文艳苹 作品数:15 被引量:35 H指数:4 供职机构: 杭州市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 杭州市科技发展计划项目 浙江省医药卫生科学研究基金 浙江省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 建筑科学 更多>>
2018年杭州市登革热流行病学及病原特征研究 被引量:4 2021年 目的了解2018年杭州市登革热疫情的流行病学及病原特征。方法应用RT-PCR方法检测血清标本中的登革病毒核酸及其型别,并对阳性标本进行病毒分离、E基因扩增、序列测定及进化分析;描述病例的时间、人群和地区分布特征。结果2018年杭州市共检测登革热病例80例,其中输入性病例55例,本地病例25例(DENV-124例,DENV-31例)。本地病例集中在7月下旬—10月上旬,68%的病例年龄在50岁以上。E基因进化分析表明,本地病例余杭分离株、江干-上城分离株、钱塘新区分离株均属DENV-1基因Ⅰ型,分别与2015年印度尼西亚毒株、2017年缅甸毒株、2018年宁波毒株及2018年杭州的泰国输入性病例毒株最接近。另一DENV-3本地毒株为基因Ⅲ型,与2013年新加坡毒株同源性最高,核苷酸序列一致性为99.5%。结论杭州市登革热流行以输入性病例为主。输入病例引起本地暴发的风险较高,疫情呈多点输入引起多点小规模暴发的特点。 文艳苹 汪皓秋 于新芬 张国忠 周银燕 钱昕关键词:登革热 登革病毒 E基因 进化分析 浙江省杭州市结核分枝杆菌氧氟沙星耐药研究 2013年 目的了解杭州市结核分枝杆菌对氧氟沙星的耐药情况及耐药菌株gyrA基因的突变特点。方法收集2010年4月至2012年6月杭州市各结核病定点医院分离培养的临床菌株,进行一线抗结核药物、氧氟沙星和卡那霉素敏感性检测,测定氧氟沙星耐药菌株gyrA基因的喹诺酮类药物耐药决定区(QRDR)序列。结果收集的1242株临床菌株中,67株(5.39%)对氧氟沙星耐药,其中32株(47.76%)对氧氟沙星单耐药,23株为耐多药结核病(MDR-TB)菌株,占MDR-TB菌株的22.77%。选取55株耐药株进行gyrA序列分析,其中33株(60%)携带gyrA基因突变位点。突变位点包括第90和94位密码子,突变率分别为27.27%和32.73%。结论杭州市氧氟沙星单耐药患者的比例较高,MDR-TB患者中氧氟沙星耐药情况较严重,需加强结核患者的早期发现和用药管理。 文艳苹 刘伟 吴琍敏 王乐 陆敏关键词:结核分枝杆菌 氧氟沙星 GYRA基因突变 杭州地区2014—2019年乙型流感病毒HA和NA基因遗传进化分析 被引量:8 2020年 目的研究2014—2019年杭州地区乙型流感病毒的流行情况以及血凝素基因(HA)和神经氨酸酶基因(NA)的遗传进化特征。方法收集2014年10月—2019年9月间杭州地区流感样病例10481例,用实时RT-PCR法检测乙型流感病毒,同时选取部分乙型流感病毒阳性样本,用特异性引物扩增HA和NA基因,进行基因测序并分析其遗传进化特征。结果发现自2014年以来,杭州地区每年都有乙型流感病毒的流行。其中5~14岁年龄段人群发病率最高。2014—2019年,杭州地区流行的Victoria系乙型流感病毒都属于V1A进化簇,而Yamagata系乙型流感病毒都属于Y3进化簇。HA和NA基因的序列一致性分别为94.67%~100.00%和97.13%~100.00%,并在多个抗原位点发生了改变,同时出现了重排株。结论乙型流感病毒在杭州地区流感流行中影响显著。2014—2019年,杭州地区乙型流感病毒出现了抗原变异和基因重排,流行株和疫苗株之间存在不匹配的情况,但目前并未发现耐药株的出现和流行。 钱昕 于新芬 李钧 周银燕 文艳苹关键词:乙型流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 遗传进化 沙门菌H抗原的xTAG法鉴定 被引量:4 2016年 目的利用Luminex xTAG技术,建立能高通量鉴别沙门菌H抗原的xTAG悬浮芯片法,用于沙门菌的血清型别鉴定。