梁莹
- 作品数：28 被引量：74H指数：6
- 供职机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项卫生部卫生公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学轻工技术与工程化学工程更多>>
- 4种鼠疫F1抗原/抗体检测方法的初步评价被引量：8
- 2010年
- 目的客观评价血凝试验、胶体金试验、ELISA和PCR4种检测方法的灵敏性。方法对于血清学方法中的F1抗体检测,评价检出的全菌免疫兔抗血清最低稀释度;F1抗原检测,评价检出的最低浓度。对于分子生物学方法,评价同时检出fra基因和pla基因的模板最低浓度。结果对于F1抗体检测,间接血凝试验检出的最低稀释度是1∶64,胶体金试验是1∶1000,ELISA是1∶204800。对于F1抗原检测,反向血凝试验检出的最低浓度是2ng/ml,胶体金试验是50ng/ml。fra、pla基因同时检出,模板的最低浓度是0.21ng/μl。结论在以抗体IgG为主的血清中,ELISA法对于F1抗体检测的灵敏性较高。反向间接血凝试验对于F1抗原检测的灵敏性较高。为减少误诊率,采用PCR诊断鼠疫菌要求最低模板浓度是0.21ng/μl。
- 王艳华海荣夏连续蔡虹梁莹俞东征
- 关键词：鼠疫耶尔森菌血凝试验酶联免疫吸附试验聚合酶链反应
- 云南玉龙与青藏高原鼠疫菌差异序列的比对研究被引量：2
- 2019年
- 目的观察云南玉龙鼠疫菌株D106004和青藏高原鼠疫菌株Z176003在基因组上的差异及遗传学特征。方法应用BLAST软件,将鼠疫D106004和Z176003菌株编码序列(CDS)进行差异比对。选取22个差异CDS,设计相应引物22对,在来源不同(青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和云南齐氏姬鼠、大绒鼠鼠疫自然疫源地)、时间跨度约50年、分布地区包括西藏、青海、四川、甘肃、云南的6种生态型119株鼠疫代表性菌株进行PCR扩增,并将PCR产物测序验证。菌株均来自中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室。结果119株鼠疫代表性菌株的22个差异CDS,PCR扩增产物实际测序结果累计序列长度为2.13 × 10^6 bp;差异CDS在云南玉龙D106004与青藏高原Z176003菌株所属疫源地内119株鼠疫代表性菌株中同源性较高,78.2%(2 047/2 618)序列不存在差异,21.8%(571/2 618)序列上存在缺失、错义、移码3类基因突变差异。差异特征在疫源地6种生态型鼠疫菌株中稳定存在,呈现6种不同的地理分布。结论云南玉龙D106004和青藏高原Z176003菌株,二者同源性较高,亲缘关系相近,基因组上存在的差异较小,但不同生态型菌株的遗传性特征稳定存在.
- 王梅唐新元海荣俞东征梁莹张恩民张志凯申小娜李伟
- 关键词：自然疫源地
- 云南省鼠疫耶尔森菌多位点可变数目串联重复序列分析被引量：12
- 2013年
- 目的通过多位点可变数目串联重复序列分析(multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis,MLVA)方法,对云南省鼠疫菌株进行基因分型。方法采用聚合酶链反应(PCR)和毛细管电泳,通过BioNumerics软件进行处理,分析云南省158株鼠疫耶尔森菌基因型。结果选取鼠疫菌的14个VNTR位点,5个VNTR位点对云南省鼠疫菌具有多态性分析意义,利用这5个位点对云南菌株进行分析,云南158株鼠疫菌可分为2个群,3个簇,5个基因型,野鼠鼠疫菌属于A簇,丽江玉龙鼠疫菌属于B簇,家鼠鼠疫菌属于C簇,与传统的生态分型结果吻合。结论本次试验筛选的5个位点可以用于云南省鼠疫菌的分型,云南家鼠鼠疫菌、野鼠鼠疫菌及玉龙鼠疫菌分属不同的基因簇,玉龙鼠疫菌与野鼠鼠疫菌同属一个群,聚类结果与实际的地理相关性很好。
