杨频
- 作品数：4 被引量：66H指数：3
- 供职机构：华东师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市卫生系统百名跨世纪优秀学科带头人培养计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 罗氏沼虾三群体线粒体D-loop基因序列差异的初步研究被引量：14
- 2007年
- 通过测定罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)人工养殖群体(A)(浙江湖州)、缅甸引进群体F2代(B)和"南太湖1号"(C)3个群体线粒体控制区(D-loop)基因序列片段(约1200bp),探讨罗氏沼虾群体遗传结构。结果发现,在用于分析的1121 bp基因序列中有86个变异位点,共计14个单倍型。其中,群体A、C的遗传多样性均较低,其π值分别为0.022和0.025,相比之下,群体B的遗传多样性则明显要高于上述两个群体(π=0.032)。AMOVA分析表明,群体间的遗传变异占总遗传变异的6.32%,而93.68%的遗传变异源于群体内。对三群体的遗传学参数计算结果表明,群体A和B间遗传分化指数(Fst)为0.105,已达到中等分化水平;群体C与A间的遗传距离(D=0.025)最小,提示它们的亲缘关系最近。本研究结果认为,D-loop基因可以作为检测罗氏沼虾群体遗传差异的分子标记,"南太湖1号"群体遗传多样性比人工养殖群体有所提高,但仍偏向养殖群体,未表现出最高的杂种优势。
- 姚茜杨频陈立侨郭慧张浩禹娜杨国梁王军毅
- 关键词：罗氏沼虾遗传多态性杂种优势
- 中国沼虾属分子系统学及日本沼虾群体遗传结构的研究
- 沼虾属Macrobrachium是一类生存环境多样，起源与分化过程尚不甚明了，分类地位具争议性的动物类群。众多学者在分类方面已做了大量的研究，然而由于其鉴别特征的保守性及形态性状多态性丰富等特点，导致了沼虾属种类鉴定的困...
- 杨频
- 关键词：沼虾属日本沼虾群体遗传结构支序系统学
- 日本沼虾遗传多样性的ISSR分析(英文)被引量：17
- 2010年
- 日本沼虾(Macrobrachium nipponense)是中国分布范围广、经济价值较大的一种重要淡水虾类。随着养殖规模的不断扩大,如何保持养殖群体的遗传品质已引起了人们的重视。但迄今为止,养殖的日本沼虾均来自未经系统遗传选育的野生群体,而养殖病害的日趋严重和养成规格、品质的下降已严重影响到日本沼虾养殖产业的健康发展。研究野生群体的遗传结构和遗传分化,揭示其遗传多样性是制定合理有效的保护和管理策略的前提和基础。ISS(RInter-simple sequence repeats,简单重复序列中间区域)标记技术具有实验重复性好、信息量大、多态性高等优点,是一种理想的检测群体遗传变异的分子标记。因此,本研究应用ISSR标记技术对日本沼虾5个地理群体进行了初步的遗传分析,以期为合理开发和利用日本沼虾天然资源,以及建立和保护日本沼虾种质资源库及基因库提供理论依据。本研究对采自江苏苏州、江西南昌、云南西双版纳、湖北宜都和新疆博湖的5个地理群体进行了初步研究。从50个ISSR引物中筛选出9个条带清晰、稳定性和重复性好,且产生相对较多条带的引物用于全部DNA样品的PCR扩增。对日本沼虾5个地理群体的群体遗传分析表明,在所有检测到的清晰且可重复的142个有效位点中,多态位点有138个。物种水平上,多态位点百分率(PPL)、等位基因数(No)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I)分别为97.18%、1.972、0.312、0.120和0.323。而在群体水平上,5个地理群体的多态位点百分率为29.58%～61.97%;等位基因数(No)为1.296～1.620;有效等位基因数(Ne)为1.165～1.281;Nei’s基因多样性指数(H)为0.098～0.172;Shannon信息指数(I)为0.147～0.267。从各个地理群体看,江西南昌群体的遗传多样性最高(PPB:61.97%,No:1.620,Ne:1.281,H:0.172,I:0.267),而湖北宜都群体最低(PPB:29.58%,No:1.296,Ne:
- 杨频陈立侨王伟禹娜禹娜宋大祥
- 关键词：日本沼虾ISSR
- 利用COI基因序列分析长江与澜沧江水系日本沼虾群体的遗传结构(英文)被引量：37
- 2007年
- 测定了我国长江水系和澜沧江水系的日本沼虾9个群体,共79个个体的线粒体COI基因序列片段(约450bp),结果发现有89个变异位点,共计有46个单倍型。其中云南昆明(KM)群体具有较丰富的遗传多样性(h=1.000,π=0.028),而重庆(CQ)群体的遗传多样性最小(h=0.700,π=0.008)。AMOVA分析表明,群体间的遗传变异占总遗传变异的9.66%,而90.34%的遗传变异源于群体内。采用邻接法(NJ)构建的分子系统树显示,46个单倍型明显地聚为长江中下游和长江上游与澜沧江两个族群。其结果可以为合理开发和利用日本沼虾自然野生资源,以及建立和保护日本沼虾种质资源库及基因库提供必要的参考。
- 杨频张浩陈立侨叶金云禹娜顾志敏宋大祥
- 关键词：日本沼虾COI基因单倍型
