李亚康
- 作品数:4 被引量:31H指数:2
- 供职机构:中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 基于DNA条形码的百合属分子鉴定
- 目的:运用DNA条形码技术为鉴别百合属植物提供新方法.
方法:本文通过实验,并结合GenBank数据库序列,分析ITS、ITS2、psbA-trnH、matK、rbcL五条常用条形码共978条序列在种内与种间变...
- 郑司浩李亚康任伟光黄林芳
- 关键词:百合属植物分子鉴定
- 文献传递
- 基于DNA条形码的百合属分子鉴定被引量:14
- 2014年
- 本文通过实验,并结合Gen Bank数据库序列,分析ITS、ITS2、psb A-trn H、mat K、rbc L 5条常用条形码共978条序列在种内与种间变异、barcoding gap、系统发育树等方面对百合属植物的鉴别能力,并采用最近距离法(nearest distance)和相似性搜索算法(BLAST1)评价5条序列的鉴定成功率。研究结果显示,不同条形码序列可以较好的鉴别百合属内不同物种。ITS序列鉴定成功率较高,种内种间差异显著,系统发育树可以很好地将不同物种分开。结果表明DNA条形码技术可以准确地鉴别百合属植物,ITS序列可以作为鉴别百合属不同物种的优选序列。
- 郑司浩李亚康任伟光黄林芳
- 关键词:百合属DNA条形码分子鉴别ITS
- 中药材威灵仙及其伪品DNA条形码鉴别研究被引量:18
- 2014年
- 利用DNA条形码技术对中药威灵仙及其伪品进行鉴别,为威灵仙分子鉴定提供更多依据与参考。本实验利用psbA-trnH序列对来自3个属10个物种的72份威灵仙及其伪品样本进行扩增测序,结合GenBank数据库中7个属21个物种的284条序列,分析ITS、ITS2、psbA-trnH、rbcL、matK各序列种内与种间变异、遗传距离、barcoding gap,并采用最近距离法(nearest distance)和相似性搜索算法(BLAST1)评价5条序列的鉴定成功率。结果显示psbA-trnH序列在两种DNA序列鉴别评价方法中的效率均较高,且该序列种间变异较大,在barcoding gap检验中,其序列重叠区较少,种间与种内变异分布呈两边分开的趋势,NJ树分析可将各物种分开,差异显著。综合鉴别效率和扩增成功率,推荐使用psbA-trnH序列作为威灵仙药材及其伪品的鉴别序列。
- 冯杉杉郑司浩李亚康黄林芳
- 关键词:威灵仙伪品DNA条形码分子鉴别PSBA-TRNH
- 基于DNA条形码的百合属分子鉴定
- 目的运用DNA条形码技术为鉴别百合属植物提供新方法。方法本文通过实验,并结合Gen Bank数据库序列,分析ITS、ITS2、psb A-trn H、mat K、rbc L五条常用条形码共978条序列在种内与种间变异、b...
- 郑司浩李亚康任伟光黄林芳
- 关键词:百合属DNA条形码分子鉴别ITS
- 文献传递