方法以沙门菌编码H抗原的fliC和fljB基因为目标基因,选取其保守片段设计上游通用引物,选取可变片段设计下游特异性引物;合成时上游引物的5′端用生物素标记,下游引物的5′端连接特定的TAG序列;标本经多重PCR扩增并标记生物素和TAG序列后,与含anti-TAG序列的编码磁珠混合液杂交分型,通过生物素与链霉亲和素-藻红蛋白的反应报告结果。利用建立的xTAG悬浮芯片法鉴定145株沙门菌日常分离株的H抗原,并与传统的血清凝集试验比较。结果31种沙门菌H抗原经多重PCR扩增后,与xTAG磁珠杂交后可鉴别分型,各H抗原间无交叉反应,且重复性良好,与大肠埃希菌、霍乱弧菌、副溶血性弧菌及志贺菌DNA等亦无交叉反应。对145株沙门菌进行H抗原鉴定,与传统的血清凝集试验比较,其敏感度为95.1%,特异度为100%。结论利用xTAG悬浮芯片法鉴定沙门菌H抗原,特异准确,可在4~5 h内完成90多株常见血清型沙门菌的H抗原鉴定。 郑之北 郑伟 濮小英 文艳苹 潘劲草 汪皓秋关键词:沙门菌 H抗原 多位点序列分型和脉冲场凝胶电泳技术在肠炎沙门菌暴发事件病原学鉴定中的应用 被引量:1 2015年 目的探讨脉冲场凝胶电泳(pulse-field gel electrophoresis,PFGE)和多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术在沙门菌鉴定中的应用价值。方法对分离自一起食物中毒事件中的27株沙门菌,用肠杆菌科鉴定系统API 20E和ATB ID 32E进行生化鉴定并血清分型,以脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)进行分子分型。结果 27株沙门菌的生化鉴定结果为沙门菌属细菌,其中25株血清分型结果为肠炎沙门菌,抗原模式(9,12:g,m);其余两株菌H相抗原除g和m因子凝集阳性外,d因子也有凝集反应。PFGE结果显示27株菌株中26株的带型完全一致,另1株与其他26株仅有1条条带的差异,相似度为96.3%。27株菌的MLST型别均为ST11型,提示为肠炎沙门菌。结论分子分型技术,特别是MLST技术有助于沙门菌的辅助鉴定。 郑伟 汪皓秋 张蔚 俞骅 文艳苹 郑之北 潘劲草关键词:多位点序列分型 杭州地区儿童急性呼吸道人类偏肺病毒感染状况及病原特征初步研究 目的:了解杭州地区儿童急性呼吸道感染(ARI)病例中,人类偏肺病毒(hMPV)感染状况及病原特征。方法:采集杭州地区各医院14岁以下儿童急性呼吸道感染样本,用逆转录聚合酶链反应(RT—PCR)扩增hMPV的核蛋白(N)基... 寇宇 于新芬 潘劲草 李钧 文艳苹 周银燕关键词:儿科疾病 急性呼吸道感染 人类偏肺病毒 病原特征 文献传递 杭州市急性呼吸道感染儿童中WU多瘤病毒感染的流行病学及基因特征分析 被引量:1 2015年 目的了解杭州市急性呼吸道感染儿童中WU多瘤病毒(WU polyomavirus,WUPy V)流行特征和基因型别。方法收集2011年3月至2013年6月间至浙江省儿童医院就诊的急性呼吸道感染患儿的鼻咽吸取物,用聚合酶链反应(PCR)法扩增VP2编码基因和VP2/1中间序列,测序后进行分型。选取代表性病毒株进行基因组测序。结果收集的722份标本中,10份为WUPy V阳性,检出率为1.4%。WUPy V感染主要发生在夏季、秋季和冬季。患儿平均年龄为13.6月龄,男女性别比为9∶1,性别差异无统计学意义(P=0.09)。WUPy V感染所致疾病为肺炎、喉炎和细支气管炎。WUPy V基因型别为Ⅰa型。代表性毒株HZ13024的基因组大小为5229 bp,与Gen Bank中WUPy V基因组序列相似性为99.8%~99.9%。结论杭州市儿童急性呼吸系统疾病中存在WUPy V感染,感染率较我国其他地区低,基因型别为Ⅰa型。 文艳苹 于新芬 周银燕 寇宇 郑伟 郑之北关键词:WU多瘤病毒 流行病学 Luminex液相芯片杂交影响因素探讨 被引量:4 2017年 目的探讨微珠用量和链霉亲和素-藻红蛋白(SAPE)对Luminex液相芯片杂交结果的影响,并进一步优化杂交条件。