- 朱俊洁王鹏张蓉海荣梁莹宋志忠
- 关键词：鼠疫耶尔森菌基因型
- 初步研究我国土拉菌的亚种及遗传进化关系被引量：3
- 2011年
- 目的研究我国土拉弗朗西斯菌(土拉菌)亚种类型及各菌株之间的遗传进化关系。方法对于来源于我国北方地区的10株土拉菌,采用2种型特异引物C1C4和RD1进行PCR,根据扩增产物片段长度来判断所属亚种;同时,使用fopA、tul4和16SrRNA引物,进行3种特异基因的PCR,然后测序;这10株土拉菌及网上已公布基因组序列的3株B型土拉菌、1株subsp.novicida,应用MEGA4软件,进行3种特异基因为基础的系统进化分析。结果采用2种型特异引物C1C4和RD1,鉴定10株土拉菌均为B型亚种;根据MEGA4构建的进化树,我国10株土拉菌可以分为2种基因型,410108、410109和410111为B1型,另外7株土拉菌为B2型;而国外的3株B型土拉菌归为B3型。结论我国北方地区分离的土拉菌可能以B型为主,对于土拉菌B型亚种的起源,我国土拉菌可能早于欧美国家。3种基因为基础的系统进化分析可作为土拉菌基因分型的一种可靠方法。
- 王艳华海荣张志凯夏连续蔡虹梁莹申小娜俞东征
- 关键词：土拉弗朗西斯菌系统进化分析基因型聚合酶链反应
- 鼠疫菌素抗体检测方法的应用研究
- 2013年
- 目的检测宿主动物血清中鼠疫菌素(Pesticin,Pst)抗体,探究Pst作为鼠疫抗体检测诊断试剂的可能性。方法采用重组Pst和鼠疫F1抗体间接ELISA法,对351份不同来源的鼠疫宿主动物血清样本进行检测。结果在鼠疫感染的宿主动物体内可以检测到Pst抗体,Pst抗体水平随着F1抗体水平的升高而明显升高,鼠疫患者血清中20个月时ELISA检测A值为0.438,Pst抗体维持在可检出水平。结论 Pst抗体检测方法可以与传统鼠疫F1抗体检测相结合,使鼠疫抗体检测方法更具可靠性。
- 王梅唐新元张爱萍梁莹于守鸿杨永海俞东征海荣
- 关键词：血清抗体宿主动物
- 内蒙古鼠疫耶尔森菌差异区段分型特征研究被引量：1
- 2016年
- 目的研究分离自内蒙古不同鼠疫疫源地、不同宿主和媒介的鼠疫耶尔森菌的差异区段基因型分布特征。方法选取内蒙古3个鼠疫疫源地分离的鼠疫耶尔森菌307株,采用差异区段分析法,设计24对引物进行DFR位点扩增分型,用Bio Numerics软件分析。结果通过差异区段分型方法共发现13种基因型,其中5种基因型（Gnm1-Gnm5）为本研究首次报道。长爪沙鼠疫源地有9种基因型,主要基因型为G11（71.8%,122/170）;达乌尔黄鼠疫源地有6种基因型,主要为G10（44.1%,41/93）和G11（35.5%,33/93）;布氏田鼠疫源地有4种基因型,主要为G14（90.9%,40/44）。3个疫源地均分布有G11型。结论内蒙古鼠疫耶尔森菌差异区段基因型分布具有明显的地理分布特征,对分析内蒙古鼠疫的传播和遗传演变具有重要的分子流行病学意义。
- 蒋羽李建云梁莹蔡虹彭遥王宇萌刘芳徐冬蕾王姝懿张志凯海荣张忠兵李伟范蒙光
- 关键词：鼠疫耶尔森菌分子流行病学
- 我国鼠疫耶尔森菌单核苷酸多态性特征研究被引量：1
- 2012年
- 目的了解我国不同鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌的单核苷酸多态性（SNP）特征。方法利用Mummer程序对已知全基因组序列的9株鼠疫菌进行全基因组比对，选择其中的13个基因片段（19个SNP位点）在国内133株鼠疫菌中进行PCR扩增、测序，并对序列进行UPGMA聚类分析。结果全基因组比对共筛查出3780处序列差异位点。通过对不同SNP位点组合的聚类分析发现我国鼠疫菌具有明显的地理区域性和生态型聚集性特征。结论SNP作为一种比较稳定的遗传标记，可以较好地反映我国不同鼠疫自然疫源地耶尔森鼠疫菌的基因组特征。
