级结构进行了预测,同时也对tRNA反密码子臂的碱基对类型以及不同链上蛋白编码基因的A/T,C/G组成偏向性进行了详细的讨论.
- 师红雯丁方美黄原
- 关键词：线粒体基因组TRNA基因
- 短额负蝗线粒体基因组及其lrRNA和srRNA二级结构分析被引量：9
- 2007年
- 采用长距PCR扩增及保守引物步移法测定并注释了短额负蝗的线粒体基因组全序列。结果表明,短额负蝗的线粒体基因组全长15558bp,A+T含量为74.3%,37个基因位置与飞蝗的一致,基因间隔序列共计11处64bp,间隔长度从1～16bp不等;有15对基因间存在51bp重叠,重叠碱基数在1～8bp之间。13个蛋白质编码基因中找到6种可能的起始密码子,有12个基因在基因3'端能找到完全的TAA或TAG终止密码子,只有ND5基因终止密码子为不完整的TA。除tRNASer(AGN)外,其余21个tRNA基因的二级结构均属典型的三叶草结构。tRNASer(AGN)的DHU臂缺失,在相应的位置上只形成一个环。预测的lrRNA二级结构总共有6个结构域(结构域Ⅲ缺失),49个茎环结构。预测的srRNA的二级结构包含3个结构域,33个茎环结构。A+T丰富区中存在一个被认为与复制及转录起始有关的Ploy(T)(T-stretch)结构。
- 丁方美师红雯黄原
- 关键词：线粒体基因组短额负蝗锥头蝗科直翅目
- 基因产物功能分类系统被引量：7
- 2006年
- 介绍了4个目前常见的基因产物功能分类体系,第一代功能分类体系GenProtEC、MIPS和KEGG大都是在MonicaRiley提出的分类系统的基础上形成的。而正在发展的GeneOntology(GO)是第二代功能分类体系,它涵盖了更多生物体基因产物的功能。该文通过对这几个分类系统的比较,阐明各自的特点,说明其存在的问题。
- 师红雯黄原
- 关键词：基因产物基因组注释