方法以鼠伤寒沙门菌过夜培养物原液和107cfu/ml、103cfu/ml菌液为待测物,经多重PCR扩增并标记后,与不同体积微珠混合液和不同浓度SAPE杂交,比较不同杂交条件下的中位荧光强度(median fluorescence intensity,MFI);在此基础上,选择不同用量多重PCR产物、不同杂交温度和时间进行测试,比较其MFI。结果 MFI并不随着微珠用量增加而增强,1 000个每种微珠每反应,即可满足杂交需要;SAPE浓度直接影响样品和背景MFI,当SAPE浓度为5.0μg/ml时,杂交结果较为理想,其杂交信号MFI稳定,且背景信号较低;过量的PCR产物并不利于杂交反应,且应选择最佳杂交温度和时间,5.0μl是较为理想的PCR产物用量,42℃杂交25 min是较为理想的杂交条件。结论为优化Luminex液相芯片杂交,选择适当的微珠用量、SAPE浓度、PCR产物用量及杂交温度和时间是非常必要的。 郑之北 郑伟 汪皓秋 潘劲草 文艳苹关键词:液相芯片 杂交 影响因素 2009-2011年杭州地区儿童人类偏肺病毒感染状况及病原特征分析 被引量:5 2013年 目的了解杭州地区儿童急性呼吸道感染病例中人类偏肺病毒(hMPV)感染状况及病原特征。方法选取2009年11月至2010年1月、2010年11月至2011年1月杭州3家医院儿科门诊、重症监护室14岁以下急性呼吸道感染患儿372例作为研究对象,采集其咽拭子351份、鼻咽吸取物9份、气管吸取物8份、痰液4份,共372份标本。提取总核酸,用RT—PCR扩增hMPV的核蛋白(N)基因片段,取扩增阳性产物进行基因测序和序列分析,扩增阳性的标本用非洲绿猴肾细胞(Vero—E6)培养hMPV,同时,用荧光定量RT-PCR方法检测呼吸道其他病毒共感染情况。结果372份患儿标本检测hMPV的N基因阳性42份,检出率为11.2%。男性患儿hMPV阳性率为11.5%(26/226),女性患儿为10.9%(16/146),差异无统计学意义(X。=0.026,P〉0.05)。感染患儿年龄最小2个月,最大14岁,发病年龄中位数为24个月。取15份RT—PCR扩增阳性产物进行基因序列分析,结果均为B1亚型,与广东株GD165相似度为98.1%~99.5%,与北京株BJ1897相似度为87.8%~89.2%。hMPV与其他呼吸道病毒共同感染率为45.2%(19/42),其中与呼吸道合胞病毒共同感染检出率最高,为26.1%(11/42)。结论杭州地区部分儿童的急性呼吸道感染与hMPV有关,hMPV为单一基因型,与其他呼吸道病毒存在共同感染的现象。 寇宇 于新芬 潘劲草 李钧 文艳苹 周银燕关键词:儿童 呼吸道感染 变性肺病毒 基因 杭州市2019年登革病毒分子流行病学研究 2021年 目的了解2019年杭州市登革病毒分子特征和可能的传播来源。方法收集登革热患者血清样本,分析登革热流行特征。分别采用ELISA和RT-PCR方法检测登革热抗体、登革病毒核酸及其型别,再对核酸阳性样本进行E基因扩增、序列测定和进化分析。结果2019年杭州共检测登革热病例212例(输入性病例158例,本地病例54例),其中65例IgM抗体检测阳性,178例DENV通用型核酸检测阳性。输入性病例中4种血清型登革病毒均有检出,以DENV-1为主(占51.9%)。本地病例多由DENV-1基因I型(6/54)、IV型(26/54)和DENV-2 Cosmopolitan基因型(2/54)病毒引起,E基因序列分别与2019年广州和南昌流行株、2015年菲律宾株和2018年泰国株同源性较高。其中DENV-1基因IV型本地流行病毒的E基因序列高度同源,序列相似性高达99.9%~100%,推测为多起输入性病例引起的本地传播。结论受东南亚登革热疫情影响,杭州2019年登革热病例数量增幅明显,呈型别多样化、本地病例溯源复杂的特点,需进一步加强DENV分子特征研究。 文艳苹 汪皓秋 于新芬 张国忠 周银燕 钱昕关键词:登革热 登革病毒 分子流行病学