王玥
- 作品数：16 被引量：21H指数：2
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- 玉米大斑病菌水甘油通道蛋白基因StFPS1的功能研究
- 玉米大斑病是目前玉米生产上的重要叶部病害,据报道,种植感病品种在流行年份减产可达50%。玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)变异十分频繁、生理分化尤其明显,一旦其抗病品种丧失了抗性,就会直接威胁玉米产...
- 张盼王玥薛韶娜杨晓荣巩校东谷守芹董金皋
- 关键词：玉米大斑病菌
- 文献传递
- 玉米大斑病菌水甘油通道蛋白基因StFPS1的功能研究
- 玉米大斑病是目前玉米生产上的重要叶部病害，据报道，种植感病品种在流行年份减产可达50％。玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)变异十分频繁、生理分化尤其明显，一旦其抗病品种丧失了抗性，就会直接威胁玉米产...
- 张盼王玥薛韶娜杨晓荣巩校东谷守芹董金皋
- 关键词：玉米大斑病菌
- 玉米大斑病菌MAPK超家族的全基因组鉴定及途径模型建立被引量：15
- 2014年
- 【目的】从全基因组水平鉴定玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)的MAPK超家族基因,并对其进行系统进化、基因结构、多重序列比对及保守位点分析,构建玉米大斑病菌中的MAPK级联途径模型,为深入研究该植物病原菌中MAPK级联途径的功能奠定基础。【方法】利用玉米大斑病菌基因组数据库,通过基于隐马尔科夫模型的HMMER 3.0软件搜索基因组,鉴定并获得MAPK超家族成员序列、基因组定位信息;采用MEGA 5.0软件进行系统进化分析;通过GSDS工具进行基因结构分析;利用ClustalX、MEME工具分析MAPK蛋白激酶区的保守性及保守位点。【结果】在玉米大斑病菌基因组中发现了4个MAPK基因、3个MAPKK基因和3个MAPKKK基因。系统进化分析将MAPK分为Kss1/Fus3、Slt2、Hog1及Ime2 4类;MAPKK分为Pbs2、Ste7及Mkk1 3类;MAPKKK分为Ste11、Bck1及Ssk2 3类。基因组定位及基因结构分析表明,MAPK超家族散布在基因组中,且MAPK基因的结构最为复杂多样,MAPKK次之,MAPKKK结构最简单。多重序列比对与保守位点分析表明,玉米大斑病菌MAPK超家族的激酶结构域均高度保守,其中MAPK具有保守的"-TxY-"磷酸化位点,MAPKK含有保守的"-SD[V/I]WS-"磷酸化位点,MAPKKK含有"-G[S/T][V/P][F/M][W/Y]M[A/S]PEV-"特异性保守位点。【结论】全基因组分析表明,玉米大斑病菌中包括4个MAPK基因、3个MAPKK基因和3个MAPKKK基因。通过系统进化、基因结构及多重序列比对和保守位点分析,在玉米大斑病菌中构建了Fus3/Kss1-homolog、Slt2-homolog、Hog1-homolog和Ime2-homolog4条MAPK级联途径,其中Ime2 homolog为一条新发现的MAPK级联途径。该信息为深入解析植物病原真菌MAPK超家族的功能奠定了基础。
- 巩校东张晓玉田兰王星懿李坡张盼王玥范永山韩建民谷守芹董金皋
- 关键词：玉米大斑病菌系统进化
- 玉米大斑病菌Homeobox基因家族的全基因组鉴定与转录因子StSte12的关系研究
- 本实验室已经克隆了玉米大斑病菌Fus3/Kss l-homolog途径下游的转录因子基因StSTE12，生物信息学方法分析发现它具有转录因子所特有的STE homeodomain与ZnF_C2H2锌指结构，同时采用RNA...
- 王玥
- 关键词：玉米大斑病菌转录因子
- 三种病原微生物必需基因的生物信息学分析
- 巩校东贾慧曹志艳董金皋谷守芹赵洁马兰王玥
- 该课题首次发现了CpG二核苷酸在人、猪及禽类H1N1流感病毒(H1N1 Influenza Virus)的聚合酶片段中均被强烈抑制，且CpG抑制作用是制约同义密码子使用频率的一个重要因素；该项目明确了大肠杆菌的必要基因比...
- 关键词：
- 关键词：玉米大斑病菌生物信息学
- 玉米大斑病菌转录因子StSTE12基因的结构分析及其可能调控的靶基因筛选
- 玉米大斑病是世界各地玉米产区严重威胁玉米生产的一种真菌性病害,该病直接影响玉米的产量和品质,常造成严重的经济损失。引起玉米大斑病的病原菌为玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica),该病菌的致病过程包括病菌...
- 王玥张盼马兰唐聪巩校东谷守芹韩建民董金皋
- 关键词：玉米大斑病菌转录因子靶基因
- 文献传递
- 玉米大斑病菌水甘油通道基因StFPS1的RNAi载体构建
- 玉米大斑病(Northern Leaf Blight of Com)是威胁玉米生产的一个重要的叶部真菌病害，在流行年份常造成重大的经济损失.引起该病害的病原菌为丝状病原真菌，其无性态为大斑凸脐蠕孢(Exserohilum...
- 张晓玉田兰王玥张盼谷守芹韩建民董金皋
- 关键词：玉米大斑病菌RNAI
- 玉米大斑病菌水甘油通道蛋白基因StFPS1超表达载体的构建
- 玉米大斑病(Northern Leaf Blight of Corn)是玉米上的重要叶部病害,在我国东华北、西北和南方山区的冷凉玉米产区较易流行,严重年份感病品种减产可达50％。引起玉米大斑病的致病菌为玉米大斑病菌(Se...
- 田兰张晓玉张盼王玥谷守芹董金皋
- 关键词：玉米大斑病菌超表达
- 玉米大斑病菌Homeobox转录因子家族的生物信息学分析
- 玉米大斑病(Northern corn leaf blight),是由玉米大斑病菌引起的一种严重的真菌性病害,该病害在全球范围内普遍严重发生并造成玉米产量严重损失。Homeobox基因是一类转录调控因子,在植物病菌生长发...
- 巩校东马兰王玥赵洁谷守芹董金皋
- 关键词：玉米大斑病菌HOMEOBOX基因家族
- 文献传递
- 一个新的玉米大斑病菌蛋白激酶基因StPA1参与调控其细胞壁发育和致病性
- 玉米大斑病是由玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)引起的重要的玉米叶部病害，在严重流行年份可使产量减产达50％以上.立足于分析病原菌致病性的调控机制，探讨更加有效的防治措施已成为目前研究的热点.本课题...
- 张盼王玥谷守芹董金皋
- 关键词：玉米大斑病菌细胞壁