- 王娜申小娜俞东征夏连续魏建春蔡虹徐冬蕾陈晨崔志刚梁莹徐大琴雒涛海荣
- 关键词：聚类分析
- 青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫耶尔森菌遗传特征分析被引量：2
- 2018年
- 目的研究青藏高原喜马拉雅鼠疫疫源地那曲和比如地区鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)菌株的分子分型特征,确定具有该分型特征的鼠疫菌在青藏高原鼠疫疫源地的分布情况。方法应用板块重排、差异区段分析、间区规律短回文重复、多位点可变数目串联重复序列分析方法对分离自青藏高原地区、四川省、云南省的98株鼠疫菌进行分析。结果那曲和比如地区的鼠疫菌菌株中第57~60板块的排列方式与测序菌株Z176003一致,在其他实验菌株中未发现该重排特征。结论分离自那曲和比如的鼠疫菌菌株具有独特的分子分型特征,该特征在本地区的菌株中普遍存在,且菌株多态性持续分化。
- 王宇萌梁莹张恩民马娜申小娜蔡虹张志凯夏连续梁未丽代瑞霞李伟
- 关键词：鼠疫耶尔森菌青藏高原
- 2013-2021年气象因素及其交互作用对内蒙古自治区鄂尔多斯市鼠密度的影响
- 2024年
- 目的了解气象因素单独及其交互作用对内蒙古自治区鄂尔多斯市鼠密度的影响。方法收集2013-2021年鄂尔多斯市鼠密度资料,采用广义相加模型分析气象因素单独作用及交互作用对鼠密度的影响。结果鄂尔多斯市鼠密度总体呈逐年下降趋势。鼠密度与滞后2月的月平均气温、月平均气压呈非线性关系,与当月的平均日照时数呈线性关系。子午沙鼠密度与月平均气温呈非线性关系,随着温度升高呈波动下降趋势,在约12℃时鼠密度出现1个小高峰,而在18℃左右时达到最低谷,随后迅速上升;鼠密度随月平均气压的升高而呈先升高后降低的趋势,约864 hPa达到峰值;月平均日照时数对子午沙鼠密度呈现正向的线性关系。滞后2月的月平均气温与同期月累计降水量和当月的平均日照时数均有一定的交互作用,滞后2月的适宜温度(约12℃)下强降水和当月短平均月日照时数有利于子午沙鼠密度升高。结论月平均日照时数、月平均气温及月平均气压对子午沙鼠密度呈线性及非线性影响,各气象因素间有一定的交互作用。
- 尚猛王璐姜宛均王晓旭冀好强梁莹刘起勇
- 关键词：鼠密度子午沙鼠气象因素
- 鼠疫菌3种常见质粒的结构特征分析被引量：3
- 2015年
- 目的研究鼠疫菌基因组中3种常见质粒的基因构成和分布特征。方法应用编码基因序列相似性比对和生物信息学软件自动分析2种方法,分别对国际上已完成全基因组测序的9株鼠疫菌的鼠毒素质粒(pMT1)、低钙反应质粒(pCD1)和鼠疫菌素质粒(pPCP1)进行整体结构的比较分析。结果 pMT1质粒上存在基因大片段的重新排列,整条质粒被划分成4个主要的基因模块。CO92、KIM和91001菌株分属于东方型、中世纪型和田鼠型3个不同的生物型,他们的p MT1质粒结构各有特点;Nepal 516等其余6株菌均是古典型鼠疫菌,他们的pMT1质粒结构基本一致,且与其他3个生物型鼠疫菌株的p MT1质粒结构不同。pCD1质粒被划分成3个主要的基因模块,但整体结构在不同菌株中并无差异,只有IS100在质粒中的插入位置各不相同。pPCP1质粒上所有编码基因的排列顺序和方向在各菌株中完全相同。结论鼠疫菌pCD1和pPCP1质粒的基因结构比较稳定,而pMT1质粒结构在鼠疫菌的长期进化过程中发生了一定程度的变异。
- 梁莹海荣蔡虹
- 关键词：鼠疫耶尔森菌质粒
